2024/04/08 更新

写真a

アサダ　トシオ
麻田　俊雄
Asada Toshio
担当
大学院理学研究科 化学専攻 教授
理学部 化学科
職名
教授
所属
理学研究院
連絡先
メールアドレス
ホームページ
http://fock2.c.s.osakafu-u.ac.jp/~asada
所属キャンパス
杉本キャンパス

担当・職階

  • 大学院理学研究科 化学専攻 

    教授  2022年04月 - 継続中

  • 理学部 化学科 

    教授  2022年04月 - 継続中

取得学位

  • 博士(理学) （ 大阪市立大学 ）

研究分野

  • ナノテク・材料 / 生体化学  / 生体関連化学

  • ナノテク・材料 / 機能物性化学  / 機能物質化学

  • ナノテク・材料 / 基礎物理化学  / 物理化学

研究キーワード

  • 分子シミュレーション、有機EL、ホール移動度

  • 分子シミュレーション、生体分子、反応自由エネルギープロファイル

  • 分子軌道法、量子化学

  • 酵素反応

  • 計算化学

  • 自由エネルギー面上の反応経路

  • 分子クラスター

  • アモルファス層中の電荷移動度

研究概要

  • 自由エネルギー面上の効率的な反応経路最適化に関する研究

  • 酵素中における基質の反応機構に関する理論的研究

  • 有機EL材料のホール輸送層シミュレーションと機械学習の活用

  • 有機EL材料を含むホスト/ゲスト複合体に関する理論的アプローチ

研究歴

  • 自由エネルギー解析

    自由エネルギー面上の反応経路の理論的解析、QM/MM法、Free Energy Gradient、Charge and Atomic Dipole Response Kernel、Reaction Path Optimization  個人研究

    2011年04月 - 継続中 

  • アモルファス構造中の電荷移動度の理論的解析

    有機EL材料、Successive Conduction モデル、蛍光、燐光スペクトル、電荷移動度、Marcus 理論  機関内共同研究

    2011年04月 - 継続中 

  • たんぱく質分子の理論的解析

    人工光合成、ホストゲスト科学  個人研究

    2000年04月 - 継続中 

所属学協会

  • 理論化学会

    2019年06月 - 継続中   国内

  • 分子科学会

    2006年10月 - 継続中   国内

  • 日本コンピュータ化学会

    1991年04月 - 継続中

  • 日本化学会

    1990年12月 - 継続中

  • 分子科学会

委員歴（学外）

  • 専門調査員   文部科学省 科学技術・学術政策研究所  

    2024年04月 - 継続中 

受賞歴

  • Journal of Physical Chemistry A Presentation Award

    Toshio Asada, Keijin Nakaguro, Takashi Yamaguchi, Tomohiro Oshiyama(Konica Minolta), Yuki Mitsuta

    2023年02月   Computational Approach for Molecular Design with High Hole Mobilities using Random Forest Technique and Computer Simulation Method

職務経歴（学外）

  • 大阪大学大学院   工学研究科   非常勤講師

    2024年04月 - 継続中

学歴

  • 大阪市立大学   大学院理学研究科   化学専攻後期博士課程   博士課程後期   卒業・修了

    1991年04月 - 1994年03月

  • 大阪市立大学   大学院理学研究科   化学専攻前期博士課程   その他   卒業・修了

    1989年04月 - 1991年03月

  • 大阪市立大学   理学部   化学科   その他   卒業・修了

    1985年04月 - 1989年03月

論文

  • Computational investigation of the inhibition reaction on the free energy surface between SARS-CoV-2 Mpro and N3 招待 査読

    Toshio Asada, Ryota Ozawa, Yuki Mitsuta

    AIP Conf. Proc.   3030   020010   2024年03月

    　詳細を見る

    担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： https://doi.org/10.1063/5.0192947

  • Computational Approach for Molecular Design of Small Organic Molecules with High Hole Mobilities in Amorphous Phase using Random Forest Technique and Computer Simulation Method

    K.Nakaguro, Y.Mitsuta, S.Koseki, T.Oshiyama, *T.Asada

    Bull. Chem. Soc. Jpn.   96   1099   2023年10月

    　詳細を見る

    担当区分：最終著者,　責任著者   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.21203/rs.3.rs-3002689/v1

  • Nudged Elastic Stiffness Band Method: A Method to Solve Kinks Problem of Reaction Path 査読

    J.Comp.Chem.   44   1884 - 1897   2023年09月

    　詳細を見る

    担当区分：最終著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： https://doi.org/10.1002/jcc.27169

  • Curvature-weighted nudged elastic band method using the Riemann curvature

    満田祐樹、麻田俊雄

    Journal of Computational Chemistry   44 ( 5 )   662 - 669   2022年11月（ ISSN:01928651 ）

    　詳細を見る

    担当区分：最終著者   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1002/jcc.27030

    PubMed

  • Calculation of the permeability coefficients of small molecules through lipid bilayers by free-energy reaction network analysis following the explicit treatment of the internal conformation of the solute 査読

    Y.Mitsuta, T.Asada, Y.Shigeta

    Phys.Chem.Chem.Phys.   24   26070 - 26082   2022年10月

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： https://doi.org/10.1039/D2CP03678A

  • Theoretical Design of Blue-Color Phosphorescent Complexes for Organic Light Emitting Diodes: Emission Intensities and Non-Radiative Transition Rate Constants in Ir(ppy)2(acac) Derivatives 査読

    S.Koseki, M.Yoshii, T.Asada, Y.Fujimura, T.Matsushita, S.Yagi

    The journal of physical chemistry A 雑誌   2021年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Climbing end image algorithm to locate transition states 査読

    T.Asada, N.Sawada, M.Haruta, S.Koseki

    Chemical Physics Letters 雑誌   2021年05月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

    リポジトリURL： http://hdl.handle.net/10466/00017403

  • Exploring the Reaction Paths on the Potential Energy Surfaces of the S<sub>1</sub> and T<sub>1</sub> States in Methylenecyclopropane.

    Koseki S, Haruta M, Sawada N, Asada T

    Photochemistry and photobiology   97 ( 1 )   126 - 135   2021年01月（ ISSN:0031-8655 ）

    　詳細を見る

  • マテリアルズインフォマティクスのためのデータ作成とその解析 査読

    麻田 俊雄

    技術情報協会   2117   2021年

  • Exploring the Reaction Paths on the Potential Energy Surfaces of the S1 and T1 States in Methylenecyclopropane 査読

    S.Koseki, M.Haruta, N.Sawada, T.Asada

    Photochemistry and Photobiology 雑誌   2020年09月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Examination of the Plausible Reaction Process for Stereoselective Synthesis of Hexapole Helicene via a Palladium-Catalyzed [2 + 2 + 2] Cyclotrimerization of [5]Helicenyl Aryne

    Tomoka Hosokawa, Toshio Asada, Ken Kamikawa

    The Journal of Physical Chemistry A   124 ( 4 )   652 - 661   2020年01月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/acs.jpca.9b09533

  • Theoretical Examination of Plausible Reaction Process for Stereoselective Synthesis of Hexapole Helicene via a Palladium-Catalyzed [2+2+2] Cyclotrimerization of [5]Helicenyl Aryne 査読

    T.Hosokawa, T.Asada, K.Kamikawa

    Journal of Physical Chemistry A 雑誌   124   652 - 661   2020年01月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Spin-Orbit Coupling Constants in Atoms and Ions of Transition Elements:Comparison of Effective Core Potentials, Model Core Potentials, and All-Electron Methods 査読

    S.Koseki, N.Matsunaga, T.Asada, M.Schmidt, M.Gordon

    J.Phys.Chem.A 雑誌   123   2019年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • An improved reaction path optimization method using a chain of conformations 査読

    T.Asada, N.Sawada, T.Nishikawa, and S.Koseki

    Chem.Phys.Lett. 雑誌   Vol.699   255 - 260   2018年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Simulation study of hole mobility in the amorphous phase of organic molecules 査読

    T. Asada and S.Koseki

    Org.Elec. 雑誌   Vol.53   141 - 150   2018年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Computational approach for molecular design using free energy contribution analysis 査読

    T.Asada, B.Pradipta and S.Koseki

    AIP Proc. 雑誌   2040   2018年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Effects of the Alkyl Substituents on the Organic Thin Film Transistor Characteristics of Thiophenefused Naphthalenes: Molecular Simulation, Synthesis, and Device Characterization 査読

    Motoki Kumeda, Atsushi Yamamoto, Toshio Asada, Yasunori Matsui, Kenichiro Takagi, Yu Suenaga, Kunihiko Nagae, Eisuke Ohta, Takuya Ogaki, Hiroyoshi Naito, Shiro Koseki and Hiroshi Ikeda

    J. Jpn. Soc. Colour Mater. 雑誌   Vol.90   233 - 237   2017年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Understanding the structure and hydrogen bonding network of (H2O)32 and (H2O)33: an improved Monte Carlo Temperature Basin Paving (MCTBP) method and Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM) analysis 査読

    Rakshit Avijit, Takamasa Yamaguchi, Toshio Asada, Pradipta Bandyopadhyay

    RCS Advances 雑誌   Vol.7   18401 - 18417   2017年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Numerical Estimation of the Pseudo-Jahn-Teller Effect Using Non-Adiabatic Coupling Integrals in Monocyclic and Bicyclic Conjugated Molecules 査読

    Shiro Koseki, Toyota Azumao, Takashi Muramatsu, Toshio Asada, Nikita Matsunaga

    J.Phys.Chem.A 雑誌   Vol.120   10207 - 10215   2016年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Free Energy Contribution Analysis using Response Kernel Approximation: Insights into the Acylation Reaction for beta–lactamase 査読

    T.Asada, K.Ando, P.Bandyopadhyay, S.Koseki

    J.Phys.Chem.B 雑誌   Vol.120   9338 - 9346   2016年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Spin-Orbit Coupling Analyses of the Phosphorescence: The Effects of Cyclometalated Ligand Replacement in Ir(ppy)3 with Various bpy Ligands to Blue Phosphorescence 査読

    S.Koseki, S.Yagi, H.Yoshinaga, T.Asada, T.Matsushita

    RCS Advances 雑誌   Vol.6   65020 - 65030   2016年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Amorphous Solid Simulation and Trial Fabrication of the Organic Field-Effect Transistor of Tetrathienonaphthalenes Prepared by Using Microflow Photochemical Reactions; A Theoretical Calculation-Inspired Investigation 査読

    Yamamoto, Atsushi; Matsui, Yasunori; Asada, Toshio; Kumeda, Motoki; Takagi, Kenichiro; Suenaga, Yu; Nagae, Kunihiko; Ohta, Eisuke; Sato, Hiroyasu; Koseki, Shiro; Naito, Hiroyoshi; Ikeda, Hiroshi

    J.Org.Chem. 雑誌   Vol.81   3168 - 3176   2016年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Efficient approach to include molecular polarizations using charge and atom dipole response kernels to calculate free energy gradients in QM/MM scheme 査読

    T.Asada,K.Ando,K.Sakurai,S.Koseki,M.Nagaoka

    Phys.Chem.Chem.Phys. 雑誌   Vol.17   2015年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Spin-Orbit Coupling Analyses on Phosphorescent Processes in Ir(Zppy)3 (Z = NH2, NO2 and CN) 査読

    H.Yoshinaga,T.Asada,S.Koseki

    RSC Adv. 雑誌   Vol.5   35760 - 35772   2015年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Efficient approach to obtain free energy gradient using QM/MM MD simulation 査読

    T.Asada,K.Ando,S.Koseki

    AIP Conf. Proc. 雑誌   Vol. 1702   2015年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Synthesis of Double Helicene by Palladium Catalyzed Cross-Coupling Reaction: Structure and Physical Properties 査読

    H.Kashiwara, ; T.Asada; K.Kamikawa

    Chem.Eur.J. 雑誌   Vol.21   1 - 6   2015年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Efficient approach to include molecular polarizations using charge and atom dipole response kernels to calculate free energy gradients in the QM/MM scheme. 査読

    Asada T, Ando K, Sakurai K, Koseki S, Nagaoka M

    Physical chemistry chemical physics : PCCP   17 ( 40 )   26955 - 26968   2015年（ ISSN:1463-9076 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1039/c5cp04423e

    PubMed

  • Theoretical analyses on phosphorescent processes in Pt(thpy)2 and its derivatives 査読

    S.Koseki, Y.Kagita, S.Matsumoto, T.Asada, S.Yagi, H.Nakazumi

    J.Phys.Chem.C 雑誌   Vol.118   2014年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Analyses on Phosphorescent Processes in Pt(thpy)(2) and Its Derivatives 査読

    Shiro Koseki, Yuhld Kagita, Sachiko Matsumoto, Toshio Asada, Shigayuki Yagi, Hiroyuki Nakazumi, Takeshi Matsushita

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C   118 ( 28 )   15412 - 15421   2014年07月（ ISSN:1932-7447 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Theoretical estimation of the peak wavelengths of phosphorescence was performed at the MCSCF+SOCI/SBKJC+p level of theory for several typical platinum complexes in the research field of organic-light-emitting-diodes (OLEDs), where MCSCF +SOCI is the abbreviation of multiconfiguration self-consistent field calculations followed by second-order configuration interaction calculations. The spin orbit coupling (SOC) integrals among low-lying electronic states of different spin multiplicities were explicitly calculated within the Z(eff) approximation. By using these computational methods, the experimental results for peak wavelengths of phosphorescence were reasonably explained for cis-bis[2-(2'-thienyl)pyridinato-N,C-3']platinum(II) and its derivatives. The replacement of one of the 2-(2'-thienyl)pyridinate (thpy) ligands by a 2,4-pentanedionate (acac) ligand causes a blue shift of the phosphorescent peak by about 10 nm. The use of a 1,3-bis(phenyl)propane-1,3-dionate (bpp), 1,3-bis(n-methoxyphenyl)propane-1,3-dionate (bmp), or 1,3-bis(3,4-methoxyphenyl)propane-1,3-dionate (bdmp) ligand, instead of an acac ligand, has almost no effect on the peak wavelength of phosphorescence. When a benzene ring is fused to a thpy ligand, the peak wavelength is estimated to be 613 or 651 nm for [2,2'-(4',5'-benzo)thienyl)pyridinato-N,C-3'][1,3-bis(3,4-dibutoxyphenyl)-propane-1,3-dionato-O,O]platinum(II) [btpPt(bdbp)] and [1-(2'-thienyl)isoquinolyl-N,C-3'] [1,3-bis(3,4-dibutoxyphenyl)-propane-1,3-dionato-O,O]platinum(II) [1tiqPt(bdbp)], respectively, after correction of the present computational underestimation. These theoretical estimations are in good agreement with the corresponding observations.

    DOI： 10.1021/jp5046832

  • Spin-Orbit Coupling Analyses of the Geometrical Effects on Phosphorescence in Ir(ppy)3 and Its Derivatives 査読

    .Koseki, N.Kamata, T.Asada, S.Yagi, H.Nakazumi, T.Matsushita

    J.Phys.Chem.C 雑誌   Vol.117   2013年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Investigation of the Reaction Mechanism of ClONO2 + HCl → HNO3 + Cl2 on (H2O)n (n = 0-3) Cluster 査読

    T.Asada, T.Okajima, S.Koseki

    J.Phys.Chem.A 雑誌   Vol.117   7928 - 7938   2013年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical investigation of the reaction mechanism of ClONO2 + HCl → HNO3 + Cl2 on (H2O)n (n = 0-3) cluster. 査読

    Asada T, Okajima T, Koseki S

    The journal of physical chemistry. A   117 ( 33 )   7928 - 7938   2013年08月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/jp406175j

    PubMed

  • Spin-Orbit Coupling Analyses of the Geometrical Effects on Phosphorescence in Ir(ppy)(3) and Its Derivatives 査読

    Shiro Koseki, Na-oya Kamata, Toshio Asada, Shigeyuki Yagi, Hiroyuki Nakazumi, Takeshi Matsushita

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C   117 ( 10 )   5314 - 5327   2013年03月（ ISSN:1932-7447 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Theoretical investigations were performed for typical iridium complexes, Ir((CN)-N-boolean AND)(3), Ir((CN)-N-boolean AND)(2)(C'N-boolean AND'), Ir-((CN)-N-boolean AND)(2)((NO)-O-boolean AND) and Ir((CN)-N-boolean AND)(2)((OO)-O-boolean AND), at the MCSCF+SOCI+SOC//B3LYP/SBKJC+p level of theory. For Ir(dfppy)(2)(pic) (so-called FIrpic) and its related complexes, the introduction of a fluoride into ppy ligands provides a blue shift of about 20 nm for emission spectra, while the replacement of a pic ligand by an acac ligand does not seriously affect the emission spectra of these complexes. It is proposed that the homo-cis,hetero-O-cis isomer (HC-5f, see text) of FIrpic should be used as a brighter blue-color material instead of the homo-N-trans isomer (HNT-5f). The energy difference between these isomers is less than 1 kcal/mol, and the energy barrier of the isomerization between these isomers is calculated to be larger than 30 kcal/mol. It was also found that the use of two ancillary ligands, such as Ir((CN)-N-boolean AND)((NO)-O-boolean AND)(2) and Ir((CN)-N-boolean AND)((OO)-O-boolean AND)(2), is unfortunately inappropriate to energetically lift the pi* orbital.

    DOI： 10.1021/jp312032s

  • Toward a new approach for determination of solute's charge distribution to analyze interatomic electrostatic interactions in quantum mechanical/molecular mechanical simulations.

    Yamada K, Koyano Y, Okamoto T, Asada T, Koga N, Nagaoka M

    Journal of computational chemistry   32 ( 14 )   3092 - 104   2011年11月（ ISSN:0192-8651 ）

    　詳細を見る

  • A minimal implementation of the AMBER-GAUSSIAN interface for ab initio QM/MM-MD simulation.

    Okamoto T, Yamada K, Koyano Y, Asada T, Koga N, Nagaoka M

    Journal of computational chemistry   32 ( 5 )   932 - 42   2011年04月（ ISSN:0192-8651 ）

    　詳細を見る

  • QM/MM investigation on the degradation mechanism of the electron transporting layer 査読

    T.Asada, K.Ohta, S.Koseki

    Theo.Chem.Acc.   130   439 - 448   2011年

  • Reaction path optimization and vibrational frequency analysis via ab initio QM/MM free energy gradient (FEG) method: application to isomerization process of glycine in aqueous solution 査読

    N.Takenaka, Y.Koyano, Y.Kitamura, T.Asada, M.Nagaoka

    Theo.Chem.Acc.   130   215 - 226   2011年

  • Toward a new approach for determination of solute's charge distribution to analyze interatomic electrostatic interaction in quantum mechanical/molecular mechanical simulations 査読

    K.Yamada, Y.Koyano, T.Okamoto, T.Asada, N.Koga, M.Nagaoka

    J.Comp.Chem. 雑誌   32   3092 - 3104   2011年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • A Minimal Implementation of the AMBER-GAUSSIAN Interface for Ab Initio QM/MM-MD Simulation 査読

    T.Okamoto, K.Yamada, Y.Koyano, T.Asada, N.Koga, M.Nagaoka

    J.Comp.Chem. 雑誌   32   932 - 942   2011年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Ab initio electron correlation studies of the intracluster reaction NO+(H2O)N --> H3O+(H2O)n-2(HONO) at n=4 and 5 査読

    T.Asada, S.Koseki, M.Nagaoka

    Phys.Chem.Chem.Phys. 雑誌   13   1590 - 1596   2011年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Ab initio electron correlated studies on the intracluster reaction of NO+ (H2O)(n) → H3O+ (H2O)(n-2) (HONO) (n = 4 and 5). 査読

    Asada T, Nagaoka M, Koseki S

    Physical chemistry chemical physics : PCCP   13 ( 4 )   1590 - 1596   2011年（ ISSN:1463-9076 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1039/c0cp01077d

    PubMed

  • Tetrahydrides of third-row transition elements: spin-orbit coupling effects on the stability of rhenium tetrahydride. 査読

    Koseki S, Hisashima TA, Asada T, Toyota A, Matsunaga N

    The Journal of chemical physics   133 ( 17 )   174112   2010年11月（ ISSN:0021-9606 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1063/1.3495680

    PubMed

  • Tetra-hydrides of Third-Row Transition Elements: Spin-Orbit Coupling Effects on the Stability of Rhenium Tetra-hydrides 査読

    S.Koseki, H.Hisashima, T.Asada, A.Toyota, N.Matsunaga

    J.Chem.Phys. 雑誌   133   174112 - 174120   2010年

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Study on the Absorption Spectra of fac-Ir(ppy)3 in the Amorphous Phase of Organic Electro-Luminescent Devices 査読

    T.Asada, S.Hamamura, T.Matsushita, and S.Koseki

    Res.Chem.Int. 雑誌   35   851 - 863   2009年10月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Spin-orbit coupling effects in dihydrides of third-row transition elements. II. Interplay of nonadiabatic coupling in the dissociation path of rhenium dihydride.

    Koseki S, Shimakura N, Fujimura Y, Asada T, Kono H

    The Journal of chemical physics   131 ( 4 )   044122   2009年07月（ ISSN:0021-9606 ）

    　詳細を見る

  • Spin-orbit coupling effects in dihydrides of third-row transition elements. II. Interplay of nonadiabatic coupling in the dissociation path of rhenium dihydride 査読

    S.Koseki, N.Shimakura, Y.Fujimura, T.Asada, and H.Kono

    J.Chem.Phys. 雑誌   131   44122 - 44129   2009年07月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Study on Phosphorescent Materials for Organic Electro-Luminescent Devices 査読

    S.Koseki, T.Asada, and T.Matsushita

    J.Comp.Theo.Nanoscience 雑誌   6   1352 - 1360   2009年07月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Simulation Study of Interactions and Reactivities between NADH Cytochrom b5 Reductase and Cytochrome b5 査読

    T.Asada, S.Nagase, K.Nishimoto, and S.Koseki

    J.Mol.Liq. 雑誌   147   139 - 144   2009年03月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Molecular dynamics simulation study on stabilities and reactivities of NADH cytochrom b5 reductase 査読

    T.Asada, S.Nagase, K.Nishimoto, and S.Koseki

    J.Phys.Chem.B 雑誌   112   5718 - 5727   2008年05月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Molecular dynamics simulation study on stabilities and reactivities of NADH cytochrome B5 reductase. 査読

    Asada T, Nagase S, Nishimoto K, Koseki S

    The journal of physical chemistry. B   112 ( 18 )   5718 - 5727   2008年05月（ ISSN:1520-6106 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/jp7101513

    PubMed

  • Relativistic study on emission mechanism in tris(2-phenylpyridine)iridium 査読

    Takeshi Matsushita, Toshio Asada, Shiro Koseki

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C   111 ( 18 )   6897 - 6903   2007年05月（ ISSN:1932-7447 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    The mechanisms of radiative processes from electronically excited states were investigated for tris(2-phenylpyridine)iridium [Ir(ppy)(3)]. It was found that low-lying excited singlet and triplet states in the facial (fac) isomer are strongly mixed with each other by spin-orbit coupling (SOC) effects and, as a result, the radiative transitions could occur easily from low-lying spin-mixed states to the lowest spin-mixed state (ground state), where the low-lying spin-mixed states mainly have a triplet character. On the basis of the assumption that radiative processes obey Fermi&apos;s Golden rule, large transition probabilities are obtained between the sublevels of the adiabatic lowest triplet state (T(1)) and the ground state (S(0)), and phosphorescence is expected to be observed in this complex. This result is in good agreement with experimental reports.

    DOI： 10.1021/jp0708796

  • Relativistic Study on Emission Mechanism in tris-(2-Phenylpyridine) Iridium 査読

    T.Matsushita, T.Asada, and S.Koseki

    J.Phys.Chem.C 雑誌   111   6897 - 6903   2007年04月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Tetra-Hydrides of the Third-Row Transition Elements: Spin-Orbit Coupling Effects on Geometrical Deformation in WH4 and OsH4 査読

    T.Hisashima, T.Matsushita, T.Asada, and S.Koseki

    Theo.Chem.Acc. 雑誌   120   85 - 94   2007年04月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical study of environmental effects for proton transfer reaction through the peptide bond in a model system 査読

    T.Asada, T.Takahashi, S.Koseki

    Theo.Chem.Acc. 雑誌   120   263 - 271   2007年04月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Relativistic study on emission mechanism in palladium and platinum complexes. 査読

    Matsushita T, Asada T, Koseki S

    The journal of physical chemistry. A   110 ( 49 )   13295 - 13302   2006年12月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/jp0632992

    PubMed

  • Relativistic Study on Emission Mechanism in Paraddium and Platunum Complexes 査読

    T.Matsushita, T.Asada, and S.Koseki

    J.Phys.Chem.A 雑誌   110   13295 - 13302   2006年09月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Calculation of Structures and Proton Transfer in Hydrated Ammonia Hydrogen Chloride Clusters 査読

    Toshio Asada, Seisuke Takitani, Shiro Koseki

    The Journal of Physical Chemistry A 雑誌   109   1821 - 1827   2005年04月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical calculation of structures and proton transfer in hydrated ammonia-hydrogen chloride clusters. 査読

    Asada T, Takitani S, Koseki S

    The journal of physical chemistry. A   109 ( 9 )   1821 - 1827   2005年03月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/jp045933m

    PubMed

  • Molecular dynamics simulation study of the negative correlation in antibody AZ28-catalyzed oxy-cope rearrangement.

    Asada T, Gouda H, Kollman PA

    Journal of the American Chemical Society   124 ( 42 )   12535 - 42   2002年10月（ ISSN:0002-7863 ）

    　詳細を見る

  • Molecular dynamics simulation study of the negative correlation in antibody AZ28 catalyzed oxy-Cope rearrangement 査読

    Toshio Asada, Hiroaki Gouda, Peter A. Kollman

    Journal of the American Chemical Society 雑誌   124   12535 - 12542   2002年08月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Simulation study of proton transfer for N2H7+　cluster by classical ab initio and quantum wave packet dynamics 査読

    Toshio Asada, Haruya Haraguchi, Kazuo Kitaura

    The Journal of Physical Chemistry A 雑誌   105   7423 - 7428   2001年07月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Vibrational assignments of lithium alkyl carbonate and lithium alkoxide in the infrared spectra: an ab initio MO study 査読

    S.Matsuta, T.Asada, K.Kitaura

    J.Electrochem.Soc. 雑誌   Vol.147 ( 5 )   1695 - 1702   2000年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Fragment Molecular Orbital Method: An ApproximateComputational Method for Large Molecule 査読

    K.Kitaura, E.Ikeo,T.Asada, T.Nakano, and M.Uebayashi

    Chem.Phys.Lett. 雑誌   Vol.313   701 - 706   1999年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Pair interaction molecular orbital method: an approximatecomputational method for molecular interactions 査読

    K.Kitaura, T.Sawai, T.Asada, T.Nakano, M.Uebayashi

    Chem.Phys.Lett. 雑誌   Vol.312   319 - 324   1999年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Ab Initio MO Study of the Flavin Catalyzed DehydrogenationReaction of Glycine - PTC driving Hydride Transfer Mechanism 査読

    K.Nishimoto,K.Higashimura, T.Asada

    Theo.Chem.Acc. 雑誌 Springer-Verlag   Vol.102   355 - 365   1999年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Structures of Cl-CH3Cl(H2O)n (n=0,1,2) cluster at roomtemperature from Monte Carlo samplings using the ab initio MO method 査読

    T.Asada, N.Kato, K.Kitaura

    J.Mol.Struct.(Theochem). 雑誌 Elsevier   Vol.461-462   493 - 502   1999年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Hybrid Procedure of Ab Initio Molecular Orbital (MO) andMonte Carlo Samplings; Application to Cluster B+(H2O) 査読

    H.Watanabe, T.Asada

    Chem.Phys. 雑誌 Elsevier   Vol.237   81 - 90   1998年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Prediction of Intracluster Reactions of B+(H2O)2and B+(H2O)3: Hybrid Procedure of Ab Initio MO Calculations and Monte Calro Samplings. 査読

    H.Watanabe, T.Asada, S.Iwata

    Bull.Chem.Soc.Jpn. 雑誌   Vol.70 ( 11 )   2619 - 2629   1997年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Hybrid procedure of ab initio molecular orbital calculation and Monte Carlo simulation for studying the intracluster reactions: Applications to Mg+(H2O)n (n=1~4) 査読

    T.Asada, S.Iwata

    Chem.Phys.Lett. 雑誌   Vol.260   1996年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Structural Features for Hydrated CN- Clusters at Room Temperature 査読

    T.Ikeda,K.Nishimoto, T.Asada

    Chem.Phys.Lett. 雑誌 Elsevier   Vol.248   329 - 335   1996年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Monte Carlo Simulations of M+Cl-(H2O)n (M=Li,Na) Clusters- Structure, Fluctuations, and Possible Dissolving Mechanism 査読

    T.Asada, K.Nishimoto

    Mol.Simul. 雑誌 Overseas Publishers Association   Vol.16 ( 16 )   309 - 319   1996年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Monte Carlo Simulations of M+Cl-(H2O)n (M=Li,Na) Clustersand the Dissolving Mechanism of Ion Pairs in Water 査読

    T.Asada, K.Nishimoto

    Chem.Phys.Lett. 雑誌   Vol.232   518 - 523   1995年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Melting Phenomena of Cl-(H2O)2 Clusters 査読

    T.Asada, K.Nishimoto, K.Kitaura

    J.Mol.Struct.(Theochem). 雑誌 Elsevier   Vol.310   149 - 153   1994年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

  • Theoretical Study on Binding Enthalpies and Pupulations ofIsomers of Cl-(H2O)n Clusters at Room Temperature 査読

    T.Asada, K.Nishimoto, K.Kitaura

    J.Phys.Chem. 雑誌   Vol.90 ( 29 )   7724 - 7729   1993年12月

    　詳細を見る

    共著区分：共著  

▼全件表示

書籍等出版物

  • マテリアルズインフォマティクスのための データ作成とその解析、応用事例

    船津　公人, 麻田　俊雄　他（ 担当： 共著）

    技術情報協会  2021年07月  （ ISBN:978-4-86104-85 ）

MISC（その他記事）

  • Understanding the structure and hydrogen bonding network of (H2O)(32) and (H2O)(33): an improved Monte Carlo temperature basin paving (MCTBP) method and quantum theory of atoms in molecules (QTAIM) analysis

    Avijit Rakshit, Takamasa Yamaguchi, Toshio Asada, Pradipta Bandyopadhyay

    RSC ADVANCES   7 ( 30 )   18401 - 18417   2017年（ ISSN:2046-2069 ）

    　詳細を見る

    Large water clusters are of particular interest because of their connection to liquid water and the intricate hydrogen bonding networks they possess. Generally, clusters above (H2O)(25) are cage-like; however, the diversity of their hydrogen bonding can be enormous and is related to the stability of the cluster. Two main challenges for understanding hydrogen bonding networks are how to determine a few low energy minima in the extremely rugged energy surface of large water clusters and how to rationalize the relative stability of different structures of a cluster based on simple chemical concepts, particularly when they are very close in energy. In the current work, an improved version of the Monte Carlo Temperature Basin Paving (MCTBP) method has been used to find low energy structures of (H2O)(32) and (H2O)(33) as an answer to the first challenge. Previously, the MCTBP method has been applied to large water clusters with reasonable success. In this work, we have changed the Monte Carlo acceptance/rejection condition to make the calculation more efficient. After finding several structures at either the same or lower energy of previously known structures, the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM) method has been applied to analyze the relationship between the stability and polarized charges on each water molecule in a cluster. Overall, an increase of the polarized charge on the oxygen atom was found to stabilize the energy of a water molecule in a cluster.

    DOI： 10.1039/c6ra28688g

  • Spin-orbit coupling analyses of phosphorescence: the effects of cyclometalated ligand replacement in fac-Ir(ppy)(3) with various bpy ligands on blue phosphorescence

    Harunobu Yoshinaga, Toshio Asada, Shiro Koseki, Shigeyuki Yagi, Takeshi Matsushita

    RSC ADVANCES   6 ( 69 )   65020 - 65030   2016年（ ISSN:2046-2069 ）

    　詳細を見る

    Multi-configuration self-consistent field (MCSCF) calculations followed by second-order configuration interaction (SOCI) and spin-orbit coupling (SOC) calculations were performed using one of the effective core potentials and its associated basis set, the Stevens-Basch-Krauss-Jasien-Cundari (SBKJC) basis set referred to here as SBKJC+p, in order to examine the effects of replacement of a methine group in each phenylpyridine (ppy) ligand of the facial (fac) isomer of tris(2-phenylpyridinato)iridium(III)[fac-Ir(ppy)(3)] by a nitrogen atom for the purpose of obtaining deep blue phosphorescence. Only replacements of the methine group at the 3' or 5' site of each ppy ligand by nitrogen atoms were calculated to induce a spectral shift to the blue region. These results can be explained by the strong electronegativity of nitrogen atoms and by the magnitude of the electron density at the 2' carbon atom of the ppy or bipyridine (bpy) ligands. Subsequently, the substituent effects in the fac isomer of tris(bipyridinato)iridium(III)[fac-Ir(bpy)(3)] were investigated and found to be similar to those in fac-Ir(ppy)(3) as reported in our previous study (RSC Adv., 2015, 5, 35760-35772). Based on systematic calculations and theoretical consideration, the most effective modification for deep blue phosphorescence should be the introduction of a nitrogen atom into the 3' or/and 5' site of benzene rings of the ppy ligands in fac-Ir(ppy)(3) together with the combination of the substituents X = F, NR2, or OR (R = alkyl group) and Y = CN or NO2.

    DOI： 10.1039/c6ra07778a

  • Efficient Approach to Obtain Free Energy Gradient using QM/MM MD Simulation

    Toshio Asada, Kanta Ando, Shiro Koseki

    INTERNATIONAL CONFERENCE OF COMPUTATIONAL METHODS IN SCIENCES AND ENGINEERING 2015 (ICCMSE 2015)   1702   2015年（ ISSN:0094-243X ）

    　詳細を見る

    The efficient computational approach denoted as charge and atom dipole response kernel (CDRK) model to consider polarization effects of the quantum mechanical (QM) region is described using the charge response and the atom dipole response kernels for free energy gradient (FEG) calculations in the quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) method. CDRK model can reasonably reproduce energies and also energy gradients of QM and MM atoms obtained by expensive QM/MM calculations in a drastically reduced computational time. This model is applied on the acylation reaction in hydrated trypsin-BPTI complex to optimize the reaction path on the free energy surface by means of FEG and the nudged elastic band (NEB) method.

    DOI： 10.1063/1.4938813

  • Spin-orbit coupling analyses of phosphorescent processes in Ir(Zppy)(3) (Z = NH2, NO2 and CN)

    Shiro Koseki, Harunobu Yoshinaga, Toshio Asada, Takeshi Matsushita

    RSC ADVANCES   5 ( 45 )   35760 - 35772   2015年（ ISSN:2046-2069 ）

    　詳細を見る

    Substituent effects of NH2, NO2 and CN groups on phosphorescence in fac-tris(2- phenylpyridinato)-iridium(III) [fac-Ir(ppy)(3)] were examined theoretically by using the multiconfiguration self-consistent field (MCSCF) method together with the SBKJC basis sets augmented by a set of polarization functions, followed by second-order configuration interaction (SOCI) and spin-orbit coupling (SOC) calculations, while time-dependent density functional theory (TD DFT) calculations provided too long wavelengths for phosphorescent peaks at the geometries optimized for triplet states even though the TD DFT predictions were qualitatively good with respect to relative spectral shifts. The strongest electron-donating substituent NH2 and the strongest electron-withdrawing substituents, NO2 and CN, were chosen for investigation of the substituent effects in the present investigation. It was found that when these electron-withdrawing substituents are introduced into the Z(5) sites, the largest blue shift is obtained for the emission spectra, while the introduction of the electron-donating NH2 substituent causes a red shift of the emission spectra. This is because the Z(5) site has non-negligible coefficients in the highest occupied molecular orbital (HOMO) and can interact with the pi* orbitals of the substituents. This interaction makes the HOMO lower in energy. This is the reason why a large blue shift of the emission peak is obtained when one of these substituents is introduced to the Z(5) sites. Based on the results of the calculation, it can be said that the best material for blue-color emission is tris(5-nitro-2-phenylpyridinato) iridium(III) [fac-Ir(5-NO2-ppy)(3)] or tris(5-nitro-4,6-difluoro-2-phenylpyridinato) iridium(III) [fac-Ir(5-NO2-4,6-dfppy)(3)]. If the reactivity of the NO2 substituent in the lowest triplet state becomes troublesome in the synthesis processes and/or if it is difficult to choose host molecules for an emissive layer, tris(5-cyano-3,4,6-trifluoro-2-phenylpyridinato) iridium(III) [fac-Ir(5-CN-3,4,6-tfppy)(3)] would be the most appropriate for blue-color emission.

    DOI： 10.1039/c5ra04487a

  • Molecular dynamics simulation study of the negative correlation in antibody AZ28-catalyzed oxy-Cope rearrangement

    T Asada, H Gouda, PA Kollman

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   124 ( 42 )   12535 - 12542   2002年10月（ ISSN:0002-7863 ）

    　詳細を見る

    The oxy-Cope rearrangement reaction in the antibody AZ28 is investigated using ab initio molecular orbital calculations and molecular mechanical molecular dynamics simulations. This antibody, AZ28, is known as one of the few systems where the mature catalytic antibody shows a negative correlation between the transition state analogue (TSA) binding affinity and the catalytic rate of the oxy-Cope rearrangement compared to the germ line catalytic antibody. The ab initio optimized structure shows that the transition state structure has a more planar configuration than the TSA. The favorable electrostatic interactions between AZ28 and the transition state analogue overcome the unfavorable van der Waals interactions; thus, AZ28 shows higher binding affinity for the TSA than the germ line. However, the AZ28 is not flexible enough to accept the relatively planar transition state structure. Because the lower flexibility causes poorer antibody-hapten interaction energies, the activation free energy of the oxy-Cope rearrangement becomes larger in the mature antibody than the germ line. We show that the differences in flexibility between the germ line and the mature form and the differences in structure between TSA and the transition state are the origin of the negative correlation in AZ28-catalyzed oxy-Cope rearrangement. The mutation of residue 34 of the light chain, 34(L), affects the binding free energies through the interresidue interaction because it is the closest to the hapten among the six mutatable residues. However, it does not affect the negative correlation.

    DOI： 10.1021/ja020774a

    PubMed

    CiNii Article

  • Molecular dynamics simulation study of the negative correlation in antibody AZ28-catalyzed oxy-Cope rearrangement

    T Asada, H Gouda, PA Kollman

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   124 ( 42 )   12535 - 12542   2002年10月（ ISSN:0002-7863 ）

    　詳細を見る

    The oxy-Cope rearrangement reaction in the antibody AZ28 is investigated using ab initio molecular orbital calculations and molecular mechanical molecular dynamics simulations. This antibody, AZ28, is known as one of the few systems where the mature catalytic antibody shows a negative correlation between the transition state analogue (TSA) binding affinity and the catalytic rate of the oxy-Cope rearrangement compared to the germ line catalytic antibody. The ab initio optimized structure shows that the transition state structure has a more planar configuration than the TSA. The favorable electrostatic interactions between AZ28 and the transition state analogue overcome the unfavorable van der Waals interactions; thus, AZ28 shows higher binding affinity for the TSA than the germ line. However, the AZ28 is not flexible enough to accept the relatively planar transition state structure. Because the lower flexibility causes poorer antibody-hapten interaction energies, the activation free energy of the oxy-Cope rearrangement becomes larger in the mature antibody than the germ line. We show that the differences in flexibility between the germ line and the mature form and the differences in structure between TSA and the transition state are the origin of the negative correlation in AZ28-catalyzed oxy-Cope rearrangement. The mutation of residue 34 of the light chain, 34(L), affects the binding free energies through the interresidue interaction because it is the closest to the hapten among the six mutatable residues. However, it does not affect the negative correlation.

    DOI： 10.1021/ja020774a

    PubMed

    CiNii Article

  • Simulation studies of proton transfer in N2H7+ cluster by classical ab initio Monte Carlo and quantum wave packet dynamics

    T Asada, H Haraguchi, K Kitaura

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A   105 ( 31 )   7423 - 7428   2001年08月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    The quantum effects on the proton-transfer reaction in the N2H7+ cluster has been studied using the classical ab initio Monte Carlo method and a one-dimensional model for the quantum wave packet dynamics on the ab initio MP2/6-31 + G* potential energy surface. The optimized stable structure has C-3v symmetry, in which the proton is bound to one NH3 molecule in such a way that the proton feels bistable potential. In contrast, we found that the proton was located at the center of two NH3 molecules with D-3d symmetry due to the quantum effects of the proton kinetics. ne quantum simulations indicate that the reason the experimental spectra predict N2H7+ to have a symmetric D-3d Structure, contrary to the ab initio results, is that the quantum effects of the proton motion is completely neglected in the previous theoretical calculations. The vibrational frequency for the N-H stretching mode which corresponds to the proton transfer is estimated to be 706.7 cm(-1) by including proton quantum effects in contrast with 2100.1 cm(-1) obtained by the conventional ab initio MO method for the C-3v structure.

    DOI： 10.1021/jp004514w

  • Simulation studies of proton transfer in N2H7+ cluster by classical ab initio Monte Carlo and quantum wave packet dynamics

    T Asada, H Haraguchi, K Kitaura

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A   105 ( 31 )   7423 - 7428   2001年08月（ ISSN:1089-5639 ）

    　詳細を見る

    The quantum effects on the proton-transfer reaction in the N2H7+ cluster has been studied using the classical ab initio Monte Carlo method and a one-dimensional model for the quantum wave packet dynamics on the ab initio MP2/6-31 + G* potential energy surface. The optimized stable structure has C-3v symmetry, in which the proton is bound to one NH3 molecule in such a way that the proton feels bistable potential. In contrast, we found that the proton was located at the center of two NH3 molecules with D-3d symmetry due to the quantum effects of the proton kinetics. ne quantum simulations indicate that the reason the experimental spectra predict N2H7+ to have a symmetric D-3d Structure, contrary to the ab initio results, is that the quantum effects of the proton motion is completely neglected in the previous theoretical calculations. The vibrational frequency for the N-H stretching mode which corresponds to the proton transfer is estimated to be 706.7 cm(-1) by including proton quantum effects in contrast with 2100.1 cm(-1) obtained by the conventional ab initio MO method for the C-3v structure.

    DOI： 10.1021/jp004514w

  • Gaussian98を快適に利用する

    麻田俊雄

    総合情報センター年報 総合情報センター年報   6   49 - 54   2000年12月

    　詳細を見る

  • Vibrational assignments of lithium alkyl carbonate and lithium alkoxide in the infrared spectra - An ab initio MO study

    S Matsuta, T Asada, K Kitaura

    JOURNAL OF THE ELECTROCHEMICAL SOCIETY   147 ( 5 )   1695 - 1702   2000年05月（ ISSN:0013-4651 ）

    　詳細を見る

    We conducted nh initio molecular orbital calculations on stable monomer and dimer structures of lithium alkyl carbonates (methyl, ethyl, and propyl carbonate lithium) and lithium alkoxides (lithium methoxide, lithium ethoxide, lithium propoxide, and lithium butoxide). We confirmed that both lithium alkyl carbonates and lithium alkoxides adopted the dimer structure. The dimerization energies were approximately constant and independent of the alkyl group chain length. The dimerization energy was 214 kJ/mol for lithium alkyl carbonates and 266 kJ/mol for lithium alkoxides. Assignments of the vibration modes for each calculated frequency of lithium alkyl carbonates and lithium alkoxides were carried out. Vibrational frequency analysis recognized a dramatic vibrational frequency shift in the parts of the structure which changed significantly between the monomer and dimer structures (the lithium carbonate structure for lithium alkyl carbonates and the COLI structure for lithium alkoxides). Good agreement was achieved between calculated and experimental vibrational frequencies by shifting the frequency of the dimers, (C) 2000 The Electrochemical Society, SOD13-4651(99)09-059-X. All rights reserved.

    DOI： 10.1149/1.1393420

    CiNii Article

  • 高校生のための授業

    麻田俊雄

    総合情報センター年報   4   153 - 154   1998年12月

    　詳細を見る

  • Theoretical prediction of intracluster reactions of B+(H2O)(2) and B+(H2O)(3): Hybrid procedure of ab initio MO calculations and Monte Carlo samplings

    H Watanabe, T Asada, S Iwata

    BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN   70 ( 11 )   2619 - 2629   1997年11月（ ISSN:0009-2673 ） （ eISSN:1348-0634 ）

    　詳細を見る

    A recently developed hybrid procedure of ab initio molecular orbital (MO) calculations and Monte Calro (MC) samplings is applied to investigate the intracluster reactions of B+(H2O)(n) (n = 2 and 3). In this procedure we do not assume the potential energy functions during MC samplings. At every step the ab initio MO method is directly used to evaluate the electronic energy. The procedure makes it possible to deal with the intra-cluster reaction involving any rearrangement of atoms such as isomerization and dissociation. The many-body effects on the energy are taken into account within the approximation used in the MO calculation. During the MC samplings at room temperature, the B+(H2O)(2) cluster undergoes a series of isomerization reactions, and eventually forms the most stable isomer, sp(2) type of trans HBOH+(H2O). For B+(H2O)(3), the reactions turn out to be more complicated, and a few times simulations suggest that there are several reaction products as well as intermediates in the reactions. The MO-MG procedure is proved to be a powerful tool to search for many isomers, reaction intermediates, and the products as well as the transition state structures between them although it is still very time-consuming.

    DOI： 10.1246/bcsj.70.2619

  • MELTING PHENOMENA OF CL-(H2O)2 CLUSTERS

    T ASADA, K NISHIMOTO, K KITAURA

    JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM   116   149 - 153   1994年07月（ ISSN:0166-1280 ）

    　詳細を見る

    Melting phenomena were found in the calculated root-mean-square (r.m.s.) bond fluctuation (BF) using Monte Carlo simulation for the Cl-(H2O)2 cluster. From the results, the decrease region in the r.m.s. BF was also found as the temperature was increased just above the melting point, which has never been reported in argon clusters. The term ''irregular region'' for this region is used. These interesting phenomena have been partly interpreted using the partition functions of simple model potential functions for clusters with hydrogen bonding.

  • THEORETICAL-STUDY ON BINDING ENTHALPIES AND POPULATIONS OF ISOMERS OF CL-(H2O)N CLUSTERS AT ROOM-TEMPERATURE

    T ASADA, K NISHIMOTO, K KITAURA

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY   97 ( 29 )   7724 - 7729   1993年07月（ ISSN:0022-3654 ）

    　詳細を見る

    The Monte Carlo simulations were performed for Cl-(H2O). (n = 1-8) at room temperature. The calculated enthalpy changes were in reasonable agreement with the experiments. The O-O radial distribution function of n = 2 clearly showed that the population of the ion-centered structure was larger than that of the pyramidal structure, though the former was energetically less stable than the later by 2 kcal/mol. The mole fractions of isomers were estimated by the partition function constructed using a simple theoretical model. The results suggest that the major isomer at room temperature is not necessarily the energetically most stable one, but the entropy-favored one.

    DOI： 10.1021/j100131a049

  • クラスターの構造とダイナミックス

    麻田俊雄,西本吉助

    化学同人 化学   47 ( 8 )   568 - 569   1992年12月

    　詳細を見る

  • Structures and Dynamics of the Clusters

    47   1992年

  • クラスターの構造とダイナミックス

    化学   47   1992年

▼全件表示

講演・口頭発表等

  • Nudged Elastic Band法を改良するために剛性の力を加えたNudged Elastic Stiffness Band法の開発 国内会議

    満田祐樹、麻田俊雄

    日本化学会 第104春季年会（2024）  2024年03月 

  • アンブレラ積分法を利用した多次元アンブレラサンプリングのパラメーター自動最適化手法の開発 国内会議

    満田祐樹、麻田俊雄

    第 37 回分子シミュレーション討論会  2023年12月 

  • 耐加水分解性を有するBPTIの構造特異性に関する理論的解析 国内会議

    森本早紀、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪公立大学 協創研究センター2023年度 分子エレクトロニックデバイス研究所 （RIMED第25回研究会&機能性有機材料開発研究センター 合同研究会)  2023年11月 

  • 内部構造変化からみたPiracetam生体膜透過性の解析 国内会議

    肥田吉騎、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪公立大学 協創研究センター2023年度 分子エレクトロニックデバイス研究所 （RIMED第25回研究会&機能性有機材料開発研究センター 合同研究会)  2023年11月 

  • メインプロテアーゼに対するSARS-CoV-2阻害剤による反応機構の理論的解析 国内会議

    小澤亮太、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪公立大学 協創研究センター2023年度 分子エレクトロニックデバイス研究所 （RIMED第25回研究会&機能性有機材料開発研究センター 合同研究会)  2023年11月 

  • 分子動力学シミュレーションを用いたL-Pro-Gly残基とD-Pro-Gly残基におけるβターン構造の安定性の比較 国内会議

    勝誉治、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪公立大学 協創研究センター2023年度 分子エレクトロニックデバイス研究所 （RIMED第25回研究会&機能性有機材料開発研究センター 合同研究会)  2023年11月 

  • 自由エネルギー成分分割法を用いたトリプシンによる加水分解過程に対する理論的解析 国内会議

    森本早紀、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪公立大学 協創研究センター2023年度 分子エレクトロニックデバイス研究所 （RIMED第25回研究会&機能性有機材料開発研究センター 合同研究会)  2023年11月 

  • 有機アモルファス半導体の電子物性予測 国内会議

    藤邨 颯、麻田俊雄、内藤裕義

    ２０２３年（令和５年）「有機ＥＬ討論会」第３７回例会  2023年11月 

  • Machine Learning-Driven Molecular Design for High Hole Mobility in Amorphous Phases 招待 国際会議

    Toshio Asada

    The 22nd International Discussion & Conference on Nano Interface Controlled Electronic Devices (IDC-NICE 2023)  2023年10月 

    　詳細を見る

    会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • Predicting the Biomembranes Permeability of Fentanyl and Its Analogues by Free Energy Reaction Route Network 国際会議

    Yuki Mitsuta, Toshio Asada

    The 6th International Conference on Molecular Simulation (ICMS2023)  2023年10月 

  • Analysis of membrane permeability of piracetam by using a variationally enhanced sampling and a free energy reaction route network method 国際会議

    Yoshiki Hida, Yuki Mitsuta, Toshio Asada

    The 6th International Conference on Molecular Simulation (ICMS2023)  2023年10月 

  • Comparison of β-turn stabilities of L-Pro-Gly and D-Pro-Gly residues by using replica-exchange molecular dynamics simulations 国際会議

    Katsuharu Katsu, Yuki Mitsuta, Toshio Asada

    The 6th International Conference on Molecular Simulation (ICMS2023)  2023年10月 

  • Nudged Elastic Stiffness Band法：反応経路のkink問題を解決する手法の開発 国内会議

    満田祐樹、麻田俊雄

    第17回分子科学討論会  2023年09月 

  • 自由エネルギー反応経路ネットワークによるpiracetamの生体膜透過性の解析 国内会議

    肥田吉騎、満田祐樹、麻田俊雄

    第17回分子科学討論会  2023年09月 

  • レプリカ交換分子動力学法によるL-Pro-Gly残基とD-Pro-Gly残基におけるbetaターン構造の安定性の比較 国内会議

    勝誉治、満田祐樹、麻田俊雄

    第17回分子科学討論会  2023年09月 

  • SARS-CoV-2の複製過程における共有結合性阻害剤による阻害反応機構の理論的解析 国内会議

    小澤亮太、満田祐樹、麻田俊雄

    第17回分子科学討論会  2023年09月 

  • トリプシンによるペプチド結合切断反応における反応自由エネルギープロファイルの成分分割 国内会議

    森本早紀、満田祐樹、麻田俊雄

    第17回分子科学討論会  2023年09月 

  • SARS-CoV-2 Mpro の阻害反応プロセスの解明と自由エネルギー寄与解析 招待 国内会議

    麻田俊雄

    SRPS2023  2023年09月 

  • 電荷移動度に対する多体効果の理論的検討 国内会議

    麻田俊雄、満田祐樹

    第25回理論化学討論会  2023年05月 

  • Computational Approach for Molecular Design with High Hole Mobilities using Random Forest Technique and Comnputer Simulation Method 招待

    Toshio Asada, Keijin Nakaguro, Takashi Yamaguchi, Tomohiro Oshiyama(Konica Minolta), Yuki Mitsuta

    2023年02月 

  • 新規ジチエノベンゾチアゾール誘導体の半導体特性に対する置換基効果

    岡本温貴、岡田侑也、音野智哉、西田直之、佐藤寛泰、大垣拓也、太田英輔、松井康哲、林晃敏、永瀬隆、麻田俊雄、内藤裕義、池田浩

    第49回有機典型元素化学討論会  2022年12月 

  • Fentanyl とその類似体の膜透過シミュレーション

    満田祐樹、麻田俊雄

    分子シミュレーション討論会  2022年12月 

  • Computational investigation of the inhibition reaction on the free energy surface between SARS-CoV-2 Mpro and N3 complex 招待

    Toshio Asada

    2022年11月 

  • Computational investigation of the inhibitor reaction on the free energy surface between SARS-CoV-2 Mpro and N3 complex 招待

    2022年10月 

  • ジチエノベンゾチアゾールを基盤とした有機半導体の開発

    岡本温貴、 岡田侑也、音野智哉 、西田直之、佐藤寛泰、大垣拓也、太田英輔、松井康哲、林晃敏、永瀬隆、麻田俊雄 、内藤裕義、池田浩

    第32回基礎有機化学討論会  2022年09月 

  • 遅延蛍光分子の発光特性の理論的解釈：二重井戸型ポテンシャル効果

    小関史朗、藤村勇一、河野裕彦、麻田俊雄

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • 機械学習を用いた新規ホール輸送剤の提案

    中畔 慶人、満田祐樹、小関史朗、麻田俊雄

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • 分子動力学シミュレーションによるL-Pro-Gly残基とD-Pro-Gly残基におけるタンパク質のフォールディング構造の比較

    勝 誉治、満田祐樹、麻田俊雄

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • 分子シミュレーションを用いた TEM-1 における脱アシル化反応の理論的研究

    小川美紀、小関史朗、満田祐樹、麻田俊雄

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • (Cyclopropylidenemethyl)benzeneにおける光化学反応の理論的解明：光励起によるカルベンの生成過程

    関戸竜也、麻田俊雄、小関史朗

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • 電荷移動度における多体効果の理論的解析

    田中 優衣、小関史朗、満田祐樹、麻田俊雄

    第16回分子科学討論会  2022年09月 

  • 自由エネルギー反応経路ネットワークとマルコフ連鎖モデルを利用したタンパク質フォールディングのクラスタリング手法開発 国内会議

    満田祐樹、麻田俊雄

    日本化学会第102回春季年会(2022)  2022年03月  日本化学会

    　詳細を見る

    会議種別：口頭発表（一般）  

    開催地：オンライン  

  • ジチエノベンゾチアゾールを基盤とした有機半導体の開発：設計、合成、および電荷輸送特性 国内会議

    大垣拓也、岡本温貴、服部励太郎、中畔慶人、佐藤寛泰、松井康哲、太田英輔、麻田俊雄、内藤裕義、池田浩

    日本化学会第102回春季年会(2022)  2022年03月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • Computational Approach for Molecular Design with High Hole Mobilities using Random Forest Technique and Comnputer Simulation Method 招待

    Toshio Asada

    APATCC-10  2022年02月 

  • 薬剤耐性タンパク質による抗生物質分解反応の理論的解析 国内会議

    大石怜、麻田俊雄、満田祐樹、小関史朗

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2021年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第23回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2021年11月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • 有機半導体材料を志向した新規ジチエノベンゾチアゾール誘導体の合成と物性評価 国内会議

    岡本温貴、横山結太、服部励太郎、山口貴史、大垣拓也、太田英輔、松井康哲、麻田俊雄、内藤裕義、池田浩

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2020年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第22回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2021年11月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • 1-phenyl-methylenecyclopropane における光化学反応の理論的解明：励起状態の反応経路 国内会議

    関戸竜也、麻田俊雄、小関史朗

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2020年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第22回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2021年11月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • AIと分子シミュレーションによる高移動度電荷輸送材に適した分子設計システムの構築 国内会議

    中畔慶人、小関史朗、満田祐樹、麻田俊雄

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2021年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第23回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2021年11月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • 機械学習を用いた有機アモルファス半導体の正孔移動度予測 国内会議

    藤村颯、永瀬隆、小林隆史、麻田俊雄、内藤裕義

    第82回応用物理学会秋季学術講演会  2021年09月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • テトラチエノナフタレンの有機電界効果トランジスタにおけるアルキル鎖長効果

    久米田元紀、谷口公哉、山本惇司、末永 悠、麻田俊雄、松井康哲、服部励太郎、東中屋美帆、大垣拓也、太田英輔、内藤裕義、池田浩

    日本化学会第101回春期年会(2021)  2021年03月 

    　詳細を見る

    会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • 量子化学計算による有機アモルファス半導体の電子物性予測 -正孔輸送材料- 国内会議

    藤村颯、永瀬隆、小林隆史、麻田俊雄、内藤裕義

    第68回応用物理学会春季学術講演会  2021年03月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • 機械学習と分子シミュレーションを用いたホール輸送材の設計 国内会議

    山口貴史、麻田俊雄、小関史朗

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2020年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第22回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2020年12月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • 熱活性化遅延蛍光（TADF）分子の幾何学構造に関する考察 国内会議

    福永直也、麻田 俊雄、小関史朗

    大阪府立大学研究推進機構21世紀科学研究センター2020年度分子エレクトロニックデバイス研究所（RIMED 第22回研究会）＆機能性有機材料開発研究センター合同オンライン研究会  2020年12月 

    　詳細を見る

    会議種別：ポスター発表  

  • http://fock.c.s.osakafu-u.ac.jp/~asada に記載

    麻田 俊雄

▼全件表示

Works（作品等）

  • ナノサイエンス支援による協力研究

    2003年

  • Joint Study Program of Institute for Moleculaar Science

    2003年

  • Joint Research on Chemical Reaction in Antibody Molecule

    2001年
    -
    2002年

  • 抗体分子内化学反応に関する共同研究

    2001年
    -
    2002年

産学官連携可能研究（シーズ）キーワード

  • 自由エネルギー反応経路最適化に関する技術

  • アモルファス相における電荷移動度の理論的予測と機械学習の応用

  • QM/MM法を用いた分子動力学シミュレーションによる構造、電子状態に関する理論的研究方法および実践方法

  • 機械学習による重要度評価

  • タンパク質の構造と機能についての理論的アプローチに関する技術

産学官連携可能研究（シーズ）概要

  • 有機EL材料を含むホスト/ゲスト複合体に関する研究

    　詳細を見る

    独自のSuccessive Conduction法を用いてアモルファス層における電荷移動度を解析することが可能なので、これらを用いた計算科学的手法を適用することができるテーマとの共同研究が可能

  • タンパク質と基質およびタンパク質間の構造的機能的物性に関する研究

    　詳細を見る

    力場およびQM/MM法を用いて活性中心の自由エネルギー面上の反応機構を解析し、反応に関する自由エネルギー変化や基質との結合安定性などの解析法を生かす共同研究が可能

科研費

  • 機械学習と量子化学計算による有機半導体創成と発光デバイス応用

    2021年

  • 理論的アプローチによるアモルファス有機半導体の革新的設計手法の確立

    2021年

  • 有機アモルファス半導体の電子物性予測への挑戦

    2021年

  • 統合自由エネルギープロファイル解析に基づく革新的分子設計と反応制御法の開発

    2020年

  • 有機アモルファス半導体の電子物性予測への挑戦

    2020年

  • 理論的アプローチによるアモルファス有機半導体の革新的設計手法の確立

    2020年

  • QM/MM法を用いた酵素反応の解析手法の共同研究

    2010年

  • 有機EL燐光材料の理論的設計

    2009年

  • 有機EL燐光材料の理論的設計

    2008年

  • 有機EL燐光材料の理論的設計

    2008年

  • 有機EL燐光材料の理論的設計

    2007年

  • 有機EL燐光材料の理論的設計

    2007年

  • 凝集反応系マルチスケールシミュレーションの研究開発 －大規模原子情報の疎視化・再構成技法・疎視的理論の開発－

    2006年

  • 化学教育における計算機化学への取組みに関する研究

    2001年

  • 化学教育における計算機科学への取組みに関する研究

    2001年

  • クラスター内プロトン移動反応に及す溶媒効果の理論的研究

    2000年

  • クラスター内プロトン移動反応に及す溶媒効果の理論的研究

    2000年

  • 非経験的分子軌道法を用いた分子シミュレーションに最適な並列計算機環境の構築

    1999年

▼全件表示

担当授業科目

  • 物理化学II

    2021年度    

  • プログラミング入門

    2021年度    

  • 生命環境科学概論【生命環境科学概論（理学類）】

    2021年度    

  • 量子化学特論

    2021年度    

  • 物理化学演習II

    2021年度    

  • 社会に活きる科学

    2021年度    

▼全件表示

所属院生等の論文発表集計

  • 2023年度

    学部・学域生発表数：0件  所属大学院生発表数：1件

  • 2022年度

    学部・学域生発表数：1件  所属大学院生発表数：0件

論文・研究指導集計

  • 2023年度

    卒業論文指導数：1名  卒業論文審査数：1件

    博士前期課程学生指導数：2名 

    修士論文審査数（主査）：9件  修士論文審査数（副査）：2件

    博士論文審査数（主査）：0件  博士論文審査数（副査）：0件

  • 2022年度

    卒業論文指導数：4名  卒業論文審査数：4件

    博士前期課程学生指導数：4名  博士後期課程学生指導数：0名

    修士論文審査数（主査）：3件  修士論文審査数（副査）：7件

    博士論文審査数（主査）：0件  博士論文審査数（副査）：0件

社会貢献活動

  • 教員免許状更新講習 F1 授業で活かす科学トピックス(理科)

    2017年04月 - 2018年03月

  • 教員免許状更新講習 F1 授業で活かす科学トピックス(理科)

    2014年04月 - 2015年03月

  • 夢ナビライブ2012　in NAGOYA

    2012年04月 - 2013年03月

  • 夢ナビライブ2011

    2011年04月 - 2012年03月

出張講義テーマ　⇒ 出張講義一覧へ

  • 分子の世界 ミクロの小宇宙

    分野：理学（数学，物理学，化学，生物学，地球学，生物化学）

    　詳細を見る

    対象：高校生,　大学生,　教育関係者,　研究者,　社会人・一般,　企業,　市民団体

    キーワード：分子, 量子力学, 電子, 色 

    分子は原子核と電子からなる。これらは大変小さな粒子であり、われわれ身の回りにおこる常識が通用しないミクロの世界である。たとえば、電子は粒子の性質と波の性質を併せ持っている。さらに電子はとびとびのエネルギーしかとれず、これが物質が色をもつ原因にもなっている。本講座では、量子力学の基礎からはじめて、分子がどのようにして形成されているのか、また色がどうして出るのかについて解説する。

役職

  • 部局内役職

    理学部 化学科 

    学科長  2024年04月 - 継続中

  • 部局内役職

    大学院理学研究科 化学専攻 

    専攻長  2024年04月 - 継続中