2024/04/08 更新

写真a

マスイ リョウジ
増井 良治
MASUI Ryoji
担当
大学院理学研究科 生物学専攻 教授
理学部 生物学科
職名
教授
所属
理学研究院
所属キャンパス
杉本キャンパス

担当・職階

  • 大学院理学研究科 生物学専攻 

    教授  2022年04月 - 継続中

  • 理学部 生物学科 

    教授  2022年04月 - 継続中

取得学位

  • 博士(理学) ( 大阪大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 構造生物化学

研究歴

  • DNA 修復システム,ヌクレオチド代謝システム,翻訳後修飾

    翻訳後修飾、DNA修復、ヌクレオチド代謝  個人研究

    1993年04月 - 継続中 

所属学協会

  • 日本生化学会

      国内

  • 日本分子生物学会

      国内

  • 日本蛋白質科学会

      国内

  • 極限環境生物学会

      国内

委員歴(学外)

  • 評議員   日本生化学会  

    2017年04月 - 継続中 

受賞歴

  • 第9回OCARINA国際シンポジウムポスター賞

    2018年03月  

  • 第39回日本分子生物学会年会優秀ポスター賞

    2016年11月  

  • 第17回極限環境生物学会ポスター賞

    2016年11月  

  • 第85回日本生化学会大会 鈴木紘一メモリアル賞

    2012  

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    受賞国:日本国

  • 第84回日本生化学会大会 鈴木紘一メモリアル賞

    2011  

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    受賞国:日本国

  • 第10回日本蛋白質科学会年会 ポスター賞

    2010  

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    受賞国:日本国

  • 第10回日本蛋白質科学会年会 ポスター賞

    2010  

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    受賞国:日本国

  • 第10回日本蛋白質科学会年会 ポスター賞受

    2010  

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    受賞国:日本国

  • 日本生化学会 J. Biochem.論文賞

    2009  

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    受賞国:日本国

  • 第9回日本蛋白質科学会年会 ポスター賞

    2009  

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    受賞国:日本国

  • 第56回日本生化学会近畿支部例会 優秀発表賞

    2009  

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    受賞国:日本国

  • 日本生化学会 J. Biochem. 論文賞

    2000  

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    受賞国:日本国

  • 第11回 Protein Society シンポジウム ベストポスター賞

    1997  

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職務経歴(学外)

  • 大阪大学   大学院理学研究科   准教授

    2007年12月 - 2014年09月

  • 大阪大学   大学院理学研究科   講師

    2002年04月 - 2007年11月

  • 理化学研究所   播磨研究所   連携研究員

    1999年10月 - 2013年03月

  • 大阪大学   大学院理学研究科   助手

    1996年04月 - 2002年03月

  • 大阪大学   理学部   教務員

    1993年04月 - 1996年03月

学歴

  • 大阪大学大学院   理学研究科   生物化学専攻   博士課程   卒業・修了

    1990年04月 - 1993年03月

  • 大阪大学大学院   理学研究科   生物化学専攻   修士課程   卒業・修了

    1988年04月 - 1990年03月

  • 大阪大学   理学部   生物学科     卒業・修了

    1983年04月 - 1988年03月

論文

  • Structural and biochemical characterizations of Thermus thermophilus HB8 transketolase producing a heptulose 査読

    Mochizuki, A., Yoshida, H., Masui, R., Izumori, K., Kamitori, S.

    Applied Microbiology and Biotechnology   107 ( 1 )   233 - 245   2023年01月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1007/s00253-022-12297-z

    その他URL: https://link.springer.com/article/10.1007/s00253-022-12297-z

  • Crystal structure of a nucleotide-binding domain of fatty acid kinase FakA from Thermus thermophilus HB8 査読

    Nakatani, M., Nakahara, Shun-Ya, Fukui, K., Urano, M., Fujii, Y., Murakawa, T., Baba, S., Kumasaka, T., Okanishi, H., Kanai, Y., Yano, T., Masui. R.

    Journal of Structural Biology   214 ( 4 )   107904 - 107904   2022年12月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1016/j.jsb.2022.107904

    その他URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1047847722000740?via%3Dihub

  • Structural changes induced by ligand-bidning drastically increase the thermostability of the Ser/Thr protein kinase TpkD from Thermus thermophilus HB8 査読

    Fujino, Y., Miyagawa, T., Torii, M., Inoue, M., Fujii, Y., Okanishi, H., Kanai, Y., Masui, R.

    FEBS Letters   595 ( 2 )   264 - 274   2021年01月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • The crystal structures of Thermus thermophilus CMP kinase complexed with a phosphoryl group acceptor and donor 査読

    Ryosuke Mega, Noriko Nakagawa, Seiki Kuramitsu, Ryoji Masui

    PLoS ONE   15 ( 3 )   e0233689   2020年05月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Resistance to UV irradiation caused by inactivation of nurA and herA genes in Thermus thermophilus 査読

    Fujii, Y., Inoue, M., Fukui, K., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Bacteriology   200 ( 16 )   e00201-18   2018年07月( ISSN:0021-9193

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    NurA and HerA are thought to be essential proteins for DNA end resection in archaeal homologous recombination systems. Thermus thermophilus, an extremely thermophilic eubacterium, has proteins that exhibit significant sequence similarity to archaeal NurA and HerA. To unveil the cellular function of NurA and HerA in T. thermophilus, we performed phenotypic analysis of disruptant mutants of nurA and herA with or without DNA-damaging agents. The nurA and herA genes were not essential for survival, and their deletion had no effect on cell growth and genome integrity. Unexpectedly, these disruptants of T. thermophilus showed increased resistance to UV irradiation and mitomycin C treatment. Further, these disruptants and the wild type displayed no difference in sensitivity to oxidative stress and a DNA replication inhibitor. T. thermophilus NurA had nuclease activity, and HerA had ATPase. The overexpression of loss-of-function mutants of nurA and herA in the respective disruptants showed no complementation, suggesting their enzymatic activities were involved in the UV sensitivity. In addition, T. thermophilus NurA and HerA interacted with each other in vitro and in vivo, forming a complex with 2:6 stoichiometry. These results suggest that the NurA-HerA complex has an architecture similar to that of archaeal counterparts but that it impairs, rather than promotes, the repair of photoproducts and DNA cross-links in T. thermophilus cells. This cellular function is distinctly different from that of archaeal NurA and HerA.

    DOI: 10.1128/JB.00201-18

    PubMed

  • Indispensable residue for uridine binding in the uridine-cytidine kinase family 査読

    Tomoike, F., Nakagawa, N., Fukui, K., Yano, T., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Biochemistry and Biophysics Reports1   11   93 - 98   2017年07月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The Lon protease-like domain in the bacterial RecA paralog RadA is required for DNA binding and repair 査読

    Inoue Masao, Fukui Kenji, Fujii Yuki, Nakagawa Noriko, Yano Takato, Kuramitsu Seiki, Masui Ryoji

    Journal of Biological Chemistry   292 ( 23 )   9801 - 9814   2017年06月( ISSN:0021-9258

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    Homologous recombination (HR) plays an essential role in the maintenance of genome integrity. RecA/Rad51 paralogs have been recognized as an important factor of HR. Among them, only one bacterial RecA/Rad51 paralog, RadA, is involved in HR as an accessory factor of RecA recombinase. RadA has a unique Lon protease-like domain (LonC) at its C terminus, in addition to a RecA-like ATPase domain. Unlike Lon protease, RadA's LonC domain does not show protease activity but is still essential for RadA-mediated DNA repair. Reconciling these two facts has been difficult because RadA's tertiary structure and molecular function are unknown. Here, we describe the hexameric ring structure of RadA's LonC domain, as determined by X-ray crystallography. The structure revealed the two positively charged regions unique to the LonC domain of RadA are located at the intersubunit cleft and the central hole of a hexameric ring. Surprisingly, a functional domain analysis demonstrated the LonC domain of RadA binds DNA, with site-directed mutagenesis showing that the two positively charged regions are critical for this DNA-binding activity. Interestingly, only the intersubunit cleft was required for the DNA-dependent stimulation of ATPase activity of RadA, and at least the central hole was essential for DNA repair function. Our data provide the structural and functional features of the LonC domain and their function in RadA-mediated DNA repair.

    DOI: 10.1074/jbc.M116.770180

    PubMed

  • Proteome-wide identification of lysine propionylation in thermophilic and mesophilic bacteria: Geobacillus kaustophilus, Thermus thermophilus, Escherichia coli, Bacillus subtilis, and Rhodothermus marinus 査読

    Okanishi Hiroki, Kim Kwang, Masui Ryoji, Kuramitsu Seiki

    Extremophiles   21 ( 2 )   283 - 296   2017年03月( ISSN:1431-0651

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1007/s00792-016-0901-3

  • Proteome-wide identification of lysine succinylation in thermophilic and mesophilic bacteria 査読

    Okanishi Hiroki, Kim Kwang, Fukui Kenji, Yano Takato, Kuramitsu Seiki, Masui Ryoji

    Biochimica et Biophysica Acta   1865 ( 2 )   232 - 242   2017年02月( ISSN:1570-9639

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.009

  • A specific single-stranded DNA induces a distinct conformational change in the nucleoid-associated protein HU 査読

    Nishida, Y., Ikeya, T., Mikawa, T., Inoue, J., Ito, Y., Shintani, Y., Masui, R., Kuramitsu, S., Takashima, S.

    Biochem. Biophys, Rep.   8   318 - 324   2016年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • A putative adenosine kinase family protein possesses adenosine diphosphatase activity 査読

    Tomoike Fumiaki, Tsunetou Akiko, Kim Kwang, Nakagawa Noriko, Kuramitsu Seiki, Masui Ryoji

    Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   80 ( 11 )   2138 - 2143   2016年08月( ISSN:0916-8451

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1080/09168451.2016.1214532

  • Crystal structures of a subunit of the formyl­glycinamide ribonucleotide amidotransferase, PurS, from Thermus thermophilus, Sulfolobus tokodaii and Methanocaldococcus jannaschii 査読

    Watanabe, Y., Yanai, H., Kanagawa, M., Suzuki, S., Tamura, S., Okada, K., Baba, S., Kumasaka, T., Agari, Y., Chen, L., Fu, Z.-Q., Chrzas, J., Wang, B.-C., Nakagawa, N., Ebihara, A., Masui, R., Kuramitsu, S., Yokoyama, S., Sampei, G., Kawai, G.

    Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications   72 ( 8 )   627 - 635   2016年08月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Molecular mechanisms of substrate specificities of uridine-cytidine kinase 査読

    Tanaka Wataru, Masui Ryoji, Kuramitsu Seiki, Shigeta Yasuteru, Shoji Mitsuo, Tomoike Fumiaki, Ujiie Yuzuru, Hanaoka Kyohei, Harada Ryuhei, Kayanuma Megumi, Kamiya Katsumasa, Ishida Toyokazu

    Biophysics and Physicobiology   13 ( 0 )   77 - 84   2016年06月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

    A uridine-cytidine kinase (UCK) catalyzes the phosphorylation of uridine (Urd) and cytidine (Cyd) and plays a significant role in the pyrimidine-nucleotide salvage pathway. Unlike ordinary ones, UCK from <i>Thermus thermophilus</i> HB8 (ttCK) loses catalytic activity on Urd due to lack of a substrate binding ability and possesses an unusual amino acid, i.e. tyrosine 93 (Tyr93) at the binding site, whereas histidine (His) is located in the other UCKs. Mutagenesis experiments revealed that a replacement of Tyr93 by His or glutamine (Gln) recovered catalytic activity on Urd. However, the detailed molecular mechanism of the substrate specificity has remained unclear. In the present study, we performed molecular dynamics simulations on the wild-type ttCK, two mutant ttCKs, and a human UCK bound to Cyd and three protonation forms of Urd to elucidate their substrate specificity. We found three residues, Tyr88, Tyr/His/Gln93 and Arg152 in ttCKs, are important for recognizing the substrates. Arg152 contributes to induce a closed form of the binding site to retain the substrate, and the N3 atom of Urd needed to be deprotonated. Although Tyr88 tightly bound Cyd, it did not sufficiently bind Urd because of lack of the hydrogen bonding. His/Gln93 complemented the interaction of Tyr88 and raised the affinity of ttCK to Urd. The crucial distinction between Tyr and His or Gln was a role in the hydrogen-bonding network. Therefore, the ability to form both hydrogen-bonding donor and accepter is required to bind both Urd and Cyd.

    DOI: 10.2142/biophysico.13.0_77

    CiNii Article

  • Structural and biochemical studies on the reaction mechanism of uridine-cytidine kinase 査読

    Tomoike Fumiaki, Nakagawa Noriko, Kuramitsu Seiki, Masui Ryoji

    Protein Journal   34 ( 6 )   411 - 420   2015年12月( ISSN:1572-3887

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    DOI: 10.1007/s10930-015-9636-8

  • Roles of Mn-catalase and a possible heme peroxidase homologue in protection from oxidative stress in Thermus thermophilus 査読

    Ebihara, A., Manzoku, M. Fukui, K., Shimada, A., Morita, R., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Extremophiles   19 ( 4 )   775 - 785   2015年07月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

    Hydrogen peroxide (H2O2) produces hydroxyl radicals that directly attack a variety of biomolecules and cause severe cellular dysfunction. An extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8, possesses at least three enzymes that can scavenge H2O2: manganese-containing catalase (TTHA0122, MnCAT), a possible peroxiredoxin homologue (TTHA1300), and a possible heme peroxidase (HPX) homologue (TTHA1714). To investigate the roles of these proteins, we attempted to disrupt each of these genes in T. thermophilus HB8. Although we were able to completely disrupt ttha1300, we were unable to completely delete ttha0122 and ttha1714 because of polyploidy. Quantitative real-time PCR showed that, compared to the wild type, 31 % of ttha0122 and 11 % of ttha1714 remained in the ∆ttha0122 and ∆ttha1714 disruption mutants, respectively. Mutants with reduced levels of ttha0122 or ttha1714 exhibited a significant increase in spontaneous mutation frequency. ∆ttha1714 grew slower than the wild type under normal conditions. ∆ttha0122 grew very poorly after exposure to H2O2. Moreover, ∆ttha0122 did not show H2O2-scavenging activity, whereas ∆ttha1300 and ∆ttha1714 scavenged H2O2, a property similar to that exhibited by the wild type. MnCAT purified from T. thermophilus HB8 cells scavenged H2O2 in vitro. The recombinant form of the possible HPX homologue, reconstituted with hemin, showed peroxidase activity with H2O2 as an oxidant substrate. Based on these results, we propose that not only MnCAT but also the possible HPX homologue is involved in protecting the cell from oxidative stress in T. thermophilus.

  • The role of ribonucleases in regulating global mRNA levels in the model organism Thermus thermophilus HB8 査読

    Ohyama, H., Sakai, T., Agari, Y., Fukui, K. Nakagawa, N., Shinkai, A., Masui, R., Kuramitsu, S.

    BMC Genomics   15   386   2014年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structural insights of post-translational modification sites in the proteome of Thermus thermophilus 査読

    Masui, R., Takahata, Y., Inoue, M., Iio, Y., Okanishi, H., Kim, K., Nakagawa, N., Yura. K., Kuramitsu, S.

    Journal of Structural and Functional Genomics   15 ( 3 )   137 - 151   2014年09月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Lysine propionylation is a prevalent post-translational modification in Thermus thermophilus 査読

    Okanishi, H., Kim, K., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Molecular and Cellular Proteomics   13 ( 9 )   2382 - 2398   2014年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Acetylome with structural mapping reveals the significance of lysine acetylation in Thermus thermophilus 査読

    Okanishi, H., Kim, K., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Journal of Proteome Research   1 ( 9 )   3952 - 3968   2013年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of the ligand-binding form of nanoRNase from Bacteroides fragilis, a member of the DHH/DHHA1 phosphoesterase family of proteins 査読 国際共著

    Uemura, Y., Nakagawa, N., Wakamatsu, T., Kim, K., Montelione, G. T., Hunt, J. F., Kuramitsu, S., Masui, R.

    FEBS Letters   587 ( 16 )   2669 - 2674   2013年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • MutS stimulates the endonuclease activity of MutL in an ATP-hydrolysis-dependent manner 査読

    Shimada, A., Kawasoe, Y., Hata, Y., Takahashi, T., Masui, R., Kuramitsu, S., Fukui, K.

    FEBS Journal   280 ( 14 )   3467 - 3479   2013年07月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Unique substrate specificity of purine nucleoside phosphorylases from Thermus thermophilus 査読

    Tomoike, F., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Extremophiles   17 ( 3 )   505 - 514   2013年05月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Lysine and arginine biosyntheses mediated by a common carrier protein in Sulfolobus 査読

    Ouchi, T., Tomita, T., Horie, A., Yoshita, A., Takahashi, K., Nishida, H., Lassak, K., Taka, H., Mineki, R., Fujimura, T., Kosono, S., Nishiyama, C., Masui, R., Kuramitsu, S., Alberts, S.-J., Kuzuyama, T., Nishiyama, M.

    Nature Chemical Biology   9 ( 4 )   277 - 283   2013年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Alkyltransferase-like protein (Atl1) distinguishes alkylated guanines for DNA repair using cation-pi interactions 査読 国際共著

    Wilkinson, O. J., Latypov, V., Tubbs, J. L., Millington, C. L., Morita, R., Blackburn, H., Marriott, A., McGown, G., Thorncroft, M., Watson, A. J., Connolly, B. A., Grasby, J. A., Masui, R., Hunter, C. A., Tainer, J. A., Margison, G. P., Williams, D. M.

    Proceedings of National Academy of Science, U. S. A.   109 ( 46 )   18755 - 18760   2012年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The role of the PHP domain associated with DNA polymerase X from Thermus thermophilus HB8 in base excision repair 査読

    Nakane, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    DNA Repair   11 ( 11 )   906 - 914   2012年11月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Whole-cell proteome reference maps of an extreme thermophile, Thermus thermophilus HB8 査読

    Kim, K., Okanishi, H., Masui, R., Harada, A., Ueyama, N., Kuramitsu, S.

    Proteomics   12 ( 19-20 )   3063 - 3068   2012年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Close proximity of phosphorylation sites to ligand in the phosphoproteome of the extreme thermophile Thermus thermophilus HB8 査読

    Takahata, Y., Inoue, M., Kim, K., Iio, Y., Miyamoto, M., Masui, R., Ishihama, Y., Kuramitsu, S.

    Proteomics   12 ( 9 )   1414 - 1430   2012年05月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • A non-cold-inducible cold shock protein homolog mainly contributes to translational control under optimal growth conditions 査読

    Tanaka, T., Mega, R., Kim, K., Shinkai, A., Masui, R., Kuramitsu, S., Nakagawa, N.

    FEBS Journal   279 ( 6 )   1014 - 1029   2012年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The structural basis of the kinetic mechanism of a gap-filling X-family DNA polymerase that binds Mg2+-dNTP before binding to DNA 査読

    Nakane, S., Ishikawa, H., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Molecular Biology   417 ( 3 )   179 - 196   2012年03月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • In vivo, in vitro, and X-ray crystallographic analyses suggest the involvement of an uncharacterized TIM barrel protein in protection against oxidative stress 査読

    Nakane, S., Wakamatsu, T., Masui, R., Kuramitsu, S., Fukui, K.

    Journal of Biological Chemistry   286 ( 48 )   41636 - 41646   2011年12月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Commensal symbiotic interrelationship for the growth of Symbiobacterium toebii with its partner bacterium, Geobacillus toebii 査読 国際共著

    Kim, K., Kim, J.-J., Masui, R., Kuramitsu, S., Sung, M.-H.

    BMC Research Notes   4   437   2011年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Characterization of C- and N-terminal domains of Aquifex aeolicus MutL endonuclease: N-terminal domain stimulates the endonuclease activity of C-terminal domain in a zinc-dependent manner 査読

    Iino, H., Kim, K., Shimada, A., Masui, R., Kuramitsu, S., Fukui, K.

    Bioscience Reports   31 ( 5 )   309 - 322   2011年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • An alkyltransferase-like protein from Thermus thermophilus HB8 affects the regulation of gene expression in alkylation response 査読

    Morita, R., Hishinuma, H., Ohyama, H., Mega, R., Ohta, T., Nakagawa, N., Agari, Y., Fukui, K., Shinkai, A., Kuramitsu, S., Masui, R.

    The Journal of Biochemistry   150 ( 3 )   327 - 339   2011年09月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • A single amino acid limits the substrate specificity of Thermus thermophilus uridine-cytidine kinase to cytidine 査読

    Tomoike, F., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Biochemistry   50 ( 21 )   4597 - 4607   2011年05月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Inactivation of DNA repair genes mutS and mutL or the anti-recombination gene mutS2 leads to activation of vitamin B1 biosynthesis genes in Thermus thermophilus HB8 査読

    Fukui, K., Wakamatsu, T., Agari, Y., Masui, R., Kuramitsu, S.

    PLoS One   6 ( 4 )   e19053   2011年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • An additional C-terminal loop in endonuclease IV, an apurinic/apyrimidinic endonuclease, controls binding affinity to DNA 査読

    Asano, R., Ishikawa, H., Nakane, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   67 ( 3 )   149 - 155   2011年03月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Role of alkyltransferase-like (ATL) protein in repair of methylated DNA lesions in Thermus thermophilus 査読

    Onodera, T., Morino, K., Tokishita, S., Morita, R., Masui, R., Kuramitsu, S., Ohta, T.

    Mutagenesis   26 ( 2 )   303 - 308   2011年03月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Role of RecJ-like exonuclease with 5'-3' exonuclease in oligo(deoxy)nucleotide degradation 査読

    Wakamatsu, T., Kim, K., Uemura, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Biological Chemistry   286 ( 4 )   2807 - 2816   2011年01月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • A novel single-stranded DNA-specific 3'-5' exonuclease, Thermus thermophilus exonuclease I, is involved in several DNA repair pathways 査読

    Shimada, A., Masui, R., Nakagawa, N., Takahata, Y., Kim, K., Kuramitsu, S., Fukui, K.

    Nucleic Acids Research   38 ( 17 )   5692 - 5705   2010年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Very rapid induction of a cold shock protein by temperature downshift in Thermus thermophilus 査読

    Mega, R., Manzoku, M., Shinkai, A., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Biochemical and Biophysical Research Communication   399 ( 3 )   336 - 340   2010年08月

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    担当区分:最終著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of an archaeal cleavage and polyadenylation specificity factor subunit from Pyrococcus horikoshii 査読

    Nishida, Y., Ishikawa, H., Baba, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Proteins   78 ( 10 )   2395 - 2398   2010年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The first crystal structure of an archaeal metallo-β-lactamase superfamily protein; ST1585 from Sulfolobus tokodaii 査読

    Shimada, A., Ishikawa, H., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Proteins   78 ( 10 )   2399 - 2402   2010年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of ST0929, a putative glycosyl transferase from Sulfolobus tokodaii 査読

    Cielo, C. B., Okazaki, S., Suzuki, A., Mizushima, T., Masui, R., Kuramitsu, S., Yamane, T.

    Acta Crystallographica Section F Structural Biology and Crystallization Communications   66 ( 4 )   397 - 400   2010年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of RecJ exonuclease defines its specificity for single-stranded DNA 査読

    Wakamatsu, T., Kitamura, Y., Kotera, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Biological Chemistry   285 ( 13 )   9762 - 9769   2010年03月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of the conserved hypothetical protein TTHA1606 from Thermus thermophilus HB8 査読

    Tomoike, F., Wakamatsu, T., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Proteins   76 ( 1 )   244 - 248   2009年07月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   国際・国内誌:国際誌  

  • Degradation of ppGpp by nudix pyrophosphatase modulates the transition of growth phase in the bacterium Thermus thermophilus 査読

    Ooga, T., Ohashi, Y., Kuramitsu, S., Koyama, Y., Tomita, M., Soga, T., Masui, R.

    Journal of Biological Chemistry   284 ( 23 )   15549 - 15556   2009年06月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Two dNTP triphosphohydrolases from Pseudomonas aeruginosa possess diverse substrate specificities 査読

    Mega, R., Kondo, N., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    FEBS Journal   276 ( 12 )   3211 - 3221   2009年06月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Characterization of DNA polymerase X from Thermus thermophilus HB8 reveals the POLXc and PHP domains are both required for 3'-5' exonuclease activity 査読

    Nakane, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Nucleic Acids Research   37 ( 6 )   2037 - 2052   2009年04月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of MutS2 endonuclease domain and the mechanism of homologous recombination supression 査読

    Fukui, K., Nakagawa, N., Kitamura, Y., Nishida, Y., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Journal of Biological Chemistry   283 ( 48 )   33417 - 33427   2008年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of a putative DNA methylase TTHA0409 from Thermus thermophilus HB8 査読

    Morita, R., Ishikawa, H., Nakagawa, N., Kuramitsu , S., Masui, R.

    Proteins   73 ( 1 )   259 - 264   2008年10月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Bound nucleotide controls the endonuclease activity of mismatch repair enzyme MutL 査読

    Fukui, K., Nishida, M., Nakagawa, N., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Journal of Biological Chemistry   283 ( 18 )   12136 - 12145   2008年05月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Isolation of uncultivable anaerobic thermophiles of the family Clostridiaceae requiring growth-supporting factors 査読 国際共著

    Kim, J.-J., Kim, H. N., Masui, R., Kuramitsu, S., Seo, J. H., Kim, K., Sung, M.-H.

    Journal of Microbiology and Biotechnology   18 ( 4 )   611 - 615   2008年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Characterization of growth-supporting factors produced by Geobacillus toebii for the commensal thermophile Symbiobacterium toebii. 査読 国際共著

    Kim, J. J., Masui, R., Kuramitsu, S., Seo, J. H., Kim, K., Sung, M. H.

    Journal of Microbiology and Biotechnology   18 ( 3 )   490 - 496   2008年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Insights into different dependence of dNTP triphosphohydrolase on metal ion species from intracellular ion concentrations in Thermus thermophilus 査読

    Kondo, N., Nishikubo, T., Wakamatsu, T., Ishikawa, H., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Extremophiles   12 ( 2 )   217 - 223   2008年03月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • An O6-methylguanine-DNA methyltransferase-like protein from Thermus thermophilus interacts with a nucleotide excision repair protein 査読

    Morita, R., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    J. Biochem.   144 ( 2 )   267 - 277   2008年02月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structural basis for different substrate specificities of two ADP-ribose pyrophosphatases from Thermus thermophilus HB8 査読

    Wakamatsu, T., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Bacteriology   190 ( 3 )   1108 - 1117   2008年02月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of family 5 uracil-DNA glycosylase bound to DNA 査読

    Kosaka, H., Hoseki, J., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Molecular Biology   373 ( 4 )   839 - 850   2007年11月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Analysis of a nuclease activity of catalytic domain of Thermus thermophilus MutS2 by high-accuracy mass spectrometry 査読

    Fukui, K., Takahata, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Nucleic Acids Research   35 ( 15 )   e100   2007年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Simultaneous detection of N-terminal fragment ions in a protein mixture using a ruthenium(II) complex 査読

    Ito, A., Okamura, TA., Yamamoto, H., Ueyama, N., Yamaguchi, M., Kuyama, H., Ando, E., Tsunasawa, S., Ake, K., Masui, R., Kuramitsu, S., Nakazawa, T., Norioka, S.

    Rapid Communications in Mass Spectrometry   21 ( 16 )   2647 - 2653   2007年07月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • High sequence-coverage detection of proteolytic peptides using a bis(terpyridine)ruthenium(II) complex 査読

    Ito, A., Okamura, TA., Masui, K., Kaneko, M., Masui, R., Ake, K., Kuramitsu, S., Yamaguchi, M., Kuyama, H., Ando, E., Norioka, S., Nakazawa, T., Tsunasawa, S., Yamamoto, H., Ueyama, N.

    Analyst   132 ( 4 )   358 - 364   2007年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of archaeal glyoxylate reductase from Pyrococcus horikoshii OT3 complexed with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate 査読

    Yoshikawa, S., Arai, R., Kinoshita, Y., Uchikubo-Kamo, T., Wakamatsu, T., Akasaka, R., Masui, R., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   63 ( 3 )   357 - 365   2007年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Rapid SNP diagnostics using asymmetric isothermal amplification and a new mismatch-suppression technology 査読

    Mitani, Y., Lezhava, A., Kawai, Y., Kikuchi, T., Oguchi-Katayama, A., Kogo, Y., Itoh, M., Miyagi, T., Takakura, H., Hoshi, K., Kato, C., Arakawa, T., Shibata, K., Fukui, K., Masui, R., Kuramitsu, S., Kiyotani, K., Chalk, A., Tsunekawa, K., Murakami, M., Kamataki, T., Oka, T., Shimada, H., Cizdziel, P. E., Hayashizaki, Y.

    Nature Methods   4 ( 3 )   257 - 262   2007年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of dNTP-inducible dNTP triphosphohydrolase: insight into broad specificity for dNTPs and triphosphohydrolase-type hydrolysis 査読

    Kondo, N., Nakagawa, N., Ebihara, A., Chen, L., Liu, ZJ., Wang, BC., Yokoyama, S., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   63 ( 2 )   230 - 239   2007年02月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Nuclease activity of the MutS homologue MutS2 from Thermus thermophilus is confined to the Smr domain 査読

    Fukui, K., Takahata, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Nucleic Acids Research   35 ( 3 )   850 - 856   2007年01月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of TTHA0252 from Thermus thermophilus HB8, a RNA degradation protein of the metallo-beta-lactamase superfamily 査読

    Ishikawa, H., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    The Journal of Biochemistry   140 ( 4 )   535 - 542   2006年10月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of hypothetical protein TTHB192 from Thermus thermophilus HB8 reveals a new protein family with an RNA recognition motif-like domain 査読

    Ebihara, A., Yao, M., Masui, R., Tanaka, I., Yokoyama, S., Kuramitsu, S.

    Protein Science   15 ( 6 )   1494 - 1499   2006年06月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Improved heterologous gene expression in Escherichia coli by optimization of the AT-content of codons immediately downstream of the initiation codon 査読

    Nishikubo, T., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Biotechnology   120 ( 4 )   341 - 346   2005年12月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Distinction of Leu and Ile Using a Ruthenium(II) complex by MALDI-LIFT-TOF/TOF-MS analysis 査読

    Ito, A., Okamura, T., Yamamoto, H., Ueyama, N., Ake, K., Masui, R., Kuramitsu, S., Tsunasawa, S.

    Analytical Chemistry   77 ( 20 )   6618 - 6624   2005年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Functional reconstitution of a crenarchaeal splicing endonuclease in vitro 査読

    Yoshinari, S., Fujita, S., Masui, R., Kuramitsu, S., Yokobori, S., Kita, K., Watanabe, Y.

    Biochemical and Biophysical Research Communications   334 ( 4 )   1254 - 1259   2005年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Novel reaction mechanism of GTP cyclohydrolase I. High-resolution X-ray crystallography of Thermus thermophilus HB8 enzyme complexed with a transition state analogue, the 8-oxoguanine derivative 査読

    Tanaka, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Yokoyama, S., Masui, R.

    The Journal of Biochemistry   138 ( 3 )   263 - 275   2005年09月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Molecular mechanism of the Thermus thermophilus ADP-ribose pyrophosphatase from mutational and kinetic studies 査読

    Ooga, T., Yoshiba, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Biochemistry   44 ( 26 )   9320 - 9329   2005年07月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Inference of S-system models of genetic networks using a cooperative coevolutionary algorithm 査読

    Kimura, S., Ide, K., Kashihara, A., Kano, M., Hatakeyama, M., Masui, R., Nakagawa, N., Yokoyama, S., Kuramitsu, S., Konagaya, A.

    Bioinformatics   21 ( 7 )   1154 - 1163   2005年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of P-protein of the glycine cleavage system: implications for nonketotic hyperglycinemia 査読

    Nakai, T., Nakagawa, N., Maoka, N., Masui, R., Kuramitsu S., Kamiya, N.

    The EMBO Journal   24 ( 8 )   1523 - 1536   2005年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure-based functional identification of a novel heme-binding protein from Thermus thermophilus HB8 査読

    Ebihara, A., Okamoto, A., Kousumi, Y., Yamamoto, H., Masui, R., Ueyama, N., Yokoyama, S., Kuramitsu, S.

    Journal of Structural and Functional Genomics   6 ( 1 )   21 - 32   2005年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Inhibition of Thermus thermophilus HB8 thioredoxin activity by platinum(ii) 査読

    Kato, M., Yamamoto, H., Okamura, T., Maoka, N., Masui, R., Kuramitsu, S., Ueyama, N.

    Dalton Transactions   6   1023 - 1026   2005年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Multidrug transporter MexB of Pseudomonas aeruginosa: overexpression, purification, and initial structural characterization 査読

    Mokhonov, V., Mokhonova, E., Yoshihara, E., Masui, R., Sakai, M., Akama, H., Nakae, T.

    Protein Expression and Purification   40 ( 1 )   91 - 100   2005年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • A novel metal-activated L-serine O-acetyltransferase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Kobayashi, S., Masui, R., Yokoyama, S., Kuramitsu, S., Takagi, H.

    The Journal of Biochemistry   136 ( 5 )   629 - 634   2004年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Rapid and sensitive amino-acid sequencing of cloning Thermusthermophilus HB8 ferredoxin by proteomics 査読

    Kaneko, M., Masui, R., Ake, K., Kousumi, Y., Kuramitsu, S., Yamaguchi, M., Kuyama, H., Ando, E., Norioka, S., Nakazawa, T., Okamura, TA., Yamamoto, H., Ueyama, N.

    Journal of Proteome Research   3 ( 5 )   983 - 987   2004年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Biochemical characterization of TT1383 from Thermus thermophilus identifies a novel dNTP triphosphohydrolase activity stimulated by dATP and dTTP 査読

    Kondo, N., Kuramitsu, S., Masui, R.

    The Journal of Biochemistry   136 ( 2 )   221 - 231   2004年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structural insights into the Thermus thermophilus ADP-ribose pyrophosphatase mechanism via crystal structures with the bound substrate and metal. 査読

    Yoshiba, S., Ooga, T., Nakagawa, N., Shibata, T., Inoue, Y., Yokoyama, S., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Biological Chemistry   279 ( 35 )   37163 - 37174   2004年08月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of the native chaperonin complex from Thermus thermophilus revealed unexpected asymmetry at the cis-cavity 査読

    Shimamura, T., Koike-Takeshita, A., Yokoyama, K., Masui, R., Murai, N., Yoshida, M., Taguchi, H., Iwata, S.

    Structure   12 ( 8 )   1471 - 1480   2004年08月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The Nudix hydrolase Ndx1 from Thermus thermophilus HB8 is a diadenosine hexaphosphate hydrolase with a novel activity 査読

    Iwai, T., Kuramitsu, S., Masui, R.

    Journal of Biological Chemistry   279 ( 21 )   21732 - 21739   2004年05月

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Ligand-induced conformational changes and a reaction intermediate in branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (E1) from Thermus thermophilus HB8, as revealed by X-ray crystallography 査読

    Nakai, T., Nakagawa, N., Maoka, N., Masui, R., Kuramitsu, S., Kamiya, N.

    Journal of Molecular Biology   337 ( 4 )   1011 - 1033   2004年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Thermus thermophilus MutS2, a MutS paralogue, possesses an endonuclease activity effected by MutL 査読

    Fukui, K., Masui, R., Kuramitsu, S.

    The Journal of Biochemistry   135 ( 3 )   375 - 384   2004年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Trigger factor from Thermus thermophilus is a Zn2+-dependent chaperone 査読

    Suno, R., Taguchi, H., Masui, R., Odaka, M., Yoshida, M.

    Journal of Biological Chemistry   279 ( 8 )   6380 - 6384   2004年02月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of a family 4 uracil-DNA glycosylase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Hoseki, J., Okamoto, A., Masui, R., Shibata, T., Inoue, Y., Yokoyama, S., Kuramitsu, S.

    Journal of Molecular Biology   333 ( 3 )   515 - 526   2003年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Overproduction, crystallization and preliminary diffraction data of ADP-ribose pyrophosphatase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Yoshiba, S., Nakagawa, N., Masui, R., Shibata, T., Inoue, Y., Yokoyama, S., Kuramitsu, S.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   59 ( 10 )   1840 - 1842   2003年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of nucleoside diphosphate kinase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Takeishi, S., Nakagawa, N., Maoka, N., Kihara, M., Moriguchi, M., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   59 ( 10 )   1843 - 1845   2003年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Coexpression, purification, crystallization and preliminary X-ray characterization of glycine decarboxylase (P-protein) of the glycine-cleavage system from Thermus thermophilus HB8 査読

    Nakai, T., Nakagawa, N., Maoka, N., Masui, R., Kuramitsu, S., Kamiya, N.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   59 ( 9 )   1610 - 1618   2003年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Structure of Thermus thermophilus HB8 H-protein of the glycine-cleavage system, resolved by a six-dimensional molecular-replacement method 査読

    Nakai, T., Ishijima, J., Masui, R., Kuramitsu, S., Kamiya, N.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   D59 ( 9 )   1610 - 1618   2003年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Fluorescence resonance energy transfer analysis of protein translocase. SecYE from Thermus thermophilus HB8 forms a constitutive oligomer in membranes 査読

    Mori, H., Tsukazaki, T., Masui, R., Kuramitsu, S., Yokoyama, S., Johnson, AE., Kimura, Y., Akiyama, Y., Ito, K.

    Journal of Biological Chemistry   278 ( 16 )   14257 - 14264   2003年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Overproduction, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a quinone oxidoreductase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Shimomura, Y., Sumiguchi-Agari, K., Masui, R., Kuramitsu, S., Fukuyama, K.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   58 ( 8 )   1365 - 1367   2002年08月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The crystal structure of exonuclease RecJ bound to Mn2+ ion suggests how its characteristic motifs are involved in exonuclease activity 査読

    Yamagata, A., Kakuta, Y., Masui, R., Fukuyama, K.

    Proceedings of National Academy of Science, U. S. A.   99 ( 9 )   5908 - 5912   2002年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of thermostable DNA photolyase: Pyrimidine-dimer recognition mechanism 査読

    Komori, H., Masui, R., Kuramitsu, S., Yokoyama, S., Shibata, T., Inoue, Y., Miki, K.

    Proceedings of National Academy of Science, U. S. A.   98 ( 24 )   13560 - 13565   2001年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Overexpression, purification and characterization of RecJ protein from Thermus thermophilus HB8 and its core domain 査読

    Yamagata, A., Masui, R., Kakuta, Y., Kuramitsu, S., Fukuyama, K.

    Nucleic Acids Research   29 ( 22 )   4617 - 4624   2001年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Cloning and overexpression of the oah1 gene encoding O-acetyl-L-homoserine sulfhydrylase of Thermus thermophilus HB8 and characterization of the gene product 査読

    Shimizu, H., Yamagata, S., Masui, R., Inoue, Y., Shibata, T., Yokoyama, S., Kuramitsu, S., Iwama, T.

    Biochimica et Biophysica Acta   1549 ( 1 )   61 - 72   2001年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystallization and preliminary X-ray studies of a thermostable DNA photolyase from Thermus thermophilus HB8 査読

    Komori, H., Tsujiuchi, H., Masui, R., Kuramitsu, S., Yokoyama, S., Shibata, T., Inoue, Y., Miki, K.

    Current Pharmaceutical Design   8 ( 6 )   495 - 498   2001年06月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Observation of RecA protein monomer by small angle X-ray scattering with synchrotron radiation 査読

    Kato, R., Kataoka, M., Mikawa, T., Masui, R., Nakagawa, N., Kamikubo, H., Kuramitsu, S.

    FEBS Letters   482 ( 42737 )   159 - 162   2000年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Interaction of UvrA and UvrB proteins with a fluorescent single-stranded DNA. Implication for slow conformational change upon interaction of UvrB with DNA 査読

    Yamagata, A., Masui, R., Kato, R., Nakagawa, N., Ozaki, H., Sawai, H., Kuramitsu, S., Fukuyama, K.

    Journal of Biological Chemistry   275 ( 18 )   13235 - 13242   2000年05月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Fluorescence and Excitation Escherichia coli RecA protein spectra analyzed separatedly for tyrosine and tryptophan residues 査読 国際共著

    Isaev-Ivanov, V. V., Kozlov, M. G., Baitin, D. M., Masui, R., Kuramitsu, S., Lanzov, V. A.

    Archives of Biochemistry and Biophysics   376 ( 1 )   124 - 140   2000年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The RadA protein from a hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum islandicum is a DNA-dependent ATPase that shows two disparate catalytic modes, with a transition termperature at 75 degrees C 査読 国際共著

    Spies, M., Kil, Y., Masui, R., Kato, R., Kujo, C., Ohshima, T., Kuramitsu, S., Lanzov, V.

    European Journal of Biochemistry   267 ( 4 )   1125 - 1137   2000年02月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Efficient strand transfer by the RadA recombinase from the hyperthermophilic archaeon Desulfurococcus amylolyticus 査読 国際共著

    Kil, Y., Baitin, D. M., Masui, R., Bonch-Osmolovskaya, E. A., Kuramitsu, S., Lanzov, V.

    Journal of Bacteriology   182 ( 1 )   130 - 134   2000年01月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystal structure of Thermus thermophilus HB8 UvrB protein, a key enzyme of nucleotide excision repair 査読

    Nakagawa, N., Sugahara, M., Masui, R., Kato, R., Fukuyama, K., Kuramitsu, S.

    The Journal of Biochemistry   126 ( 6 )   986 - 990   1999年12月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Purification, molecular cloning, and catalytic activity of Schizosaccharomyces pombe pyridoxal reductase. A possible additional family in the aldo-keto reductase superfamily 査読

    Nakano, M., Morita, T., Yamamoto, T., Sano, S., Ashiuchi, M., Masui, R., Kuramitsu, S., Yagi, T.

    Journal of Biological Chemistry   274 ( 33 )   23185 - 23190   1999年08月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a DNA excision repair enzyme, UvrB, from Thermus thermophilus HB8 査読

    Shibata, A., Nakagawa, N., Sugahara, M., Masui, R., Kato, R., Kuramitsu, S., Fukuyama, K.

    Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography   55 ( 3 )   705 - 705   1999年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Characterization of the oligomeric states of RecA protein: monomeric RecA protein can form a nucleoprotein filament 査読

    Masui, R., Mikawa, T., Kato, R., Kuramitsu, S.

    Biochemistry   37 ( 42 )   14788 - 14797   1998年10月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Domain organization and functional analysis of Thermus thermophilus MutS protein 査読

    Tachiki, H., Kato, R., Masui, R., Hasegawa, K., Itakura, H., Fukuyama, K., Kuramitsu, S.

    Nucleic Acids Research   26 ( 18 )   4153 - 4159   1998年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Probing of DNA-binding site of Escherichia coli RecA protein by utilizing 1-anilinonaphthalene-8-sulfonic acid 査読

    Masui, R., Kuramitsu, S.

    Biochemistry   37 ( 35 )   12133 - 12143   1998年09月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Local folding of the N-terminal domain of Escherichia coli RecA controls protein-protein interaction 査読

    Masui, R., Mikawa, T., Kuramitsu, S.

    Journal of Biological Chemistry   272 ( 44 )   27707 - 27715   1997年10月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Domain structure of Thermus thermophilus UvrB protein. Similarity in domain structure to a helicase 査読

    Nakagawa, N., Masui, R., Kato, R., Kuramitsu, S.

    Journal of Biological Chemistry   272 ( 36 )   22703 - 22713   1997年09月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • RecA protein has extremely high cooperativity for substrate in its ATPase activity 査読

    Mikawa, T., Masui, R., Kuramitsu, S.

    The Journal of Biochemistry   123   450 - 457   1997年03月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • An aspartate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8 査読

    Okamoto, A., Kato, R., Masui, R., Yamagishi, A., Oshima, T., Kuramitsu, S.

    The Journal of Biochemistry   119 ( 1 )   135 - 144   1996年01月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • N-terminal 33 amino acid residues of Escherichia coli RecA protien contribute to its self-assembly 査読

    Mikawa, T., Masui, R., Ogawa, T., Ogawa, H., and Kuramitsu, S.

    Journal of Molecular Biology   250 ( 4 )   471 - 483   1995年07月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Interaction of RecA protein with ATP and its analogues 査読

    Watanabe, R., Masui, R., Mikawa, T., Takamatsu, S., Kato, R., Kuramitsu, S.

    The Journal of Biochemistry   116 ( 5 )   960 - 966   1994年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The presence of free D-serine, D-alanine, and D-proline in human plasma 査読

    Nagata, Y., Masui, R., Akino, T.

    Experientia   48 ( 3 )   986 - 988   1992年03月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Amino acid sequences of ferredoxins from Alocasia macrorrhiza Schott in Papua New Guinea 査読

    Wada, K., Sakai, H., Masui, R., Ihara, M., Matsubara, H.

    Protein Sequences and Data Analysis   5 ( 1 )   13 - 19   1992年01月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The amino acid sequences of the 9kDa polypeptide and partial amino acid sequence of the 20kDa polypeptide of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 査読 国際共著

    Masui, R., Wakabayashi, S., Matsubara, H., Hatefi. Y.

    The Journal of Biochemistry   110 ( 4 )   575 - 582   1991年10月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • The amino acid sequences of two 13kDa polypeptides and partial amino acid sequence of 30kDa polypeptide of complex I from bovine heart mitochondria: Possible location of iron-sulfur clusters 査読 国際共著

    Masui, R., Wakabayashi, R., Matsubara, H., Hatefi, Y.

    The Journal of Biochemistry   109 ( 4 )   534 - 543   1991年04月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Characterization, amino acid sequence and phylogenetic considerations regarding the ferredoxin from Ochromonas danica 査読 国際共著

    Masui, R., Wada, K., Matsubara, H., Williams, M. M., Rogers, L, J.

    Phytochemistry   27 ( 9 )   2817 - 2820   1988年09月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Properties and amino acid sequence of the ferredoxin from the unicellular cyanobacterium Synechococcus 6307 査読 国際共著

    Wada, K., Masui, R., Matsubara, H., Rogers, L. J.

    Phytochemistry   27 ( 9 )   2821 - 2826   1988年09月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

  • Properties and structure of the ferredoxin from Synechococcus 6301 (Anacystis nidulans) 査読 国際共著

    Wada, K., Masui, R., Matsubara, H., Rogers, L. J.

    Biochemical Journal   252 ( 2 )   571 - 575   1988年06月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著区分:共著   国際・国内誌:国際誌  

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書籍等出版物

  • 生命科学が変わる! タンパク質の構造・機能の基礎から研究テーマ例まで

    倉光成紀、増井良治、中川紀子( 担当: 共著)

    大阪大学出版会  2024年03月  ( ISBN:978-4-87259-797-4

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    総ページ数:262   著書種別:教科書・概説・概論   参加形態:セカンドオーサー

  • タンパク質の酵素反応

    倉光 成紀,増井 良治( 担当: 単著)

    化学同人 やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法3:タンパク質のはたらきを知る  2009年08月 

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    総ページ数:171   担当ページ:1-27  

  • 生物学が変わる! − ポストゲノム時代の原子生物学 −

    -( 担当: 共著)

    大阪大学出版会  2004年08月 

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    著書種別:学術書  

MISC(その他記事)

  • タンパク質立体構造情報を活用したアシル化プロテオーム解析 査読

    岡西 広樹, 増井 良治, Kim Kwang, 倉光 成紀

    日本プロテオーム学会 日本プロテオーム学会誌   3 ( 1 )   15 - 22   2018年07月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • DNA結合活性をもつプロテアーゼ様タンパク質の構造解析 招待 査読

    増井 良治

    日本結晶学会 日本結晶学会誌   60 ( 2 )   74 - 75   2018年

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    掲載種別:速報,短報,研究ノート等(学術雑誌)   共著区分:単著  

  • Functional analysis of new proteases from an extremely thermophilic organism, Thermus theromphilus HB8

    Yumi Kimura, Daisuke Sasaki, Naoya Fujimura, Tadashi Ono, Chinami Sako, Suzuka Yamasaki, Ryoji Masui, Noriko Nakagawa

    Protein Science   26   92 - 92   2017年

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    掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   共著区分:共著  

  • 機能未知タンパク質の機能解明を目指して ヌクレオチド代謝を例に 招待 査読

    増井 良治

    (公社)日本生化学会 生化学   87 ( 6 )   749 - 751   2015年12月( ISSN:0037-1017

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    掲載種別:速報,短報,研究ノート等(学術雑誌)   共著区分:単著  

    ヌクレオチドや核酸に関わる配列モチーフを持つものの、その機能がはっきりしない蛋白質に着目して構造機能解析を行ってきた。それらの中には重要な生理的機能を担っているものがまだある可能性がある。高度好熱菌の場合を例に、機能未知蛋白質の機能解明を目指した例をppGpp分解酵素Ndx8(TTHA1939)、dNTP分解酵素Tt-dNTPase(TTHA0412)、nanoRNA分解酵素(TTHA0118)に分けて解説した。

  • 生物に広く存在する翻訳後修飾としてのLys残基プロピオニル化の発見

    岡西 広樹, 金 光, 中川 紀子, 倉光 成紀, 増井 良治

    日本プロテオーム学会(日本ヒトプロテオーム機構) 日本プロテオーム学会大会要旨集   2015   183 - 183   2015年

     詳細を見る

    掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(全国大会,その他学術会議)   共著区分:共著  

  • Molecular mechanisms of the whole DNA repair system: A comparison of bacterial and eukaryotic systems 査読

    Morita, R., Nakane, S., Shimada, A., Inoue, M., Iino, H., Wakamatsu, T., Fukui, K., Nakagawa, N., Masui, R., Kuramitsu, S.

    Journal of Nucleic Acids   2010   179594   2010年10月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 見落とされた酵素活性をin vivo基質スクリーニングで発見 招待 査読

    大賀 拓史,増井 良治

    化学と生物   47 ( 12 )   814   2009年12月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 特集:タンパク3000 プロジェクトが産んだもの 第1部 成果とインパクト:個別解析拠点の研究成果 「代謝系」 招待

    倉光 成紀, 増井 良治

    蛋白質核酸酵素   53 ( 5 )   604 - 607   2008年04月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 酵素ハンドブック(第3版) 査読

    増井 良治

    朝倉書店   2008年

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:単著  

  • タンパク3000の成果とインパクト:個別的解析拠点の研究成果:代謝系 査読

    増井 良治

    蛋白質核酸酵素   53(5), 604-607   2008年

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:単著  

  • 生化学辞典(第4版) 招待 査読

    増井 良治

    東京科学同人   2007年

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)   共著区分:共著  

  • 高度好熱菌 丸ごと一匹 プロジェクト: 構造ゲノム科学からシステム生物学へ

    -

    日本結晶学会誌   48   403 - 410   2006年12月

     詳細を見る

    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • MutM: Single C2C2 zinc finger-DNA interaction

    -

    "Zinc Finger Proteins: from Atomic Contact to Cellular Function" (edited by Shiro Iuchi and Natalie Kuldell), Landes Bioscience   2005年02月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)  

  • 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 のゲノム解析 −原子生物学のモデル生物−

    -

    ゲノミクスとプロテオミクスの新展開〜生物情報の解析と応用〜」 今中忠行 監修, NTS   113 - 128   2004年04月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)  

  • PCRを用いた遺伝子の変異導入法

    -

    ここまでできるPCR最新活用マニュアル   2003年10月

     詳細を見る

    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)  

  • タグ付きタンパク質の微生物による発現・調製 招待

    増井 良治, 木原 美穂, 森口 実紀, 小坂 宏道, 中川 紀子, 倉光 成紀

    東京化学同人 ポストシークエンス タンパク質実験法2   114 - 130   2002年10月

     詳細を見る

    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)   共著区分:共著  

  • バクテリア蛋白質の網羅的発現 招待 査読

    大谷 直人, 中川 紀子, 寳関 淳, 海老原 章郎, 佐藤 伸哉, 上利 佳弘, 小林 慎一郎, 上利 和子, 真岡 伸子, 増井 良治, 三木 邦夫, 横山 茂之, 倉光 成紀

    蛋白質核酸酵素   47 ( 8, suppl )   1009 - 1013   2002年08月

     詳細を見る

    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 酸化傷害DNAの修復機構 招待 査読

    増井 良治, 中川 紀子, 倉光 成紀

    蛋白質核酸酵素   46 ( 11 )   1618 - 1624   2001年11月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 高度好熱菌のDNA修復蛋白質 UvrB の構造と機能の関連 招待

    中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    蛋白質核酸酵素   46 ( 8 )   968 - 975   2001年08月

     詳細を見る

    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • Structural genomics projects in Japan 査読

    Yokoyama, S., Hirota, H., Kigawa, T., Yabuki, T., Shirouzu, M., Terada, T., Nishimura, Y., Masui, R., and Kuramitsu, S.

    Nature Structural Biology   7 ( 11, supp )   943 - 945   2000年11月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 好熱菌の全ゲノム配列決定とその意義 招待 査読

    増井 良治, 倉光 成紀

    蛋白質核酸酵素   44 ( 2 )   165 - 170   1999年02月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

  • 原核生物のヌクレオチド除去修復 招待

    中川 紀子, 増井 良治, 加藤 龍一, 倉光 成紀

    実験医学   16 ( 8 )   1069 - 1075   1998年08月

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    掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   共著区分:共著  

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講演・口頭発表等

  • 非Hanks型プロテインキナーゼYpkBの構造解析に基づくRPkA/YeaGファミリーの機能推定 国内会議

    鳥井雅之、谷一寿、菅野亮、Malgorzata Hall, 溝口明、Bruno M. Humbel、増井良治

    第96回日本生化学会大会  2023年10月  日本生化学会

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    会議種別:ポスター発表  

    開催地:福岡国際会議場  

  • 高度好熱菌ヌクレオシド一リン酸キナーゼ群のリン酸化による活性調節 国内会議

    西脇杏,増井良治

    第45回日本分子生物学会年会  2022年12月  日本分子生物学会

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    会議種別:ポスター発表  

    開催地:幕張メッセ  

  • 高度好熱菌DNA結合タンパク質TkaPの機能と活性調節機構の解析 国内会議

    井上葵、高尾和也、井上真男、増井良治

    第22回日本蛋白質科学会年会  2022年06月  日本蛋白質科学会

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    会議種別:ポスター発表  

    開催地:つくば国際会議場  

  • 脂肪酸キナーゼのリン酸基転移反応を担う触媒残基の解析 国内会議

    浦野桃花,中原駿也,中谷茉矢,増井良治

    第68回日本生化学会近畿支部例会  2022年05月  日本生化学会近畿支部

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:滋賀医科大学  

  • ⾼度好熱菌ヌクレオシド⼀リン酸キナーゼ群のリン酸化による活性調節 国内会議

    西脇杏,増井良治

    第68回日本生化学会近畿支部例会  2022年05月  日本生化学会近畿支部

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:滋賀医科大学  

  • P-loopモチーフを有する細菌由来プロテインキナーゼの構造機能解析 国内会議

    鳥井雅之, 増井良治

    第44回日本分子生物学会年会  2021年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • バクテリア由来small Zn-finger proteinの構造機能解析 国内会議

    栗波紗生, 福井健二, 村川武志, 矢野貴人, 増井良治

    第44回日本分子生物学会年会  2021年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • RHH 型 DNA 結合タンパク質における機能領域の in vivo 解析 国内会議

    井上葵, 高尾和也, 増井良治

    第44回日本分子生物学会年会  2021年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • RHH 型DNA 結合タンパク質がもつ C 末端ヘリックスのリン酸化制御への関与 国内会議

    井上葵, 高尾和也, 福井健二, 村川武志, 矢野貴人, 増井良治

    第94回日本生化学会大会  2021年11月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • バクテリア由来small Zn-finger proteinの機能・構造解析 国内会議

    栗波紗生, 福井健二, 村川武志, 矢野貴人, 増井良治

    第67回日本生化学会近畿支部例会  2021年05月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 高度好熱菌zinc-fingerタンパク質の生化学的解析 国内会議

    栗波紗生,増井良治

    第43回 日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌RHH型DNA結合タンパク質のリン酸化制御には負に帯電したC末端領域の構造変化が必要である 国内会議

    井上葵,高尾和也,福井健二,井上真男,藤井裕己,矢野貴人,増井良治

    第43回 日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Walker Aモチーフを有する細菌由来プロテインキナーゼの遺伝学的および生化学的解析 国内会議

    鳥井雅之,飯尾洋太,山﨑鈴花,増井良治

    第43回 日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • ATP結合に伴う高度好熱菌プロテインキナーゼの構造変化 国内会議

    藤野友輔,井上真男,藤井裕己,岡西広樹,金井好克,増井良治

    極限環境生物学会 第21回年会  2020年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • CMPキナーゼによる基質認識の構造的基盤 国内会議

    妻鹿良亮,中川紀子,倉光成紀,増井良治

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Analysis of functionally unknown proteins related to nucleic acid transaction 国内会議

    Kenji Fukui, Yuki Fujii, Taisuke Wakamatsu, Ryoji Masui

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)  

  • 脂肪酸キナーゼの構造・機能ドメイン解析 国内会議

    中谷茉矢, 村上泰平, 岡西広樹, 宮田真人, 増井良治

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • バクテリア由来NurA, HerAは組換えメディエーターと共に紫外線傷害の修復に寄与する 国内会議

    藤井裕己, 井上真男, 福井健二, 増井良治

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • Analysis of functionally unknown proteins related to nucleic acid transaction 国内会議

    Kenji Fukui, Yuki Fujii, Taisuke Wakamatsu, Ryoji Masui

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

     詳細を見る

    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 脂肪酸キナーゼの構造・機能ドメイン解析 国内会議

    中谷茉矢,村上泰平,岡西広樹,宮田真人,増井良治

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

     詳細を見る

    会議種別:ポスター発表  

  • バクテリア由来NurA, HerAは組換えメディエーターと共に紫外線傷害の修復に寄与する 国内会議

    藤井裕己、井上真男、福井健二、増井良治

    第42回 日本分子生物学会年会  2019年12月 

     詳細を見る

    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌プロテインキナーゼの構造安定性へのATPの効果 国内会議

    藤野友輔,井上真男,藤井裕己,増井良治

    極限環境生物学会2019年度 (第20回) 年会  2019年11月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • CMPキナーゼ-リガンド複合体の結晶解析によるリガンド結合の構造的基盤の解明 国内会議

    妻鹿良亮,中川紀子,倉光成紀,増井良治

    第92回 日本生化学会大会  2019年09月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Structural and functional analysis of fatty acid kinase of Thermus thermophilus HB8 国際会議

    Maya Nakatani, Taihei Murakami,, Hiroki Okanishi,, Norie Araki, Makoto Miyata, Ryoji Masui

    10th OCARINA International Symposium  2019年03月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Analysis of functionally unknown proteins in Thermus thermophilus 国内会議

    Ryoji Masui

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

  • 高度好熱菌脂肪酸キナーゼの構造機能解析 国内会議

    中谷 茉矢, 村上 泰平, 岡西 広樹, 荒木 令江, 増井 良治

    第91回日本生化学会大会  2018年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌脂肪酸キナーゼの構造機能解析 国内会議

    中谷茉矢,村上泰平,岡西広樹,荒木令江,増井良治

    第65回日本生化学会近畿支部例会  2018年05月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • DNA-binding activity of the multifunctional enzyme, nucleoside diphosphate kinase 国際会議

    Chinami Sako, Masaaki Miyamoto, Satoshi Akanuma, Ryoji Masui

    9th OCARINA International Symposium  2018年03月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌 protein kinase TpkD の構造安定性に対する ATP の効果 国内会議

    藤野 友輔, 井上 真男, 藤井 裕己, 倉光 成紀, 増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 多機能酵素ヌクレオシドニリン酸キナーゼのDNA結合活性 国内会議

    佐古 千菜美, 宮本 昌明, 赤沼 哲史, 増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • リン酸基転移酵素にみられる基質特異性の広がりと新たな機能獲得 国内会議

    増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • リン酸化を介してDNA結合能が制御される新奇なDNA結合タンパク質の立体構造解析 国内会議

    高尾 和也, 飯尾 洋太, 井上 真男, 藤井 裕己, 倉光 成紀, 増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • DNA修復酵素RadAのLonプロテアーゼ様ドメインはDNA結合活性を持つ 国内会議

    井上 真男, 福井 健二, 藤井 裕己, 中川 紀子, 矢野 貴人, 倉光 成紀, 増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 多機能酵素ヌクレオシドニリン酸キナーゼのDNA結合活性 国内会議

    佐古 千菜美, 宮本 昌明, 赤沼 哲史, 増井 良治

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • Functional analysis of new proteases from an extremely thermophilic organism, Thermus thermophilus HB8 国際会議

    Yumi Kimura, Daisuke Sasaki, Naoya Fujimura, Tadashi Ono, Chinami Sako, Suzuka Yamasaki, Ryoji Masui, Noriko Nakagawa

    The 31st Annual Symposium of The Protein Society  2017年07月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 翻訳後修飾を受ける機能未知DNA結合タンパク質の構造機能解析 国内会議

    高尾和也,飯尾洋太,井上真男,,藤井裕己,倉光成紀,増井良治

    酵素補酵素研究会2017  2017年06月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌protein kinase TpkDの構造安定性に対するATPの効果 国内会議

    藤野友輔, 井上真男, 藤井裕己, 倉光成紀, 増井良治

    酵素補酵素研究会2017  2017年06月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • DNA 修復酵素 RadA の Lon プロテアーゼ様ドメインは DNA 結合活性を持つ 国内会議

    井上真男, 福井健二, 藤井裕己, 中川紀子, 矢野貴人, 倉光成紀, 増井良治

    酵素補酵素研究会2017  2017年06月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • Effects of ATP on structural stability of protein kinase TpkD from Thermus thermophilus HB8 国内会議

    Yusuke Fujino, Masao Inoue,, Yuki Fujii, Seiki Kuramitsu, Ryoji Masui

    第17回日本蛋白質科学会年会  2017年06月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Structural and functional analysis of a novel DNA-binding protein TkaP from Thermus thermophilus HB8 国内会議

    Kazuya Takao, Yota Iio, Masao Inoue, Yuki Fujii, Seiki Kuramitsu, Ryoji Masui

    第17回日本蛋白質科学会年会  2017年06月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 多機能酵素ヌクレオシド二リン酸キナーゼのDNA結合活性 国内会議

    佐古千菜美,宮本昌明,赤沼哲史,増井良治

    第64回日本生化学会近畿支部例会  2017年05月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • Structural and functional analysis of a novel DNA-binding protein TkaP from Thermus thermophilus HB8 国際会議

    Kazuya Takao, Yota Iio, Masao Inoue, Yuki Fujii, Yu-hei Tahara, Makoto Miyata, Seiki Kuramitsu, Ryoji Masui

    8th OCARINA International Symposium  2017年03月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • NurA and HerA of the Extremely Thermophilic Eubacterium Thermus thermophilus HB8 国際会議

    Yuki Fujii, Masao Inoue, Kenji Fukui, Kwang Kim, Seiki Kuramitsu, Ryoji Masui

    Extremophiles 2016  2016年09月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来の新奇なDNA結合タンパク質(TkaP)の構造・機能的解析 国内会議

    高尾 和也, 飯尾 洋太, 井上 真男, 藤井 裕己, 藤野 友輔, 倉光 成紀, 増井 良治

    第89回日本生化学会大会  2016年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:ポスター発表  

  • 高度好熱菌protein kinase TpkDの構造安定性に対するリガンドの効果 国内会議

    藤野 友輔, 宮川 武朗, 井上 真男, 藤井 裕己, 倉光 成紀, 増井 良治

    第89回日本生化学会大会  2016年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 生物に広く存在するアシル化修飾の働き:アセチル化,プロピオニル化,スクシニル化 国内会議

    岡西 広樹, 小林 大樹, 荒木 令江, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本プロテオーム学会2016年大会(JHUPO第14回大会)  2016年07月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    DOI: 10.14889/jhupo.2016.0.55.0

  • DNA 相同組換えに関わる RecA パラログタンパク質 RadA/Sms が持つ Lon プロテアーゼ様ドメインの構造と機能 国内会議

    井上真男, 福井健二, 藤井裕己, 矢野貴人, 倉光成紀, 増井良治

    第16回日本蛋白質科学会年会  2016年06月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • バクテリア由来アーキア型ヌクレアーゼNurAとヘリカーゼHerAの細胞機能解析 国内会議

    藤井 裕己, 井上 真男, 福井 健二, 金 光, 倉光 成紀, 上田 昌宏, 増井 良治

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2015年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • RecA様タンパク質RadA/Sms C末端ドメインの構造と機能 国内会議

    井上 真男, 福井 健二, 藤井 裕己, 矢野 貴人, 倉光 成紀, 増井 良治

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2015年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • バクテリアにおける翻訳後修飾 高度好熱菌におけるアシル化プロテオーム解析 国内会議

    岡西 広樹, 金 光, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2014年10月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • ウリジンシチジンキナーゼ中のウリジンのプロトン化状態についての理論的研究 国内会議

    田中 弥, 氏家 謙, 友池 史明, 庄司 光男, 栢沼 愛, 増井 良治, 倉光 成紀, 重田 育照

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2014年10月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • ウリジンシチジンキナーゼの基質結合相互作用についての理論的研究(A theoretical study on the substrate bindings in uridine-cytidine kinase) 国内会議

    Tanaka Wataru, Ujiie Yuzuru, Tomoike Fumiaki, Shoji Mitsuo, Kayanuma Megumi, Masui Ryoji, Kuramitsu Seiki, Shigeta Yasuteru

    生物物理  2014年08月  (一社)日本生物物理学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 耐熱性ミスマッチDNA修復蛋白質を利用したPCR法の改良 国内会議

    福井 健二, 島田 敦広, 豊竹 洋佑, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2013年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 短鎖DNA/RNA特異的エキソヌクレアーゼの立体構造と反応機構 国内会議

    植村 有里, 若松 泰介, 中川 紀子, Hunt John Francis, Montelione Gaetano Thomas, 倉光 成紀, 増井 良治

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2013年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 少数のアミノ酸残基によって決定されるプリンヌクレオシドホスホリラーゼの基質特異性 国内会議

    友池 史明, 倉光 成紀, 増井 良治

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2013年09月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 高度好熱菌丸ごと一匹解析 異なるファミリーに属するプロテインキナーゼは異なる耐熱化機構を持つ 国内会議

    宮川 武朗, 飯尾 洋太, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 短鎖DNA/RNA特異的エキソヌクレアーゼの反応機構 国内会議

    植村 有里, 若松 泰介, Hunt John, Montelione Gaetano, 中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 単一のアミノ酸残基によって決定されるuridine-cytidine kinaseの基質特異性 国内会議

    友池 史明, 中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • Thermus thermophilus HB8の全細胞解析 RNaseによるmRNA分解の調節(Whole cell analysis of Thermus thermophilus HB8: The regulation of mRNA decay by RNases) 国内会議

    Ohyama Hiromasa, Agari Yoshihiro, Fukui Kenji, Nakagawa Noriko, Shinkai Akeo, Masui Ryoji, Kuramitsu Seiki

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • RecA様蛋白質RadA/Smsの分子機能解析 国内会議

    井上 真男, 福井 健二, 中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • DNAミスマッチ修復タンパク質MutS-MutL間相互作用の動態解析 国内会議

    秦 義人, 島田 敦広, 増井 良治, 福井 健二, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • DNAポリメラーゼXが持つPHPドメインの塩基除去修復系における役割 国内会議

    中根 修平, 中川 紀子, 倉光 成紀, 増井 良治

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • ATP加水分解にともなうMutSによるMutLの活性化 国内会議

    島田 敦広, 増井 良治, 倉光 成紀, 福井 健二

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 単一のアミノ酸残基によって決定されるuridine-cytidine kinaseの基質特異性 国内会議

    友池 史明, 中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • 短鎖DNA/RNA特異的エキソヌクレアーゼの反応機構 国内会議

    植村 有里, 若松 泰介, Hunt John, Montelione Gaetano, 中川 紀子, 増井 良治, 倉光 成紀

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2012年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

  • ヒトタイプMutLにおけるATP依存的構造機能変化 立体構造予測を利用した構造機能解析 国内会議

    飯野 均, 金 光, 山本 竜也, 島田 敦広, 増井 良治, 倉光 成紀, 福井 健二

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2010年12月  (公社)日本生化学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

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担当教育概要

  • 全学共通教育 (全学部対象) では,生物と環境とのかかわりについて学生自身が課題を設定して,調べ,発表する形式の授業を行っている。 また,生物学実験を分担している。学部教育 (理学部対象) では,炭水化物や脂肪,蛋白質といった食物分子からどのようにしてエネルギーを得ているのか,その概要を分子レベルで説明できることを目標としている。また,専門生物学実験を分担している。大学院教育(理学研究科対象)では,生体内の代謝反応を担う酵素タンパク質の構造と機能を実際に研究するための主要な解析方法について説明できるようにすることを目指している。

担当授業科目

  • 生物学前期特別研究Ⅱ

    2023年度   集中講義   大学院

  • 後期特別研究

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究2A

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究1A

    2023年度   集中講義   大学院

  • 海外特別研究2

    2023年度   集中講義   大学院

  • 海外特別研究1

    2023年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学特別講義B

    2023年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学演習2A

    2023年度   週間授業   大学院

  • 機能解析生物学演習1A

    2023年度   週間授業   大学院

  • 機能解析生物学特論A

    2023年度   週間授業   大学院

  • 機能解析生物学特論A

    2023年度   週間授業   大学院

  • 生物学の潮流

    2023年度   集中講義   大学

  • 生物学実験A

    2023年度   実習   大学

  • 生物学特別研究4A

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究3A

    2023年度   集中講義   大学院

  • 海外特別研究4

    2023年度   集中講義   大学院

  • 海外特別研究3

    2023年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学特別演習

    2023年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学ゼミナール

    2023年度   集中講義   大学院

  • 後期海外特別研究2

    2023年度   集中講義   大学院

  • 後期特別研究

    2023年度   集中講義   大学院

  • 後期特別研究

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物分子機能学ゼミナール

    2023年度   集中講義   大学院

  • 海外特別研究

    2023年度   集中講義   大学

  • 生物学実験S

    2023年度   実習   大学

  • 特別研究

    2023年度   集中講義   大学

  • 専門生物学演習

    2023年度   集中講義   大学

  • 代謝生化学2

    2023年度   週間授業   大学

  • 生物学実験B

    2023年度   実習   大学

  • 生命と環境

    2023年度   週間授業   大学

  • 生物学特別研究4B

    2023年度   集中講義   大学院

  • 前期海外特別研究1

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学前期特別研究Ⅱ

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究2B

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究1B

    2023年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学演習2B

    2023年度   週間授業   大学院

  • 機能解析生物学演習1B

    2023年度   週間授業   大学院

  • 後期特別研究

    2023年度   集中講義   大学院

  • 専門生物学実験B

    2023年度   実習   大学

  • 生物学特別研究3B

    2023年度   集中講義   大学院

  • 生物学特別研究1A

    2022年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学演習1A

    2022年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学特論A

    2022年度   週間授業   大学院

  • 生物学特別研究1B (杉本)

    2022年度   集中講義   大学院

  • 機能解析生物学演習1B (中百舌鳥)

    2022年度   週間授業   大学院

  • 機能解析生物学演習1B (杉本)

    2022年度   集中講義   大学院

  • 生物学の潮流

    2022年度   週間授業   大学

  • 生物学実験S

    2022年度   集中講義   大学

  • 生物学実験A

    2022年度   週間授業   大学

  • 前期特別研究(M2生物学分野)

    2022年度   集中講義   大学院

  • 代謝生化学

    2022年度   週間授業   大学

  • 専門生物学実験B

    2022年度   週間授業   大学

  • 専門生物学演習

    2022年度   集中講義   大学

  • 生命と環境/杉本[全]S

    2022年度   週間授業   大学院

  • 生物学実験B/必:理<生>選:<生以外>(市:時間割表参照)S

    2022年度   週間授業   大学院

  • 前期特別研究

    2021年度     大学院

  • 専門生物学実験B

    2021年度     大学

  • 特別研究

    2021年度     大学

  • 生物学実験A

    2021年度     大学

  • 生物学実験S

    2021年度     大学

  • 生物学の潮流

    2021年度     大学

  • 生体分子機能学演習

    2021年度     大学院

  • 代謝調節機能学特論

    2021年度     大学院

  • 代謝生化学

    2021年度     大学

  • 専門生物学演習

    2021年度     大学

  • 生命と環境

    2021年度     大学

  • 専門生物学実験B

    2020年度     大学

  • 特別研究

    2020年度     大学

  • 生物学実験A

    2020年度     大学

  • 生物学実験S

    2020年度     大学

  • 生物学の潮流

    2020年度     大学

  • 生体分子機能学演習

    2020年度     大学院

  • 代謝調節機能学特論

    2020年度     大学院

  • 代謝生化学

    2020年度     大学

  • 専門生物学演習

    2020年度     大学

  • 生命と環境

    2020年度     大学

  • 前期特別研究

    2020年度     大学院

  • 生命と環境

    2019年度     大学

  • 代謝調節機能学特論

    2019年度     大学院

  • 生体分子機能学演習

    2019年度     大学院

  • 専門生物学実験B

    2019年度     大学

  • 特別研究

    2019年度     大学

  • 生物学実験A

    2019年度     大学

  • 生物学実験S

    2019年度     大学

  • 生物学の潮流

    2019年度     大学

  • 代謝生化学

    2019年度     大学

  • 専門生物学演習

    2019年度     大学

  • 前期特別研究

    2019年度     大学院

  • 専門生物学演習

    2018年度     大学

  • 前期特別研究

    2018年度     大学院

  • 生物学の潮流

    2018年度     大学

  • 生物学実験S

    2018年度     大学

  • 現代科学と人間

    2018年度     大学

  • 生物学実験A

    2018年度     大学

  • 特別研究

    2018年度     大学

  • 専門生物学実験B

    2018年度     大学

  • 生体分子機能学演習

    2018年度     大学院

  • 代謝調節機能学特論

    2018年度     大学院

  • 生命と環境

    2018年度     大学

  • 代謝生化学

    2018年度     大学

  • 前期特別研究

    2017年度     大学院

  • 生物学実験A

    2017年度     大学

  • 生体分子機能学演習

    2017年度     大学院

  • 代謝調節機能学特論

    2017年度     大学院

  • 生物学実験S

    2017年度     大学

  • 特別研究

    2017年度     大学

  • 専門生物学演習

    2017年度     大学

  • 専門生物学実験B

    2017年度     大学

  • 現代科学と人間

    2017年度     大学

  • 代謝生化学

    2017年度     大学

  • 生物学の潮流

    2017年度     大学

  • 生体分子機能学演習

    2016年度     大学院

  • 代謝調節機能学特論

    2016年度     大学院

  • 生物学実験S

    2016年度     大学

  • 特別研究

    2016年度     大学

  • 専門生物学演習

    2016年度     大学

  • 専門生物学実験B

    2016年度     大学

  • 現代科学と人間

    2016年度     大学

  • 代謝生化学

    2016年度     大学

  • 生物学の潮流

    2016年度     大学

  • 生物学実験S

    2015年度     大学

  • 特別研究

    2015年度     大学

  • 専門生物学演習

    2015年度     大学

  • 専門生物学実験B

    2015年度     大学

  • 代謝生化学

    2015年度     大学

  • 現代科学と人間

    2015年度     大学

  • 生物学の潮流

    2015年度     大学

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FD活動

  • 教育方法の改善  2023年度

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    【教育方法の改善】専門教育科目「代謝生化学2」において,学生自身が課題を調査し,その結果をスライドにまとめて Moodle に提出し、毎回の授業で代表して数名が発表するというアクティブラーニング形式での授業を実施した。

  • 教育方法の改善  2022年度

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    【教育方法の改善】大学院科目「機能解析生物学特論A」において、受講学生の研究テーマを題材にして種々の解析手法の解説を行うことにより、学生の主体的な取り組みを促した。

  • 教育方法の改善  2021年度

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    【教育方法の改善】総合教育科目「生命と環境」において,学生たち自身がグループミーティングを通じて課題テーマを設定し,自分で調査した内容をスライドにまとめ,互いのプレゼンテーションを視聴して意見を述べ合うというアクティブラーニング形式での授業を実施した。

  • 教育方法の改善  2021年度

     詳細を見る

    【教育方法の改善】専門教育科目「代謝生化学」において,WebClass を利用して学生からの質問を集め,それに対する回答を次回の授業の冒頭に行うことにより,双方向のコミュニケーションをとるようにした。

  • 教育方法の改善  2020年度

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    【教育方法の改善】専門教育科目「代謝生化学」において,学生からの質問に対する回答を音声付きのスライドにまとめて視聴できるようにすることで,授業時間の枠にとらわれずに十分な説明を行うことが可能になった。

  • 教育方法の改善  2020年度

     詳細を見る

    【教育方法の改善】専門教育科目「代謝生化学」において,通常の講義と並行して,学生自身が課題を調査し,その結果を音声付きのスライドにまとめて,オンラインで互いのプレゼンテーションを視聴するというアクティブラーニング形式での授業を実施した。

  • 教育方法の改善  2020年度

     詳細を見る

    【教育方法の改善】総合教育科目「生命と環境」において,学生自身がテーマを設定して,自分で調査し,その内容を音声付きのスライドにまとめ,互いのプレゼンテーションを視聴して意見を述べ合うというアクティブラーニング形式での授業をオンライン形式で実施した。

  • 教育方法の改善  2019年度

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    総合教育科目「生命と環境」において,学生自身がテーマを設定して,自分で調査し,その内容をスライドにまとめ,グループ内で議論したのち,口頭発表するというアクティブラーニング形式での授業を実施した。

  • FD活動への貢献  2019年度

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    大学の FD 研修会および理学研究科の FD 研修会に参加し,アクティブラーニングの進め方についての知見を深めた。

  • FD活動への貢献  2018年度

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    大学の FD 研修会および理学研究科の FD 研修会に参加し,アクティブラーニングの進め方についての知見を深めた。

  • FD活動への貢献  2017年度

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    大学の FD 研修会および理学研究科の FD 研修会に参加し,アクティブラーニングの進め方についての知見を深めた。

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所属院生等の論文発表集計

  • 2023年度

    所属大学院生発表数:0件

  • 2022年度

    所属大学院生発表数:1件

  • 2020年度

    所属大学院生発表数:1件

独自項目・特記事項(教育活動)

  • 2023年度

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    独自項目:生物学専攻・前期博士課程2年生の担任をつとめた。

  • 2021年度

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    独自項目:2018年度入学の生物学科4年生の担任をつとめた。

  • 2020年度

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    独自項目:2018年度入学の生物学科3年生の担任をつとめた。

  • 2019年度

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    独自項目:2018年度入学の生物学科2年生の担任をつとめた。

  • 2018年度

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    独自項目:2018年度入学の生物学科1年生の担任をつとめた。

  • 2017年度

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    独自項目:博士前期課程(生物分野)の担任をつとめた。

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社会貢献活動

  • 大阪市立大学 公開講座 文化交流センター講座

    役割:講師

    大阪市立大学文化交流センター  大阪市立大学 文化交流センター  2017年12月

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    対象: 社会人・一般

    種別:講演会

    参加者数:30(人)

    「好熱菌から生命の起源と未来を考える」というタイトルで,生命誕生の謎や生命とは何かについて考えてみるという内容の講義を行った。

役職

  • 部局内役職

    理学部 生物学科 

    学科長  2024年04月 - 継続中

  • 部局内役職

    大学院理学研究科 生物学専攻 

    専攻長  2024年04月 - 継続中