2024/03/26 更新

写真a

ニシムラ シゲノリ
西村 重徳
Nishimura Shigenori
担当
大学院農学研究科 生命機能化学専攻 助教
農学部 生命機能化学科
職名
助教
所属
農学研究院
所属キャンパス
中百舌鳥キャンパス

担当・職階

  • 大学院農学研究科 生命機能化学専攻 

    助教  2022年04月 - 継続中

  • 農学部 生命機能化学科 

    助教  2022年04月 - 継続中

取得学位

  • 修士(理学) ( 大阪大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 構造生物化学

  • ライフサイエンス / 応用生物化学

研究概要

  • 微生物由来アミラーゼの立体構造と機能の研究

  • 寄生性原虫由来酵素の構造と機能の解析および薬剤開発への展開

  • NMRによる生理活性ペプチドの構造解析

研究歴

  • 微生物由来アミラーゼの立体構造と機能の研究

    β-アミラーゼ、X線結晶構造解析  機関内共同研究

    2014年04月 - 継続中 

  • 寄生性原虫由来酵素の構造と機能の解析および薬剤開発への展開

    トリパノソーマ症、X線結晶構造解析、GMPレダクターゼ 

    2014年04月 - 継続中 

所属学協会

  • 日本核磁気共鳴学会

    2014年10月 - 継続中   国内

  • 日本応用糖質科学会

    2005年07月 - 継続中

  • 日本蛋白質科学会

    2002年05月 - 継続中

  • 日本農芸化学会

    1995年05月 - 継続中

  • 日本生物物理学会

    1990年11月 - 継続中

論文

  • Colloidal dispersion of chiral layered hydroxide salt (LHS) nanocrystals exhibiting chiroptical response 査読

    Yasuaki Tokudome, Akihiro Koyama, Hidenobu Murata, Kenji Okada, Atsushi Nakahira, Shigenori Nishimura, Masahide Takahashi

    Journal of Sol-Gel Science and Technology   2022年04月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Structure-based prediction of the IgE epitopes of the major dog allergen Can f 1.

    Nakatsuji M, Sugiura K, Suda K, Sakurai M, Ubatani M, Muroya H, Okubo R, Noguchi R, Kamata Y, Fukutomi Y, Ishibashi O, Nishimura S, Inui T

    The FEBS journal   289 ( 6 )   1668 - 1679   2022年03月( ISSN:1742-464X

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  • Allosteric regulation accompanied by oligomeric state changes of Trypanosoma brucei GMP reductase through cystathionine-β-synthase domain

    Imamura A, Okada T, Mase H, Otani T, Kobayashi T, Tamura M, Kubata BK, Inoue K, Rambo RP, Uchiyama S, Ishii K, Nishimura S, Inui T.

    Nat. Commun. 雑誌   11 ( 1 )   2020年04月

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    共著区分:共著  

  • Structures and chitin-binding properties of two N-terminal lysin motifs (LysMs) found in a chitinase from Volvox carteri. 査読

    Kitaoku Y, Nishimura S, Hirono T, Suginta W, Ohnuma T, Fukamizo T.

    Glycobiology 雑誌   29 ( 7 )   2019年07月

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    共著区分:共著  

  • Crystal structure of the dog allergen Can f 6 and structure-based implications of its cross-reactivity with the cat allergen Fel d 4. 査読

    Yamamoto K, Ishibashi O, Sugiura K, Ubatani M, Sakaguchi M, Nakatsuji M, Shimamoto S, Noda M, Uchiyama S, Fukutomi Y, Nishimura S, Inui T.

    Scientific Reports 雑誌   9 ( 1 )   2019年02月

  • Crystal structure of exo-rhamnogalacturonan lyase from Penicillium chrysogenum as a member of polysaccharide lyase family 26. 査読

    Kunishige Y, Iwai M, Nakazawa M, Ueda M, Tada T, Nishimura S, Sakamoto T.

    FEBS Lett. 雑誌   592 ( 8 )   2018年04月

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    共著区分:共著  

  • Mechanism of chitosan recognition by CBM32 carbohydrate-binding modules from a Paenibacillus sp. IK-5 chitosanase/glucanase. 査読

    Shinya S, Nishimura S, Kitaoku Y, Numata T, Kimoto H, Kusaoke H, Ohnuma T, Fukamizo T.

    Biochem J. 雑誌   473 ( 8 )   2016年04月

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    共著区分:共著  

  • Characterization of the novel Trypanosoma brucei inosine 5'-monophosphate dehydrogenase. 査読

    Bessho T, Morii S, Kusumoto T, Shinohara T, Noda M, Uchiyama S, Shuto S, Nishimura S, Djikeng A, Duszenko M, Martin SK, Inui T, Kubata KB.

    Parasitology   140 ( 6 )   735 - 45   2013年05月

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    共著区分:共著  

  • Drug delivery system for poorly water-soluble compounds using lipocalin-type prostaglandin D synthase. 査読

    Fukuhara A, Nakajima H, Miyamoto Y, Inoue K, Kume S, Lee YH, Noda M, Uchiyama S, Shimamoto S, Nishimura S, Ohkubo T, Goto Y, Takeuchi T, Inui T.

    J Control Release 雑誌   159 ( 1 )   143 - 50   2012年04月

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    共著区分:共著  

  • NMR and CD analysis of an intermediate state in the thermal unfolding process of mouse lipocalin-type prostaglandin D synthase. 査読

    Miyamoto Y, Noda Y, Iida T, Yamaguchi K, Nishimura S, Tanaka A, Segawa S, Inui T.

    J Biochem 雑誌   151 ( 3 )   335 - 42   2012年03月

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    共著区分:共著  

  • A rapid and simple method of evaluating the dimeric tendency of fluorescent proteins in living cells using a truncated protein of importin α as fusion tag. 査読

    Nakagawa C, Nishimura S, Senda-Murata K, Sugimoto K.

    Biosci Biotechnol Biochem. 雑誌   76 ( 2 )   388 - 90   2012年02月

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    共著区分:共著  

  • Interaction of a goose-type lysozyme with chitin oligosaccharides as determined by NMR spectroscopy. 査読

    Shinya S, Ohnuma T, Kawamura S, Torikata T, Nishimura S, Katoh E, Fukamizo T.

    J Biochem. 雑誌   150 ( 5 )   569 - 77   2011年11月

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    共著区分:共著  

  • Backbone chemical shifts assignments, secondary structure, and ligand binding of a family GH-19 chitinase from moss, Bryum coronatum.

    Shinya S, Nagata T, Ohnuma T, Taira T, Nishimura S, Fukamizo T.

    Biomol NMR Assign 雑誌   2011年11月

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    共著区分:共著  

  • Improvement of a Venus-based bimolecular fluorescence complementation assay to visualize bFos-bJun interaction in living cells. 査読

    Nakagawa C, Inahata K, Nishimura S, Sugimoto K.

    Biosci Biotechnol Biochem. 雑誌   75 ( 7 )   1399 - 401   2011年07月

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    共著区分:共著  

  • Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus- the role of conserved residues in the active site 査読

    Tsuji H, Nishimura S, Inui T, Kado Y, Ishikawa K, Nakamura T, Uegaki K.

    FEBS Journal 雑誌   277 ( 12 )   2683 - 95   2010年06月

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    共著区分:共著  

  • Structural analysis of lipocalin-type prostaglandin D synthase complexed with biliverdin by small-angle X-ray scattering and multi-dimensional NMR. 査読

    Miyamoto Y, Nishimura S, Inoue K, Shimamoto S, Yoshida T, Fukuhara A, Yamada M, Urade Y, Yagi N, Ohkubo T, Inui T.

    J. Struct. Biol. 雑誌   169 ( 2 )   209 - 18   2010年02月

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    共著区分:共著  

  • Kinetically trapped metastable intermediate of a disulfide-deficient mutant of the starch-binding domain of glucoamylase. 査読

    Sugimoto H, Nakaura M, Nishimura S, Karita S, Miyake H, Tanaka A.

    Protein Sci. 雑誌   18 ( 8 )   1715 - 23   2009年08月

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    共著区分:共著  

  • Thermal unfolding mechanism of lipocalin-type prostaglandin D synthase 査読

    Tsukimi Iida, Shigenori Nishimura, Maki Mochizuki, Susumu Uchiyama, Tadayasu Ohkubo, Yoshihiro Urade, Akiyoshi Tanaka, Takashi Inui

    FEBS Journal 雑誌   275 ( 2 )   233 - 241   2007年12月

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    共著区分:共著  

  • Conformational analysis of human calcitonin in solution. 査読

    Kiyoshi Ogawa, Shigenori Nishimura, Masamitsu Doi, H Takashima, Y Nishi, Takuya Yoshida, Tadayasu Ohkubo, Yuji Kobayashi

    J. Pept. Sci. 雑誌   12 ( 1 )   51 - 57   2006年01月

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    共著区分:共著  

  • Two Additional Carbohydrate-Binding Sites of β-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides Are Involved in Hydrolysis and Raw Starch-Binding 査読

    Zhengmao Ye, Hideo Miyake, Maki Tatsumi, Shigenori Nishimura, Yasunori Nitta

    J. Biochem. 雑誌   135 ( 3 )   355 - 363   2004年03月

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    共著区分:共著  

  • Crystal Structure of a Catalytic Site Mutant of β-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides Cocrystallized with Maltopentaose 査読

    Hideo Miyake, Genji Kurisu, Masami Kusunoki, Shigenori Nishimura, Shinichi Kitamura, Yasunori Nitta

    Biochemistry 雑誌   42 ( 19 )   5574 - 5581   2003年05月

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    共著区分:共著  

  • Catalytic Mechanism of β-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides: Chemical Rescue of Hydrolytic Activity for a Catalytic Site Mutant(Glu367- 査読

    Hideo Miyake, Chikako Otsuka, Shigenori Nishimura, Yasunori Nitta

    J. Biochem. 雑誌   131 ( 4 )   587 - 591   2002年04月

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    共著区分:共著  

  • Conformation analysis of eel calcitonin--comparison with the conformation of elcatonin.

    Ogawa K, Nishimura S, Uchiyama S, Kobayashi K, Kyogoku Y, Hayashi M, Kobayashi Y.

    Eur. J. Biochem. 雑誌   257 ( 2 )   1998年10月

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    共著区分:共著  

  • Promotion of polypeptide folding by interactions with Asn-Glycans.

    Kimura N, Uchida M, Nishimura S, Yamaguchi H.

    J. Biochem 雑誌   124 ( 4 )   1998年10月

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    共著区分:共著  

  • Oxidative refolding of bovine pancreatic RNases A and B promoted by Asn-glycans 査読

    Nishimura I, Uchida M, Inohana Y, Setoh K, Daba K, Nishimura S, Yamaguchi H.

    J. Biochem. 雑誌   123 ( 3 )   1998年03月

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    共著区分:共著  

  • Maltal binding mechanism and a role of the mobile loop of soybean beta-amylase. 査読

    Kunikata T, Nishimura S, Nitta Y.

    Biosci Biotechnol Biochem. 雑誌   60 ( 7 )   1996年07月

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    共著区分:共著  

  • Conformational analysis of elcationin in solution 査読

    Ogawa K, Nishimura S, Doi M, Kyogoku Y, Hayashi M, Kobayashi Y.

    Eur. J. Biochem. 雑誌   222 ( 2 )   1994年06月

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    共著区分:共著  

  • Three-dimensional structure of human insulin-like growth factor-I (IGF-I) determined by H-NMR and distance geometry 査読

    Sato A, Nishimura S, Ohkubo T, Kyogoku Y, Koyama S, Kobayashi M, Yasuda T, Kobayashi Y

    Int. J. Peptide Protein Res. 雑誌   41 ( 5 )   1993年05月

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    共著区分:共著  

  • H-NMR Assingment and Secondary Structure of Human Insulin-Like Growth Factor-I (IGF-I) in Solution 査読

    Sato A, Nishimura S, Ohkubo T, Kyogoku Y, Koyama S, Kobayashi M, Yasuda T, Kobayashi Y

    J. Biochem. 雑誌   111 ( 4 )   1992年04月

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    共著区分:共著  

  • Solution conformation of endothelin determined by means of H-NMR spectroscopy and distance geometry calculations 査読

    Haruhiko Tamaoki, Yuji Kobayashi, Shigenori Nishimura, Tadayasu Ohkubo, Yoshimasa Kyogoku, Kiichiro Nakajima, Shin-ichiro Kumagaye, Terutoshi Kimura, Shumpei Sakakibara

    Protein Engineering 雑誌   4 ( 5 )   1991年06月

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    共著区分:共著  

  • A new alpha-helical motif in membrane active peptides.

    Kobayashi Y1, Sato A, Takashima H, Tamaoki H, Nishimura S, Kyogoku Y, Ikenaka K, Kondo T, Mikoshiba K, Hojo H, Aimoto S, Moroder L.

    Neurochemistry International 雑誌   18 ( 4 )   1991年03月

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    共著区分:共著  

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講演・口頭発表等

  • In silicoスクリーニングによるTrypanosoma brucei由来GMP reductaseに対する新規アロステリック阻害剤の開発 国内会議

    松本 彩佳, 竹内 悠真, 西村 重徳, 岡田 哲也, 乾 隆

    第26回 日本蛋白質科学会年会  2023年07月  日本蛋白質科学会

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋  

  • X線結晶構造解析を利用したアデニンヌクレオチドおよびリバビリン誘導体によるTrypanosoma brucei由来GMP reductaseの阻害メカニズムの解明 国内会議

    竹内 悠真,馬瀬 ひかる,西村 重徳,岡田 哲也,乾 隆

    バイオ・メディカル・フォーラム2023  2023年01月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の多量体化による腫瘍標的ドラッグデリバリーシステムの開発

    若林 光哉, 吉田 はるな, 下地 真広, 大久保 理奈, 中辻 匡俊, 西村 重徳, 乾 隆

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2022年11月  (公社)日本生化学会

  • Trypanosoma brucei由来GMP reductaseとAMPとの複合体のX線結晶構造解析 国内会議

    竹内 悠真, 今村 章, 岡田 哲也, 馬瀬 ひかる, 西村 重徳, 乾 隆

    第94回日本生化学会大会  2021年11月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • Trypanosoma brucei由来GMP reductaseとAMPとの複合体のX線結晶構造解析

    竹内 悠真, 今村 章, 岡田 哲也, 馬瀬 ひかる, 西村 重徳, 乾 隆

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2021年11月  (公社)日本生化学会

  • リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の多量体化による腫瘍標的ナノキャリアの開発

    吉田 はるな, 下地 真広, 古田 航祐, 大久保 理奈, 西村 重徳, 乾 隆

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2020年09月  (公社)日本生化学会

  • リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の多量体化による腫瘍組織特異的ナノキャリアの開発

    吉田 はるな, 下地 真広, 古田 航祐, 大久保 理奈, 田代 朝弓, 中辻 匡俊, 西村 重徳, 乾 隆

    日本DDS学会学術集会プログラム予稿集  2020年08月  日本DDS学会

  • Crystal structure of dog allergen Can f 1 国内会議

    Keisuke Suda, Haruka Muroya, Yuma Fukutomi, Shigenori Nishimura, Osamu Ishibashi, Takashi Inui

    第20回日本蛋白質科学会年会  2020年07月 

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    会議種別:ポスター発表  

  • 微生物由来耐熱性β-アミラーゼの性質とX線結晶構造解析

    田中 真奈, 西村 重徳, 谷 修治, 炭谷 順一, 川口 剛司

    日本生物工学会大会講演要旨集  2019年08月  (公社)日本生物工学会

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産学官連携可能研究(シーズ)概要

  • 有用酵素の構造と機能の分子レベルでの解析

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    糖質関連酵素をはじめとする様々な酵素について、X線結晶構造解析、NMR、CDを用いて構造を解析するとともに、蛋白質工学的手法を用いて触媒メカニズムを分子レベルで研究する

科研費獲得実績

  • リバビリンによる抗原虫作用の機序解明に基づくアフリカトリパノソーマ症の新薬開発

    挑戦的研究(開拓)  2024年

  • リバビリンによる抗原虫作用の機序解明に基づくアフリカトリパノソーマ症の新薬開発

    挑戦的研究(開拓・萌芽)  2023年

  • リバビリンによる抗原虫作用の機序解明に基づくアフリカトリパノソーマ症の新薬開発

    挑戦的研究(開拓・萌芽)  2022年

  • リバビリンによる抗原虫作用の機序解明に基づくアフリカトリパノソーマ症の新薬開発

    挑戦的研究(開拓・萌芽)  2021年04月

  • マルトトリオシル配糖体合成酵素における糖転移反応の分子基盤と応用展開

    2017年

  • 低アレルゲン化ワクチンを用いたアレルゲン免疫療法によるイヌアレルギー治療への挑戦

    2017年

  • エキソ型α-アミラーゼの基質認識と糖転移反応の分子基盤

    2014年

  • GMP reductaseを標的とした新規アフリカ睡眠病治療薬の開発

    2013年

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担当授業科目

  • 生命機能化学概論

    2024年度   週間授業   大学

  • 生命機能化学概論

    2023年度   週間授業   大学

  • 生物物理化学実験

    2023年度   週間授業   大学

  • 初年次ゼミナール

    2023年度   週間授業   大学

  • 生物物理化学実験

    2023年度   週間授業   大学

  • 生命機能化学研究プレゼンテーション

    2023年度   集中講義   大学院

  • バイオインフォマティクス基礎実習

    2023年度   週間授業   大学

  • 酵素化学

    2023年度   週間授業   大学

  • バイオインフォマティクス特論

    2023年度     大学院

  • 生命機能化学概論

    2022年度   週間授業   大学

  • 生命機能化学研究プレゼンテーション

    2022年度   集中講義   大学院

  • 生物物理化学実験

    2022年度   週間授業   大学

  • 酵素化学

    2022年度   週間授業   大学

  • 食品衛生学実習

    2022年度   実習   大学

  • 化学実験

    2021年度   実習  

  • 酵素化学

    2021年度    

  • 生命機能化学概論

    2021年度    

  • 生物物理化学実験

    2021年度   実習  

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社会貢献活動 ⇒ 社会貢献実績一覧へ

  • 授業体験WEEK(高校生対象) 酵素化学

    2019年04月 - 2020年03月

  • 授業体験WEEK(高校生対象) 酵素化学

    2018年04月 - 2019年03月

  • 授業体験WEEK(高校生対象) 酵素化学

    2017年04月 - 2018年03月