2022/07/13 更新

写真a

オガタ ヨシユキ
尾形 善之
OGATA Yoshiyuki
担当
大学院農学研究科 応用生物科学専攻 准教授
農学部 応用生物科学科
職名
准教授
所属
農学研究院

担当・職階

  • 大学院農学研究科 応用生物科学専攻 

    准教授  2022年04月 - 継続中

  • 農学部 応用生物科学科 

    准教授  2022年04月 - 継続中

取得学位

  • 博士(農学) ( 京都大学 )

  • 修士(農学) ( 京都大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / システムゲノム科学

  • ライフサイエンス / ゲノム生物学  / 基礎ゲノム科学

  • ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学

  • 情報通信 / 生命、健康、医療情報学

  • ライフサイエンス / 応用分子細胞生物学

研究概要

  • 配列相同性解析に基づく遺伝子の機能と進化の追跡

  • 遺伝子ホモロジー解析データベース Gcorn

  • SARS-CoV-2変異解析データベース Vcorn

  • マイクロバイオーム解析データベース Micorn

  • 相関ネットワーク解析ツール ConfeitoGUI

  • 遺伝子発現解析データベース Xcorn

  • 次世代シーケンシング解析ツール MagicSuite

研究歴

  • 全生物の遺伝子ホモロジー解析データベースGcornの構築

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、系統推定  個人研究

    2018年04月 - 継続中 

  • バクテリア遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn bacteria

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、原核生物  個人研究

    2020年04月 - 継続中 

  • SARS-CoV-2変異解析データベース Vcorn SARS-CoV-2

    遺伝子進化、遺伝子変異、ホモロジー、データベース、新型コロナウイルス  個人研究

    2020年04月 - 継続中 

  • 真菌類遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn fungi

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、真菌類  個人研究

    2019年04月 - 継続中 

  • 植物遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn plant

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、植物  個人研究

    2018年04月 - 継続中 

  • 哺乳類遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn mammalian

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、哺乳類  個人研究

    2020年10月 - 継続中 

  • 脊椎遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn vertebrate

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、脊椎動物  個人研究

    2020年10月 - 継続中 

  • 無脊椎遺伝子のホモロジー解析データベース Gcorn invertebrate

    遺伝子進化、遺伝子機能、ホモロジー、データベース、無脊椎動物  個人研究

    2020年10月 - 継続中 

所属学協会

  • 日本分子生物学会

    2005年11月 - 継続中   国内

  • 日本植物生理学会

    2005年12月 - 継続中   国内

  • ASPB

    2019年04月 - 継続中   国外

  • 日本木材学会

    1994年01月 - 継続中   国内

  • IAWA (International Association of Wood Anatomists)

    1994年01月 - 継続中   国外

  • 日本植物細胞分子生物学会

    2007年01月 - 継続中   国内

  • SMBE (The Society for Molecular Biology and Evolution)

    2009年01月 - 継続中   国外

  • 日本生物工学会

    2010年09月 - 継続中   国内

  • 日本農芸化学会

    2010年09月 - 2012年03月   国内

  • 日本バイオインフォマティクス学会

    2006年01月 - 2008年12月   国内

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受賞歴

  • 日本植物細胞分子生物学会奨励賞

    2010年09月   日本植物細胞分子生物学会  

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    受賞国:日本国

論文

  • Gcorn fungi: A Web Tool for Detecting Biases between Gene Evolution and Speciation in Fungi 査読

    Kawachi T, Inuki Y, Ogata Y

    Journal of Fungi 雑誌   7 ( 11 )   2021年11月

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    共著区分:共著  

  • 馬糞便マイクロバイオーム解析法の胃腸の健康状態把握における有用性 査読

    尾形善之、井貫雄太

    ヒポファィル 雑誌 日本ウマ科学会   2021年

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    共著区分:共著  

  • Gcorn Plant: A Database for Retrieving Functional and Evolutionary Traits of Plant Genes 査読

    Ogata Y, Kimura N, Sano R

    Plant Physiology 雑誌   180 ( 2 )   2019年06月

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    共著区分:共著  

  • ConfeitoGUI: A toolkit for size-sensitive community detection from a correlation network 査読

    Ogata Y, Mannen K, Kotani Y, Kimura N, Sakurai N, Shibata D, Suzuki H

    PLoS One 雑誌   13 ( 10 )   2018年10月

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    共著区分:共著  

  • Genetic Mapping of the HLA1 Locus Causing Hybrid Lethality in Nicotiana Interspecific Hybrids

    Tezuka T, Kitamura N, Imagawa S, Hasegawa A, Shiragaki K, He H, Yanase M, Ogata Y, Morikawa T, Yokoi S

    Plants (Basel) 雑誌   10 ( 10 )   2021年09月

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    共著区分:共著  

  • Chemical genetic approach using β-rubromycin reveals that a RIO kinase-like protein is involved in morphological development in Phytophthora infestans 査読

    Tani S, Nishio N, Kai K, Hagiwara D, Ogata Y, Tojo M, Sumitani JI, Judelson HS, Kawaguchi T

    Sci Rep 雑誌   10 ( 1 )   2020年12月

  • An Artificial Conversion of Roots into Organs with Shoot Stem Characteristics by Inducing Two Transcription Factors 査読

    Hanano S, Tomatsu H, Ohnishi A, Kobayashi K, Kondo Y, Betsuyaku S, Takita E, Ogata Y, Ozawa K, Suda K, Hosouchi T, Nagase T, Suzuki H, Sakurai N, Masumoto H, Fukuda H, Shibata D

    iScience 雑誌   23 ( 7 )   2020年07月

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    共著区分:共著  

  • Role of gut microbiota in sex- and diet-dependent metabolic disorders that lead to early mortality of androgen receptor-deficient male mice 査読

    Harada N, Hanada K, Minami Y, Kitakaze T, Ogata Y, Tokumoto H, Sato T, Kato S, Inui H, Yamaji R

    Am J Physiol Endocrinol Metab 雑誌   18 ( 4 )   2020年04月

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    共著区分:共著  

  • Extracellular transglutaminase 2 induces myotube hypertrophy through G protein-coupled receptor 56 査読

    Kitakaze T, Yoshikawa M, Kobayashi Y, Kimura N, Goshima N, Ishikawa T, Ogata Y, Yamashita Y, Ashida H, Harada N, Yamaji R

    Biochim Biophys Acta Mol Cell Res 雑誌   1867 ( 2 )   2020年02月

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    共著区分:共著  

  • Correlation between toll-like receptor 4 and nucleotide-binding oligomerization domain 2 (NOD2) and pathological severity in dogs with chronic gastrointestinal diseases 査読

    Aono K, Azuma YT, Nabetani T, Hatoya S, Furuya M, Miki M, Hirota K, Fujimoto Y, Nishiyama K, Ogata Y, Mochizuki T, Tani H

    Veterinary Immunology and Immunopathology 雑誌   210   2019年04月

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    共著区分:共著  

  • Gene cloning, expression, and X-ray crystallographic analysis of a β-mannanase from Eisenia fetida 査読

    Ueda M, Hirano Y, Fukuhara H, Naka Y, Nakazawa M, Sakamoto T, Ogata Y, Tamada T

    Enzyme Microb Technol 雑誌   117   15 - 22   2018年10月

  • Pathway-specific metabolome analysis with 18O2-labeled Medicago truncatula via a mass spectrometry-based approach 査読

    Kera K, Fine DD, Wherritt DJ, Nagashima Y, Shimada N, Ara T, Ogata Y, Sumner LW, Suzuki H

    Metabolomics 雑誌   14 ( 5 )   2018年05月

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    共著区分:共著  

  • オミックスデータの解析・可視化の最先端技術:ConfeitoGUIplus

    尾形善之、鈴木秀幸

    植物の生長調節 雑誌   52 ( 2 )   2017年12月

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    共著区分:共著  

  • 多変量データから新規の関係性を検出する「ConfeitoGUIplus」ツールの活用

    尾形善之、鈴木秀幸

    バイオサイエンスとインダストリー 雑誌   75 ( 6 )   2017年

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    共著区分:共著  

  • 多変量解析に一石を投じる-ConfeitoGUIplusの開発 査読

    萬年一斗、尾形善之、鈴木秀幸

    生物工学会誌 雑誌   95 ( 7 )   2017年

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    共著区分:共著  

  • Quantitative proteomic analysis of the response to zinc, magnesium, and calcium deficiency in specific cell types of Arabidopsis roots. 査読

    Fukao Y, Kobayashi M, Zargar SM, Kurata R, Fukui R, Mori IC, Ogata Y

    Proteomics 雑誌   4   2016年01月

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    共著区分:共著  

  • Identification of putative target genes of bZIP19, a transcription factor essential for Arabidopsis adaptation to Zn deficiency in roots. 査読

    3. Inaba S, Kurata R, Kobayashi M, Yamagishi Y, Mori I, Ogata Y, Fukao Y

    Plant J 雑誌   117   4 - 10   2015年10月

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    共著区分:共著  

  • Multiomics in grape berry skin revealed specific induction of the stilbene synthetic pathway by ultraviolet-C irradiation. 査読

    6. Suzuki M, Nakabayashi R, Ogata Y, Sakurai N, Tokimatsu T, Goto S, Suzuki M, Jasinski M, Martinola E, Otagaki S, Matsumoto S, Saito K, Shiratake K

    Plant Physiol 雑誌   168   47 - 59   2015年05月

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    共著区分:共著  

  • A bioinformatics approach to distinguish plant parasite and host transcriptomes in interface tissue by classifying RNA-Seq reads. 査読

    4. Ikeue D, Schudoma C, Zhang W, Ogata Y, Sakamoto T, Kurata T, Furuhashi T, Kragler F, Aoki K

    Plant Methods 雑誌   11   2015年05月

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    共著区分:共著  

  • Quantitative proteomics of Arabidopsis shoot microsomal proteins reveals a cross-talk between excess zinc and iron deficiency. 査読

    7. Zargar SM, Kurata R, Inaba S, Oikawa A, Fukui R, Ogata Y, Agrawal GK, Rakwal R, Fukao Y

    Proteomics 雑誌   15   1196 - 1201   2015年04月

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    共著区分:共著  

  • Potential biomarkers of fatigue identified by plasma metabolome analysis in rats. 査読

    5. Kume S, Yamato M, Tamura Y, Jin G, Nakano M, Miyashige Y, Eguchi A, Ogata Y, Goda N, Iwai K, Yamano E, Watanabe Y, Soga T, Kataoka Y

    PLoS One 雑誌   10   2015年03月

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    共著区分:共著  

  • Correlation analysis of proteins responsive to Zn, Mn, or Fe deficiency in Arabidopsis roots based on iTRAQ analysis. 査読

    8. Zargar SM, Fujiwara M, Inaba S, Kobayashi M, Kurata R, Ogata Y, Fukao Y

    Plant Cell Rep 雑誌   34   157 - 166   2015年01月

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    共著区分:共著  

  • Identification of laticifer-specific genes and their promoter regions from a natural rubber producing plant Hevea brasiliensis.

    9. Aoki Y, Takahashi S, Takayama D, Ogata Y, Sakurai N, Suzuki H, Asawatreratanakul K, Wititsuwannakul D, Wititsuwannakul R, Shibata D, Koyama T, Nakayama T

    Plant Sci 雑誌   225   1 - 8   2014年08月

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    共著区分:共著  

  • Quantitative transcriptional changes associated with chlorosis severity in mosaic leaves of tobacco plants infected with Cucumber mosaic virus. 査読

    12. Mochizuki T, Ogata Y, Hirata Y, Ohki ST

    Mol Plant Biol 雑誌   15   242 - 254   2014年04月

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    共著区分:共著  

  • Tools and databases of the KOMICS web portal for preprocessing, mining, and dissemination of metabolomics data. 査読

    11. Sakurai N, Ara T, Enomoto M, Motegi T, Morishita Y, Kurabayashi A, Iijima Y, Ogata Y, Nakajima D, Suzuki H, Shibata D

    Biomed Res Int 雑誌   2014   2014年04月

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    共著区分:共著  

  • Cellulose digestion and metabolism induced biocatalytic transitions in anaerobic microbial ecosystems. 査読

    13. Yamazawa A, Iikura T, Morioka Y, Shino A, Ogata Y, Date Y, Kikuchi J

    Metabolites 雑誌   4   36 - 52   2013年12月

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    共著区分:共著  

  • Defects in IRE1 enhance cell death and fail to degrade mRNAs encoding secretory pathway proteins in the Arabidopsis unfolded protein response. 査読

    14. Mishiba K, Nagashima Y, Suzuki E, Hayashi N, Ogata Y, Shimada Y, Koizumi N

    Proc Natl Acad Sci USA 雑誌   110   5713 - 5718   2013年04月

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    共著区分:共著  

  • Functional genomics of tomato in a post-genome-sequencing phase. 査読

    Aoki K, Ogata Y, Igarashi K, Yano K, Nagasaki H, Kaminuma E, Toyoda A

    Breed Science 雑誌   63   14 - 20   2013年03月

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    共著区分:共著  

  • Construction and analysis of EST libraries of the trans-polyisoprene producting plant, Eucommia ulmoides Oliver 査読

    N. Suzuki, H. Uefuji, T. Nishikawa, Y. Mukai, A. Yamashita, M. Hattori, N. Ogasawara, T. Bamba, E.I. Fukusaki, A. Kobayashi, Y. Ogata, N. Sakurai, H. Suzuki, D. Shibata, Y. Nakazawa

    Planta 雑誌   2012年06月

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    共著区分:共著  

  • Development of KaPPA-View4 for omics studies on Jatropha and a database system KaPPA-Loader for construction of local omics databases 査読

    N. Sakurai, Y. Ogata, T. Ara, R. Sano, N. Akimoto, A. Hiruta, H. Suzuki, M. Kajikawa, U. Widyastuti, S. Suharsono, A. Yokota, K. Akashi, J. Kikuchi, D. Shibata

    Plant Biotechnol. 雑誌 Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology   29   131 - 135   2012年05月

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    共著区分:共著  

  • Identification and characterization of ANAC042 a transcription factor family gene involved in the regulation of camalexin biosynthesis in Arabidopsis 査読

    H. Saga, T. Ogawa, K. Kai, H. Suzuki, Y. Ogata, N. Sakurai, D. Shibata, D. Ohta

    Mol. Plant Microbe Interact. 雑誌   25   684 - 696   2012年05月

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    共著区分:共著  

  • ECOMICS: a web-based toolkit for investigating the biomolecular web in ecosystems using a trans-omics approach 査読

    Y. Ogata, E. Chikayama, Y. Morioka, R.C. Everroad, A. Shino, A. Matsushima, H. Haruna, S. Moriya, T. Toyoda, J. Kikuchi

    PLoS One 雑誌   7   2012年02月

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    共著区分:共著  

  • Plant expressed sequence tags database: practical uses and the improvement of their searches using network module analysis 査読

    Y. Ogata, H. Suzuki

    Plant Biotechnol. 雑誌 Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology   28   351 - 360   2011年09月

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    共著区分:共著  

  • ECOMICS: Ecosystem trans-OMICS tools and methodds for complex environmental samples and datasets 査読

    J. Kikuchi, Y. Ogata, K. Shinozaki

    J. Ecosys. Ecograph. 雑誌 OMICS Publishing Group   S2   S2 - 001   2011年08月

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    共著区分:共著  

  • Analysis of expressed sequence tags in developing secondary xylem and shoot of Acacia mangium 査読

    S. Suzuki, K. Suda, N. Sakurai, Y. Ogata, T. Hattori, H. Suzuki, D. Shibata, T. Umezawa

    J. Wood Sci. 雑誌 The Japan Wood Research Society   57   40 - 46   2011年01月

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    共著区分:共著  

  • KaPPA-View4: the metabolic pathway database for representation and analysis of correlation networks of genes expressions and metabolite accumulations and omics data 査読

    N. Sakurai, T. Ara, Y. Ogata, R. Sano, T. Ono, K. Sugiyama, A. Hiruta, F. Fujii, K. Yamazaki, K. Yano, K. Aoki, A. Aharoni, K. Hamada, K. Yokoyama, S. Kawamura, H. Otsuka, T. Tokimatsu, M. Kanehisa, H. Suzuki, K. Saito, D. Shibata

    Nucleic Acids Res. 雑誌 Oxford Journals   39   D677 - D684   2011年01月

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    共著区分:共著  

  • CoP: a database for characterizing a group of co-expressed genes in plants 査読

    Y. Ogata, H. Suzuki, N. Sakurai, D. Shibata

    Bioinformatics 雑誌 Oxford Journals   26   1267 - 1268   2010年04月

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    共著区分:共著  

  • Coexpression analysis of tomato genes and experimental verification of coordinated expression of genes found in a functionally enriched coexpression module 査読

    S. Ozaki, Y. Ogata, K. Suda, A. Kurabayashi, T. Suzuki, N. Yamamoto, Y. Iijima, T. Tsugane, T. Fujii, C. Konishi, S. Inai, S. Bunsupa, M. Yamazaki, D. Shibata, K. Aoki

    DNA Res. 雑誌 Kazusa DNA Research Institute   17   105 - 116   2010年04月

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    共著区分:共著  

  • A database for poplar gene co-expression analysis for systematic understanding of biological processes, including stress tolerance 査読

    Y. Ogata, H. Suzuki, D. Shibata

    J. Wood Sci. 雑誌 The Japan Wood Research Society   55   395 - 400   2009年12月

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    共著区分:共著  

  • A gene co-expression database for understanding biologcial processes in soybean 査読

    Y. Ogata, H. Suzuki, D. Shibata

    Plant Biotechnol. 雑誌 Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology   26   503 - 507   2009年12月

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    共著区分:共著  

  • The prediction of local modular structures in a co-expression network based on gene expression datasets 査読

    Y. Ogata, N. Sakurai, H. Suzuki, K. Aoki, K. Saito, D. Shibata

    Genome Inform. 雑誌 Japanese Society for Bioinformatics   23   117 - 127   2009年12月

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    共著区分:共著  

  • Practical network approaches and biologic interpretations of co-expression analysis in plants 査読

    Y. Ogata, D. Shibata

    Plant Biotechnol. 雑誌 Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology   26   3 - 8   2009年03月

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    共著区分:共著  

  • Characterization of the ABA-regulated global responses to dehydration in Arabidopsis by metabolomics 査読

    K. Urano, K. Maruyama, Y. Ogata, Y. Morishita, M. Takeda, N. Sakurai, H. Suzuki, K. Saito, D. Shibata, M. Kobayashi, K. Yamaguchi-Shinozaki, K. Shinozaki

    Plant J. 雑誌 John Wiley & Sons, Inc.   57   1065 - 1078   2009年01月

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    共著区分:共著  

  • KAGIANA: An Excel-based tool for retrieving summary information on Arabidopsis genes 査読

    Y. Ogata, N. Sakurai, K. Aoki, H. Suzuki, K. Okazaki, K. Saito, D. Shibata

    Plant Cell Physiol. 雑誌 The Japanese Society of Plant Physiologists   50   173 - 177   2009年01月

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    共著区分:共著  

  • Over-expression of transcription associated factor gene co-expressed with the genes of mevalonate pathway, upstream of isoprenoid biosynthesis, in Arabidopsis cultured cells 査読

    R. Sano, Y. Ogata, H. Suzuki, Y. Ogawa, T. Dansako, N. Sakurai, K. Okazaki, K. Aoki, K. Saito, D. Shibata

    Plant Biotechnol. 雑誌 Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology   25   583 - 587   2008年12月

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    共著区分:共著  

  • Metabolite annotations based on the integration of mass spectral information 査読

    Y. Iijima, Y. Nakamura, Y. Ogata, K. Tanaka, N. Sakurai, K. Suda, T. Suzuki, H. Suzuki, K. Okazaki, M. Kitayama, S. Kanaya, K. Aoki, D. Shibata

    Plant J. 雑誌 John Wiley & Sons, Inc.   54   949 - 962   2008年06月

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    共著区分:共著  

  • Metabolic profiling of flavonoids in Lotus japonicus using liquid chromatography Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry 査読

    H. Suzuki, R. Sasaki, Y. Ogata, Y. Nakamura, N. Sakurai, M. Kitajima, H. Takayama, S. Kanaya, K. Aoki, D. Shibata, K. Saito

    Phytochemistry 雑誌 Elsevier Ltd.   69   99 - 111   2008年01月

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    共著区分:共著  

  • Approaches for extracting practical information from gene co-expression networks in plant biology 査読

    K. Aoki, Y. Ogata, D. Shibata

    Plant Cell Physiol. 雑誌 The Japanese Society of Plant Physiologists   48   381 - 390   2007年03月

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    共著区分:共著  

  • Introduction and virification of a novel method for measuring wood fiber length using a single cross section in Acacia mangium 査読

    K. Honjo, Y. Ogata, M. Fujita

    Trees 雑誌 Springer Verlag   20   356 - 362   2006年06月

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    共著区分:共著  

  • Z-axis calibration in optical sectioning from xylem cross sections for grain angle measurement 査読

    Y. Ogata, M. Fujita

    IAWA J. 雑誌 International Association of Wood Anatomists   26   427 - 441   2005年12月

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    共著区分:共著  

  • New anatomical method of grain measurement using confocal microscopy and image cross-correlation 査読

    Y. Ogata, M. Fujita

    Trees 雑誌 Springer Verlag   19   73 - 80   2005年01月

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    共著区分:共著  

  • 木部細胞形態の定量的画像処理のための環境設定(第2報)フィルムスキャナによる超広領域画像の非顕微鏡的サンプリングの試み 査読

    尾形善之、門川朋樹、藤田稔

    木材学会誌 雑誌 日本木材学会   48   341 - 347   2003年09月

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    共著区分:共著  

  • Macroscopic and anatomical investigation of interlocked grain in Acacia mangium 査読

    Y. Ogata, T. Nobuchi, M. Fujita, M.H. Sahri

    IAWA J. 雑誌 International Association of Wood Anatomists   24   13 - 26   2003年03月

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    共著区分:共著  

  • Asynchronous wood formation in young Acacia mangium planted in Malaysia 査読

    Y. Ogata, T. Nobuchi, M. Fujita, M.H. Sahri

    J. Wood Sci. 雑誌 The Japan Wood Research Society   48   89 - 94   2002年04月

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    共著区分:共著  

  • Growth rings and tree growth in young para rubber trees from Peninsular Malaysia 査読

    Y. Ogata, T. Nobuchi, M. Fujita

    IAWA J. 雑誌 International Association of Wood Anatomists   22   43 - 56   2001年03月

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    共著区分:共著  

  • An analysis of the seasonality of wood formation in cinnamon trees and eucalyptuses by knife-cutting method 査読

    Y. Ogata, T. Nobuchi, M. Fujita

    Bull. Kyoto Univ. For. 雑誌 Kyoto University   68   116 - 126   1996年12月

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    共著区分:共著  

  • Seasonal characteristics of wood formation in Hopea odorata and Shorea henryana 査読

    T. Nobuchi, Y. Ogata, S. Siripatanadilok

    IAWA J. 雑誌 International Association of Wood Anatomists   16   361 - 369   1995年12月

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    共著区分:共著  

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書籍等出版物

  • 未利用バイオクスの活用技術と事業性評価.(バイオマス利用の設計図入手を目指した物質・情報資源の探索)

    菊地淳、尾形善之( 担当: 共著)

    サイエンス&テクノロジー株式会社  2010年09月 

  • Bioinformatics tools to discover co-expressed genes in plants

    Y. Ogata, N. Sakurai, N.J. Provart, D. Steinhauser, L. Krall( 担当: 共著)

    VILEY-VCH Verlag  2008年06月 

  • Growth rings and tree growth in young para rubber trees from Peninsular Malaysia

    Y. Ogata, T. Nobuchi, M. Fujita( 担当: 共著)

    UPM Press  2008年04月 

  • Seasonal characteristics of wood formation in Hopea odorata and Shorea henryana

    T. Nobuchi, Y. Ogata, S. Siripatanadilok( 担当: 共著)

    UPM Press  2008年04月 

講演・口頭発表等

  • Gcorn fungi ―ゲノム規模配列相同性解析により構築した遺伝子ホモ ログのデータベースから見える種分化と遺伝子進化の相違 国内会議

    河内大雅、井貫雄太、尾形善之

    第44回日本分子生物学会年会  2021年11月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • バクテリア遺伝子の効率的な相同性解析手法の開発 国内会議

    北山瑠璃、尾形善之

    第44回日本分子生物学会年会  2021年11月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 馬糞マイクロバイオームに基づく体調診断に対する有効性の統計学的な評価 国内会議

    尾形善之、井貫雄太

    日本ウマ科学会第33回学術集会  2020年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

産業財産権等

  • 相関ネットワーク解析プログラム

    鈴木秀幸、萬年一斗、柴田大輔、尾形善之

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    産業財産権の種類:特許権 

    特許番号/登録番号:特許第6318334号 

産学官連携可能研究(シーズ)概要

  • 遺伝子の配列相同性解析

  • 各種生物のオミクス解析

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    哺乳類、植物、菌類を含め各種生物のゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、メタゲノムデータの解析

科研費

  • 都市緑地の植生を環境DNAメタバーコーディング法で把握するための基礎的研究

    2021年

担当授業科目

  • 植物バイオテクノロジー概論

    2021年度    

  • 初年次ゼミナール【バイオインフォマティクス:生物を情報で読み解く】

    2021年度    

  • 生命環境科学入門

    2021年度    

  • バイオインフォマティクス特論

    2021年度    

  • 資源植物学特論

    2021年度    

  • 生物統計学

    2021年度    

  • バイオテクノロジー基礎実験

    2021年度   実習  

  • 植物バイオサイエンス卒業研究

    2021年度    

  • 植物バイオサイエンス演習

    2021年度    

  • ゲノム解析の基礎

    2021年度    

  • 植物バイオサイエンス情報処理演習

    2021年度    

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