2022/07/13 更新

写真a

イワタ ユウジ
岩田 雄二
Iwata Yuji
担当
大学院農学研究科 応用生物科学専攻 准教授
農学部 応用生物科学科
職名
准教授
所属
農学研究院
連絡先
メールアドレス
ホームページ
所属キャンパス
中百舌鳥キャンパス

担当・職階

  • 大学院農学研究科 応用生物科学専攻 

    准教授  2022年04月 - 継続中

  • 農学部 応用生物科学科 

    准教授  2022年04月 - 継続中

取得学位

  • 博士(バイオサイエンス) ( 奈良先端科学技術大学院大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 植物分子、生理科学

  • ライフサイエンス / 応用分子細胞生物学

研究概要

  • RNAを介した遺伝子発現制御機構に関する研究

  • 植物のマイクロRNA生成機構に関する研究

  • 植物の小胞体ストレス応答に関する研究

研究歴

  • 植物におけるマイクロRNA生成・機能の分子機構

    個人研究

    2013年03月 - 継続中 

  • RNAを介した遺伝子発現制御機構の解明

    個人研究

    2013年03月 - 継続中 

  • 植物の小胞体ストレス応答の分子機構と生理機能の解明

    個人研究

    2013年03月 - 継続中 

所属学協会

  • 日本RNA学会

    2018年04月 - 継続中   国内

  • 日本分子生物学会

    2017年04月 - 継続中   国内

  • 日本植物細胞分子生物学会

    2013年04月 - 継続中   国内

  • 日本植物生理学会

    2013年04月 - 継続中   国内

  • American Society of Plant Biologists

    2009年04月 - 継続中   国外

論文

  • Unpaired nucleotides on the stem of microRNA precursor are important for precise cleavage by Dicer-like 1 in Arabidopsis.

    Hirata R, Makabe T, Mishiba KI, Koizumi N, Hamdan SM, Iwata Y

    Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   27 ( 4 )   280 - 292   2022年04月( ISSN:1356-9597

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  • Zeocin-induced DNA double-strand breaks affect endoreduplication and cell size in radish cotyledon epidermis

    Misa Matsuda, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Kei Ichiro Mishiba

    Cytologia   85 ( 3 )   245 - 249   2020年09月( ISSN:0011-4545

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    © 2020 The Japan Mendel Society. Endoreduplication is a variant of the cell cycle in which DNA replication occurs without mitosis. The physiological role of endoreduplication in plants is, however, not yet fully elucidated. We have conducted flow cytometric analysis to investigate the effect of DNA double-strand breaks (DSBs) on endoreduplication in radish (Raphanus sativus var. longipinnatus) cotyledons, where the proportion of higher ploidy cells was increased by the treatment of DSBs-inducing agent Zeocin. To understand the microscopic details of the endoreduplication caused by the Zeocin-induced DSBs, in this study, we examined nuclear DNA content and cell size in epidermal cells of radish cotyledons after Zeocin treatment. Enlargement of the cell size and puzzled-shape of the epidermal pavement cells was compromised by Zeocin treatments. Fluorocytometric analysis showed that the nuclear DNA distribution of the Zeocin-treated epidermis was distinct from that of the untreated epidermis; that is, a frequency of the nuclei with higher ploidy in the Zeocin-treated epidermis was higher than that in the untreated epidermis. A positive correlation between cell size and nuclear DNA content was found in both Zeocin-treated and -untreated epidermis, but that in the Zeocin-treated epidermis was less relevant than that in the untreated cotyledons. These results suggest that the Zeocin-stimulated ectopic endoreduplication compromises cell expansion during epidermal cell development.

    DOI: 10.1508/cytologia.85.245

  • Genetic engineering of eggplant accumulating β-carotene in fruit

    Kei-Ichiro Mishiba, Kae Nishida, Naoto Inoue, Tomoya Fujiwara, Shunji Teranishi, Yuji Iwata, Satomi Takeda, Nozomu Koizumi

    Plant Cell Rep   39 ( 8 )   2020年08月

  • Unfolded protein-independent IRE1 activation contributes to multifaceted developmental processes in Arabidopsis. 査読

    Kei-Ichiro Mishiba, Yuji Iwata, Tomofumi Mochizuki, Atsushi Matsumura, Nanami Nishioka, Rikako Hirata, Nozomu Koizumi

    Life Sci Alliance 雑誌   2 ( 5 )   2019年10月

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    共著区分:共著  

  • Deficiency in the double-stranded RNA binding protein HYPONASTIC LEAVES1 increases sensitivity to the endoplasmic reticulum stress inducer tunicamycin in Arabidopsis 査読

    Rikako Hirata, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi, Yuji Iwata

    BMC Research Notes 雑誌   12   2019年09月

  • DNA double-strand breaks promote endoreduplication in radish cotyledon. 査読

    Misa Matsuda, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Kei-ichiro Mishiba

    Plant Cell Rep 雑誌   37   913 - 21   2018年

  • Interplay between unfolded protein response and reactive oxygen species: a dynamic duo. 査読

    Rengin Ozgur, Baris Uzilday, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Ismail Turkan

    J Exp Bot 雑誌   69   3333 - 45   2018年

  • The unfolded protein response 査読

    Kazuki Tabara, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi

    Methods Mol Biol 雑誌   1691   223 - 30   2018年

  • CRISPR/Cas9-mediated homologous recombination in tobacco. 査読

    Ayumi Hirohata, Izumi Sato, Kimihiko Kaino, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Kei-ichiro Mishiba

    Plant Cell Rep 雑誌   2018年

  • Constitutive BiP protein accumulation in Arabidopsis mutants defective in a gene encoding chloroplast-resident stearoyl-acyl carrier protein desaturase. 査読

    Yuji Iwata, Tsukasa Iida, Toshihiro Matsunami, Yu Yamada, Kei-ichiro Mishiba, Takumi Ogawa, Tetsuya Kurata, Nozomu Koizumi

    Genes Cells 雑誌   23   456 - 65   2018年

  • A 64-bp sequence containing the GAAGA motif is essential for CaMV-35S promoter methylation in gentian. 査読

    Asahi Shimada, Azusa Okumura, Satoshi Yamasaki, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Masahiro Nishihara, Kei-ichiro Mishiba

    Biochim Biophys Acta 雑誌   1860   861 - 9   2017年

  • Overexpression of the endoplasmic reticulum stress-inducible gene TIN1 causes abnormal pollen surface morphology in Arabidopsis. 査読

    Yuji Iwata, Tsuneyo Nishino, Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol 雑誌   34   173 - 6   2017年

  • Inositol-requiring enzyme 1 affects meristematic division in roots under moderate salt stress in Arabidopsis. 査読

    Yuji Iwata, Fumika Yagi, Sae Saito, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol 雑誌   34   159 - 63   2017年

  • Activation of the Arabidopsis membrane-bound transcription factor bZIP28 is mediated by site-2 protease, but not site-1 protease. 査読

    Yuji Iwata, Makoto Ashida, Chisa Hasegawa, Kazuki Tabara, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi

    Plant J 雑誌   91   408 - 15   2017年

  • CaMV-35S promoter sequence- specific DNA methylation in lettuce. 査読

    Azusa Okumura, Asahi Shimada, Satoshi Yamasaki, Takuya Horino, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Masahiro Nishihara, Kei-ichiro Mishiba

    Plant Cell Rep 雑誌   35   43 - 51   2016年

  • Effect of light and auxin transport inhibitors on endoreduplication in hypocotyl and cotyledon. 査読

    Riko Tanaka, Makoto Amijima, Yuji Iwata, Koizumi, Kei-ichiro Mishiba

    Plant Cell Rep 雑誌   35   2539 - 47   2016年

  • Tunicamycin-induced inhibition of protein secretion into culture medium of Arabidopsis T87 suspension cells through mRNA degradation on the endoplasmic reticulum. 査読

    Yuji Iwata, Noriko Hayashi, Kazuki Tabara, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi

    Biosci Biotechnol Biochem 雑誌   80   1168 - 71   2016年

  • Arabidopsis tRNA ligase completes the cytoplasmic splicing of bZIP60 mRNA in the unfolded protein response. 査読

    Yukihiro Nagashima, Yuji Iwata, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi

    Biochem Biophys Res Commun 雑誌   470   941 - 6   2016年

  • Exogenous salicylic acid activates two signaling arms of the unfolded protein response in Arabidopsis 査読

    Yukihiro Nagashima, Yuji Iwata, Makoto Ashida, Kei-ichiro Mishiba, Nozomu Koizumi

    Plant Cell Physiol 雑誌   55   1772 - 8   2014年

  • The polar auxin transport inhibitor TIBA inhibits endoreduplication in dark grown spinach hypocotyls 査読

    Makoto Amijima, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Kei-ichiro Mishiba

    Plant Sci 雑誌   225   45 - 54   2014年

  • Dissecting the interactions of SERRATE with RNA and DICER-LIKE 1 in Arabidopsis microRNA precursor processing. 査読

    Yuji Iwata, Masateru Takahashi, Nina V Fedoroff, Samir M Hamdan

    Nucleic Acids Res   2013年

  • An attempt to detect siRNA-mediated genomic DNA modification by artificially induced mismatch siRNA in Arabidopsis. 査読

    Yosuke Miyagawa, Jun Ogawa, Yuji Iwata, Nozomu Koizumi, Kei-ichiro Mishiba

    PLoS ONE 雑誌   8   2013年

  • Role of the plant-specific endoplasmic reticulum stress-inducible gene TIN1 in the formation of the pollen surface structure in Arabidopsis thaliana. 査読

    Yuji Iwata, Tsuneyo Nishino, Megumi Iwano, Seiji Takayama and Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol   28   51 - 56   2012年

  • Plant transducers of the endoplasmic reticulum unfolded protein response. 査読

    Yuji Iwata and Nozomu Koizumi

    Trends Plant Sci   17   720 - 727   2012年

  • Arabidopsis IRE1 catalyses unconventional splicing of bZIP60 mRNA to produce the active transcription factor. 査読

    Yukihiro Nagashima, Kei-ichiro Mishiba, Eiji Suzuki, Yukihisa Shimada, Yuji Iwata and Nozomu Koizumi

    Sci Rep   1   2011年

  • 植物における小胞体タンパク質品質管理―病原菌認識機構の解析から見えて来たもの―. 査読

    小泉望, 岩田雄二

    化学と生物   49   88 - 93   2010年

  • Characterization of a plant-specific gene induced by endoplasmic reticulum stress in Arabidopsis thaliana. 査読

    Yuji Iwata, Tsuneyo Nishino, Seiji Takayama and Nozomu Koizumi

    Biosci Biotechnol Biochem   74   2087 - 2097   2010年

  • Transcriptomic response of Arabidopsis thaliana to tunicamycin-induced endoplasmic reticulum stress. 査読

    Yuji Iwata, Masayo Sakiyama, Mi-Hyun Lee and Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol   27   161 - 171   2010年

  • The Arabidopsis membrane-bound transcription factor AtbZIP60 is a novel plant-specific endoplasmic reticulum stress transducer. 査読

    Yuji Iwata, Nina Fedoroff and Nozomu Koizumi

    Plant Signal Behav   4   514 - 516   2009年

  • Characteristics of the nuclear form of the Arabidopsis transcription factor AtbZIP60 during the endoplasmic reticulum stress response. 査読

    Yuji Iwata, Mari Yoneda, Yuki Yanagawa and Nozomu Koizumi

    Biosci Biotechnol Biochem   73   865 - 869   2009年

  • Transcriptional regulation of an Arabidopsis gene encoding a CCT domain-containing protein during endoplasmic reticulum stress. 査読

    Yuji Iwata, Takeo Yamada and Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol   25   397 - 402   2008年

  • Arabidopsis bZIP60 is a proteolysis-activated transcription factor involved in the endoplasmic reticulum stress response. 査読

    Yuji Iwata, Nina V Fedoroff and Nozomu Koizumi

    Plant Cell   20   3107 - 3121   2008年

  • Endoplasmic reticulum stress response and regulated intramembrane proteolysis in plants. 査読

    Hiromi Tajima, Yuji Iwata and Nozomu Koizumi

    Plant Biotechnol   25   271 - 278   2008年

  • Construction of a binary vector for transformation of Arabidopsis thaliana with a new selection marker. 査読

    Nozomu Koizumi and Yuji Iwata

    Biosci Biotechnol Biochem   72   3041 - 3043   2008年

  • Identification of an Arabidopsis transmembrane bZIP transcription factor involved in the endoplasmic reticulum stress response. 査読

    Hiromi Tajima, Yuji Iwata, Megumi Iwano, Seiji Takayama and Nozomu Koizumi

    Biochem Biophys Res Commun   374   242 - 247   2008年

  • An Arabidopsis transcription factor, AtbZIP60, regulates the endoplasmic reticulum stress response in a manner unique to plants. 査読

    Yuji Iwata and Nozomu Koizumi

    Proc Natl Acad Sci USA   102   5280 - 5285   2005年

  • Unfolded protein response followed by induction of cell death in cultured tobacco cells treated with tunicamycin. 査読

    Yuji Iwata and Nozomu Koizumi

    Planta   220   804 - 807   2005年

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書籍等出版物

  • Plant Transcription Factors: evolutionary, Structural and Fundcional Aspects.

    Yuji Iwata, Nozomu Koizumi( 担当: 共著)

    Elsevier  2015年 

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    担当ページ:385-394  

  • Plant Transcription Factors

    Yuji Iwata, Mi-Hyun Lee and Nozomu Koizumi( 担当: 共著)

    Humana Press  2010年 

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    担当ページ:107-117  

講演・口頭発表等

  • シロイヌナズナmicroRNA生成におけるDicer-Like1の基質認識機構に関する研究 国内会議

    平田梨佳子,三柴啓一郎,小泉望,岩田雄二

    第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会  2021年09月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • キュウリモザイクウイルス2bタンパク質とシロイヌナズナDicer-Like1タンパク質の相互作用 国内会議

    木上椋介,徳田慎也,三柴啓一郎,小泉望,岩田雄二

    第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会  2021年09月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • シロイヌナズナmicroRNA生成におけるDicer-Like1 N末端領域の機能解析 国内会議

    平田梨佳子,三柴啓一郎,小泉望,Samir M. Hamdan,岩田雄二

    第62回日本植物生理学会年会  2021年03月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • シロイヌナズナmicroRNA生成におけるRNA二次構造とDicer-Like1 N末端領域の重要性 国内会議

    平田梨佳子,三柴啓一郎,小泉望,Samir M. Hamdan,岩田雄二

    第43回日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 果実にβ-カロテンを蓄積させた遺伝子組換えナスの作出 国内会議

    4. 三柴啓一郎、西田佳永、井上直人、藤原知也、寺西俊滋、岩田雄二、竹田恵美、小泉望

    園芸学会令和2年度春季大会  2020年03月 

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    会議種別:ポスター発表  

担当授業科目

  • 植物バイオサイエンスへの招待

    2021年度    

  • 植物バイオサイエンス卒業研究

    2021年度    

  • 植物バイオサイエンス演習

    2021年度    

  • 生物学実験

    2021年度   実習  

  • 生物学実験

    2021年度   実習  

  • 植物分子育種学特論

    2021年度    

  • 植物発生・形態学

    2021年度    

  • 植物バイオテクノロジー概論

    2021年度    

  • 生化学基礎実験

    2021年度   実習  

  • バイオテクノロジー基礎実験

    2021年度   実習  

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社会貢献活動

  • 授業体験WEEK 植物発生・形態学

    2018年04月 - 2019年03月