2025/02/28 更新

写真a

マツモト　タクヤ
松本　拓也
Matsumoto Takuya
担当
大学院工学研究科 物質化学生命系専攻 准教授
工学部 化学工学科
職名
准教授
所属
工学研究院
所属キャンパス
中百舌鳥キャンパス

担当・職階

  • 大学院工学研究科 物質化学生命系専攻 

    准教授  2024年04月 - 継続中

  • 大学院工学研究科 物質化学生命系専攻 

    助教  2022年04月 - 2024年03月

  • 工学部 化学工学科 

    准教授  2024年04月 - 継続中

  • 工学部 化学工学科 

    助教  2022年04月 - 2024年03月

取得学位

  • 博士（工学） （ 神戸大学 ）

研究分野

  • ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / 反応工学、プロセスシステム工学

  • ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学

  • ライフサイエンス / 応用微生物学

  • ライフサイエンス / 応用生物化学

研究キーワード

  • 反応工学

  • 微生物

  • 酵素

  • 生物化学工学

  • 合成生物学

  • 酵素工学

研究概要

  • 微生物を用いた有用物質生産

  • 酵素を用いた物質変換

  • 微生物を用いたプラスチックリサイクル

  • 微生物を用いた電気培養

研究歴

  • 微生物を用いたプラスチックリサイクル

    PETase, 大腸菌  個人研究

    2020 - 継続中 

  • 大腸菌を用いた有用物質生産技術の開発

    個人研究

    2018年04月 - 継続中 

  • 酵母を用いた有用物質生産技術の開発

    個人研究

    2018年04月 - 継続中 

  • 酵素を用いた物質変換技術の開発

    個人研究

    2018年04月 - 継続中 

所属学協会

  • 極限環境生物学会

    2019年10月 - 継続中   国内

  • 日本蛋白質科学会

    2019年02月 - 継続中   国内

  • 酵素工学研究会

    2013年10月 - 継続中   国内

  • 日本生物工学会

    2010年03月 - 継続中   国内

  • 化学工学会

    2009年10月 - 継続中   国内

受賞歴

  • 田中貴金属記念財団奨励賞

    2022年03月   田中貴金属記念財団  

  • 第7回新化学技術研究奨励賞

    2018年07月   新化学技術推進協会  

  • 21th Young Asian Biochemical Engineers Community ポスター賞

    2015年10月   Asian Federation of Biotechnology  

  • 17th Young Asian Biochemical Engineers Community ポスター賞

    2011年10月   Asian Federation of Biotechnology  

職務経歴（学外）

  • 大阪公立大学   大学院工学研究科 物質化学生命系専攻 化学工学分野

    2022年04月 - 継続中

  • 大阪府立大学   大学院工学研究科 物質・化学系専攻 化学工学分野

    2018年04月 - 2022年03月

  • 神戸大学大学院　科学技術イノベーション研究科 特命助教

    2016年04月 - 2018年03月

  • 神戸大学　自然科学系先端融合研究環　重点研究部 助教

    2014年03月 - 2016年03月

  • 日本学術振興会特別研究員（PD）

    2013年10月 - 2014年02月

  • 日本学術振興会特別研究員（DC2）

    2012年04月 - 2013年09月

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学歴

  • 神戸大学   工学研究科   応用化学専攻   博士課程   卒業・修了

    - 2013年09月

  • 神戸大学   工学研究科   修士課程   卒業・修了

    2009年04月 - 2011年03月

  • 神戸大学   工学部   応用化学科   学士課程   卒業・修了

    2005年04月 - 2009年03月

論文

  • Introducing glutamic acid residues to acyl-ACP reductase to enhance alka(e)ne production in Escherichia coli: Computer-aided design and subsequent experimental validation

    Han J.

    Biochemical and Biophysical Research Communications   745   151237   2025年01月（ ISSN:0006291X ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2024.151237

    PubMed

  • Enhancing D-lactic acid production by optimizing the expression of D-LDH gene in methylotrophic yeast Komagataella phaffii

    Inoue Y.

    Biotechnology for Biofuels and Bioproducts   17 ( 1 )   149   2024年12月（ eISSN:2731-3654 ）

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  • Improvement of lipid production from glucose/xylose mixed-sugar by the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi through ultra-violet mutagenesis

    Kamba S.

    Enzyme and Microbial Technology   183   110551 - 110551   2024年11月（ ISSN:0141-0229 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.enzmictec.2024.110551

    PubMed

  • Co-culture systems of microalgae and heterotrophic microorganisms: applications in bioproduction and wastewater treatment and elucidation of mutualistic interactions 査読

    Takahashi M.

    World Journal of Microbiology and Biotechnology   40 ( 11 )   368   2024年10月（ ISSN:0959-3993 ） （ eISSN:1573-0972 ）

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  • Reshaping the substrate-binding pocket of acyl-ACP reductase to enhance the production of sustainable aviation fuel in Escherichia coli 査読

    Han J.

    Biotechnology and Bioengineering   122 ( 1 )   211 - 222   2024年10月（ ISSN:0006-3592 ） （ eISSN:1097-0290 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/bit.28863

    PubMed

  • Co-utilization of microalgae and heterotrophic microorganisms improves wastewater treatment efficiency 査読

    Takahashi M.

    Applied Microbiology and Biotechnology   108 ( 1 )   468   2024年09月（ ISSN:0175-7598 ） （ eISSN:1432-0614 ）

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  • Induction of point and structural mutations in engineered yeast Saccharomyces cerevisiae improve carotenoid production 査読

    Yamada R.

    World Journal of Microbiology and Biotechnology   40 ( 7 )   230   2024年06月（ ISSN:0959-3993 ） （ eISSN:1573-0972 ）

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  • Development of a metabolic engineering technology to simultaneously suppress the expression of multiple genes in yeast and application in carotenoid production 査読

    Yamada R.

    World Journal of Microbiology and Biotechnology   40 ( 7 )   227   2024年06月（ ISSN:0959-3993 ） （ eISSN:1573-0972 ）

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  • Improvement of cell growth in green algae Chlamydomonas reinhardtii through co-cultivation with yeast Saccharomyces cerevisiae 査読

    Karitani Y.

    Biotechnology Letters   46 ( 3 )   431 - 441   2024年04月（ ISSN:0141-5492 ） （ eISSN:1573-6776 ）

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  • UV mutagenesis improves growth potential of green algae in a green algae–yeast co-culture system 査読

    Yukino Karitani, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    Archives of Microbiology   206 ( 2 )   61   2024年01月（ ISSN:0302-8933 ） （ eISSN:1432-072X ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1007/s00203-023-03796-2

    PubMed

    その他URL： https://link.springer.com/article/10.1007/s00203-023-03796-2/fulltext.html

  • Display of PETase on the Cell Surface of Escherichia coli Using the Anchor Protein PgsA 査読

    Takuma Yamashita, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Applied Biochemistry and Biotechnology   196 ( 8 )   1 - 13   2024年01月（ ISSN:02732289 ）

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    担当区分：責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1007/s12010-023-04837-8

    PubMed

  • Transition of stability of putidaredoxin reductase by introducing proline 査読

    Taiki Okamura, Rina Aritomi, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hidehiko Hirakawa, Hiroyasu Ogino

    Biochemical Engineering Journal   201   109139 - 109139   2024年01月（ ISSN:1369703X ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.bej.2023.109139

  • Building a machine-learning model to predict optimal mevalonate pathway gene expression levels for efficient production of a carotenoid in yeast 査読

    Shun Shimazaki, Ryosuke Yamada, Yoshiki Yamamoto, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    Biotechnology Journal   19 ( 1 )   e2300285   2024年01月（ ISSN:18606768 ） （ eISSN:1860-7314 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1002/biot.202300285

    PubMed

    その他URL： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/biot.202300285

  • Sortase A-Mediated Enzyme Assembly on Multimeric Protein for Improving Mevalonate Production

    Munenori Hashimoto, Masahiro Fujitani, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Synthetic Biology and Engineering   2 ( 4 )   10017 - 10017   2024年（ ISSN:2958-9053 ）

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    担当区分：責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.70322/sbe.2024.10017

  • Enhancing 3-hydroxypropionic acid production in Saccharomyces cerevisiae through enzyme localization within mitochondria 査読

    Takuya Matsumoto, Takashi Otani, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Biochemical and Biophysical Research Communications   680   1 - 6   2023年11月（ ISSN:0006-291X ）

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2023.09.010

    PubMed

  • Engineering acyl-ACP reductase with fusion tags enhances alka(e)ne synthesis in Escherichia coli 査読

    Jiahu Han, Koki Asano, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Enzyme and Microbial Technology   168   110262 - 110262   2023年05月（ ISSN:01410229 ）

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    担当区分：責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.enzmictec.2023.110262

    PubMed

  • Construction of a machine-learning model to predict the optimal gene expression level for efficient production of d-lactic acid in yeast 査読

    Yoshiki Yamamoto, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    World Journal of Microbiology and Biotechnology   39 ( 3 )   69   2023年03月（ ISSN:09593993 ） （ eISSN:1573-0972 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1007/s11274-022-03515-x

    PubMed

    その他URL： https://link.springer.com/article/10.1007/s11274-022-03515-x/fulltext.html

  • Identification of genes responsible for absorbing palladium ion in Escherichia coli. 査読

    Matsumoto T, Tanaka Y, Kamino M, Yamada R, Konishi Y, Ogino H

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   2023年02月（ ISSN:0916-8451 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1093/bbb/zbad021

    PubMed

  • Mevalonate production by electro-fermentation in Escherichia coli via Mtr-based electron transfer system 査読

    Takuya Matsumoto, Kazuki Higuma, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Biochemical Engineering Journal   191   108772 - 108772   2023年02月（ ISSN:1369703X ）

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.bej.2022.108772

  • Promoting cell growth and characterizing partial symbiotic relationships in the co‐cultivation of green alga Chlamydomonas reinhardtii and Escherichia coli 査読

    Ryosuke Yamada , Moe Yokota , Takuya Matsumoto , Ben Hankamer , Hiroyasu Ogino

    18 ( 2 )   2200099   2022年12月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

  • Mitochondrial expression of metabolic enzymes for improving carotenoid production in Saccharomyces cerevisiae 査読

    Takuya Matsumoto, Tomoki Osawa, Hikaru Taniguchi, Akira Saito, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Biochemical Engineering Journal   189   108720 - 108720   2022年12月（ ISSN:1369-703X ）

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.bej.2022.108720

  • Protein engineering to improve the stability of Thermomyces lanuginosus lipase in methanol 査読

    Taiki Okamura, Yohei Nogami, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Biochemical Engineering Journal   187   108659 - 108659   2022年11月（ ISSN:1369-703X ）

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    担当区分：責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1016/j.bej.2022.108659

  • Bioengineering for the industrial production of 2,3-butanediol by the yeast, Saccharomyces cerevisiae. 査読

    Ryosuke Mitsui, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    World journal of microbiology & biotechnology   38 ( 3 )   38 - 38   2022年01月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1007/s11274-021-03224-x

    PubMed

  • Improving carotenoid production in recombinant yeast, Saccharomyces cerevisiae, using ultrasound-irradiated two-phase extractive fermentation 査読

    R. Yamada, Y. Ando, R. Mitsui, A. Mizobata, S. Yoshihara, H. Tokumoto, T. Matsumoto, H. Ogino

    Engineering in Life Sciences 雑誌   2022年01月

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    共著区分：共著  

  • Improving carotenoid production in recombinant yeast, Saccharomyces cerevisiae, using ultrasound-irradiated two-phase extractive fermentation.

    Ryosuke Yamada, Yorichika Ando, Ryosuke Mitsui, Asuka Mizobata, Shizue Yoshihara, Hayato Tokumoto, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    Engineering in life sciences   22 ( 1 )   4 - 12   2022年01月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    Carotenoids are hydrophobic compounds that exhibit excellent bioactivity and can be produced by recombinant S. cerevisiae. Irradiating microorganisms with ultrasonic waves increase the productivity of various useful chemicals. Ultrasonic waves are also used to extract useful chemicals that accumulate in microbial cells. In this study, we aimed to improve the carotenoid production efficiency of a recombinant S. cerevisiae using an ultrasonic-irradiation based two-phase extractive fermentation process. When isopropyl myristate was used as the extraction solvent, a total of 264 mg/L of carotenoid was produced when batches were subjected to ultrasonic-irradiation at 10 W, which was a 1.3-fold increase when compared to the control. Transcriptome analysis suggested that one of the reasons for this improvement was an increase in the number of living cells. In fact, after 96 h of fermentation, the number of living cells increased by 1.4-fold upon irradiation with ultrasonic waves. Consequently, we succeeded in improving the carotenoid production in a recombinant S. cerevisiae strain using a ultrasonic-irradiated two-phase extractive fermentation and isopropyl myristate as the solvent. This fermentation strategy has the potential to be widely applied during the production of hydrophobic chemicals in recombinant yeast, and future research is expected to further develop this process.

    DOI： 10.1002/elsc.202100051

    PubMed

  • The synthesis of L-glycyl-L-tyrosine derivatives using organic-solvent stable PST-01 protease from Pseudomonas aeruginosa PST-01 査読

    T. Matsumoto, R. Kitayama, R. Yamada, H. Ogino

    Process Biochemistry   2021年03月

  • Improvement of 2,3-butanediol tolerance in Saccharomyces cerevisiae by using a novel mutagenesis strategy 査読

    A. Mizobata, R. Mitsui, R. Yamada, T. Matsumoto, S. Yoshihara, H. Tokumoto, H. Ogino

    Journal of Bioscience and Bioengineering 雑誌   2021年03月

  • Improvement of 2,3-butanediol tolerance in Saccharomyces cerevisiae by using a novel mutagenesis strategy.

    Asuka Mizobata, Ryosuke Mitsui, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Shizue Yoshihara, Hayato Tokumoto, Hiroyasu Ogino

    Journal of bioscience and bioengineering   131 ( 3 )   283 - 289   2021年03月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国内誌  

    Although the yeast Saccharomyces cerevisiae has been used to produce various bio-based chemicals, including solvents and organic acids, most of these products inhibit yeast growth at high concentrations. In general, it is difficult to rationally improve stress tolerance in yeast by modifying specific genes, because many of the genes involved in stress response remain unidentified. Previous studies have reported that various forms of stress tolerance in yeast were improved by introducing random mutations, such as DNA point mutations and DNA structural mutations. In this study, we developed a novel mutagenesis strategy that allows for the simultaneous performance of these two types of mutagenesis to construct a yeast variant with high 2,3-butanediol (2,3-BDO) tolerance. The mutations were simultaneously introduced into S. cerevisiae YPH499, accompanied by a stepwise increase in the concentration of 2,3-BDO. The resulting mutant YPH499/pol3δ/BD_392 showed 4.9-fold higher cell concentrations than the parental strain after 96 h cultivation in medium containing 175 g/L 2,3-BDO. Afterwards, we carried out transcriptome analysis to characterize the 2,3-BDO-tolerant strain. Gene ontology enrichment analysis with RNA sequence data revealed an increase in expression levels of genes related to amino acid metabolic processes. Therefore, we hypothesize that the yeast acquired high 2,3-BDO tolerance by amino acid function. Our research provides a novel mutagenesis strategy that achieves efficient modification of the genome for improving tolerance to various types of stressors.

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2020.11.004

    PubMed

  • The synthesis of l-glycyl-l-tyrosine derivatives using organic-solvent stable PST-01 protease from Pseudomonas aeruginosa PST-01

    Takuya Matsumoto, Ruri Kitayama, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    Process Biochemistry   102   186 - 189   2021年03月（ ISSN:1359-5113 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.procbio.2021.01.005

  • Improvement of lactic acid tolerance by cocktail δ-integration strategy and identification of the transcription factor PDR3 responsible for lactic acid tolerance in yeast Saccharomyces cerevisiae.

    Ryosuke Yamada, Yuki Kumata, Ryosuke Mitsui, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    World journal of microbiology & biotechnology   37 ( 2 )   19 - 19   2021年01月（ ISSN:0959-3993 ） （ eISSN:1573-0972 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    Although, yeast Saccharomyces cerevisiae is expected to be used as a host for lactic acid production, improvement of yeast lactic acid tolerance is required for efficient non-neutralizing fermentation. In this study, we optimized the expression levels of various transcription factors to improve the lactic acid tolerance of yeast by a previously developed cocktail δ-integration strategy. By optimizing the expression levels of various transcription factors, the maximum D-lactic acid production and yield under non-neutralizing conditions were improved by 1.2. and 1.6 times, respectively. Furthermore, overexpression of PDR3, which is known as a transcription factor involved in multi-drug resistance, effectively improved lactic acid tolerance in yeast. In addition, we clarified for the first time that high expression of PDR3 contributes to the improvement of lactic acid tolerance. PDR3 is considered to be an excellent target gene for studies on yeast stress tolerance and further researches are desired in the future.

    DOI： 10.1007/s11274-020-02977-1

    PubMed

  • Improvement of lactic acid tolerance by cocktail δ-integration strategy and identification of the transcription factor PDR3 responsible for lactic acid tolerance in yeast Saccharomyces cerevisiae

    R. Yamada, Y. Kumata, R. Mitsui, T. Matsumoto, H. Ogino

    Journal of Microbiology and Biotechnology 雑誌   2021年01月

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    共著区分：共著  

  • Identification of genes responsible for reducing palladium ion in Escherichia coli 査読

    T Matsumoto, M Kamino, R Yamada, Y Konishi, H Ogino

    Journal of Biotechnology 著書   2020年12月

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    共著区分：共著  

  • Construction of lactic acid-tolerant Saccharomyces cerevisiae by using CRISPR-Cas-mediated genome evolution for efficient D-lactic acid production 査読

    R Mitsui, R Yamada, T Matsumoto, S Yoshihara, H Tokumoto, H Ogino

    Applied Microbiology and Biotechnology 雑誌   2020年11月

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    共著区分：共著  

  • Construction of lactic acid-tolerant Saccharomyces cerevisiae by using CRISPR-Cas-mediated genome evolution for efficient D-lactic acid production.

    Ryosuke Mitsui, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Shizue Yoshihara, Hayato Tokumoto, Hiroyasu Ogino

    Applied microbiology and biotechnology   104 ( 21 )   9147 - 9158   2020年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    Lactic acid (LA) is chemically synthesized or fermentatively produced using glucose as substrate, mainly using lactic acid bacteria. Polylactic acid is used as a biodegradable bioplastic for packaging materials, medical materials, and filaments for 3D printers. In this study, we aimed to construct a LA-tolerant yeast to reduce the neutralization cost in LA production. The pHLA2-51 strain was obtained through a previously developed genome evolution strategy, and transcriptome analysis revealed the gene expression profile of the mutant yeast. Furthermore, the expression of the genes associated with glycolysis and the LA synthesis pathway in the LA-tolerant yeast was comprehensively and randomly modified to construct a D-LA-producing, LA-tolerant yeast. In detail, DNA fragments expressing thirteen genes, HXT7, HXK2, PGI1, PFK1, PFK2, FBA1, TPI1, TDH3, PGK1, GPM1, ENO2, and PYK2, and D-lactate dehydrogenase (D-LDH) from Leuconostoc mesenteroides were randomly integrated into the genomic DNA in the LA-tolerant yeast. The resultant engineered yeast produced about 33.9 g/L of D-LA from 100 g/L glucose without neutralizing agents in a non-neutralized condition and 52.2 g/L of D-LA from 100 g/L glucose with 20 g/L CaCO3 in a semi-neutralized condition. Our research provides valuable insights into non-neutralized fermentative production of LA. KEY POINTS: • Lactic acid (LA) tolerance of yeast was improved by genome evolution. • The transcription levels of 751 genes were changed under LA stress. • Rapid LA production with semi-neutralization was achieved by modifying glycolysis. • A versatile yeast strain construction method based on the CRISPR system was proposed.

    DOI： 10.1007/s00253-020-10906-3

    PubMed

  • Metabolic engineering of E. coli for improving mevalonate production to promote NADPH regeneration and enhance acetyl‐CoA supply 査読

    Daichi Satowa, Ryosuke FujiwaraShogo UchioMariko NakanoChisako, OtomoYuuki, HirataTakuya MatsumotoShuhei NodaTsutomu TanakaAkihiko Kondo

    117 ( 7 )   2153 - 2164   2020年07月（ ISSN:0006-3592 ） （ eISSN:1097-0290 ）

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    DOI： 10.1002/bit.27350

    PubMed

    その他URL： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1002/bit.27350

  • Construction of yeast producing patchoulol by global metabolic engineering strategy 査読

    R Mitsui, R Nishikawa, R Yamada, T Matsumoto, H Ogino

    Biotechnology and Bioengineerin 雑誌   2020年05月

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    共著区分：共著  

  • Construction of yeast producing patchoulol by global metabolic engineering strategy. 査読

    Ryosuke Mitsui, Riru Nishikawa, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    Biotechnology and bioengineering   117 ( 5 )   1348 - 1356   2020年05月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    Patchoulol is a sesquiterpene alcohol found in the leaves of the patchouli plant that can be extracted by steam distillation. Notably, patchoulol is an essential natural product frequently used in the chemical industry. However, patchouli produces an insignificant amount of patchoulol, not to mention steam distillation, and requires a lot of energy and time. Recombinant microorganisms that can be cultured in mild conditions and can produce patchoulol from renewable biomass resources may be a promising alternative. We previously developed the global metabolic engineering strategy (GMES), which produces a comprehensive metabolic modification in yeast, using the cocktail δ-integration method. In this study, we aimed to produce patchoulol by modifying engineered yeast. The expression of nine genes involved in patchoulol synthesis was modulated using GMES. Regarding patchoulol production, the resultant strain, YPH499/PAT167/MVA442, showed a concentration of 42.1 mg/L, a production rate of 8.42 mg/L/d, and a yield of 2.05 mg/g-glucose, respectably. These concentration values, production rate, and yield obtained through batch-fermentation in this study were high level when compared to previously reported recombinant microorganism studies. GMES could be used as a potential strategy for producing secondary metabolites from plants in recombinant Saccharomyces cerevisiae.

    DOI： 10.1002/bit.27284

    PubMed

  • Metabolic engineering of E. coli for improving mevalonate production to promote NADPH regeneration and enhance acetyl‐CoA supply 査読

    Daichi Satowa, Ryosuke Fujiwara, Shogo Uchio, Mariko Nakano, Chisako Otomo, Yuuki Hirata, Takuya Matsumoto, Shuhei Noda, Tsutomu Tanaka, Akihiko Kondo

    Biotechnology and Bioengineering 雑誌   2020年04月

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    共著区分：共著  

  • N-linked glycosylation of thermostable lipase from Bacillus thermocatenulatus to improve organic solvent stability 査読

    S Kajiwara, R Yamada, T Matsumoto, H Ogino

    Enzyme and microbial technology 雑誌   2020年01月

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    共著区分：共著  

  • n-Butylamine production from glucose using a transaminase-mediated synthetic pathway in Escherichia coli. 査読

    Takuya Matsumoto, Yuki Mori, Tsutomu Tanaka, Akihiko Kondo

    Journal of bioscience and bioengineering   129 ( 1 )   99 - 103   2020年01月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国内誌  

    Bioamination methods using microorganisms have attracted much attention because of the increasing demand for environmentally friendly bioprocesses. n-Butylamine production from glucose in Escherichia coli was demonstrated in this study, which has never been reported because of the absence of n-butylamine-producing pathway in nature. We focused on a transaminase-mediated cascade for bioamination from an alcohol or aldehyde. The cascade can convert an alcohol or an aldehyde to the corresponding amine with l-alanine as an amine donor. Here, n-butyraldehyde, which is a metabolic intermediate in the n-butanol producing pathway, is a potential intermediate for producing n-butylamine using this cascade. Hence, the n-butanol-producing pathway and the transaminase-mediated cascade were combined into a synthetic metabolic pathway for producing n-butylamine from glucose. Firstly, we demonstrated the conversion of n-butanol to n-butylamine using a three enzyme-mediated cascade. n-Butanol was successfully converted to n-butylamine in 92% yield in the presence of l-alanine and ammonium chloride. Then, the n-butanol-producing pathway and transaminase-mediated cascade were introduced into E. coli. Using this system, n-butylamine was successfully produced from glucose as a carbon source at a concentration of 53.2 mg L-1 after 96 h cultivation using a ppc (phosphoenolpyruvate carboxylase)-deficient strain. To the best of our knowledge, this is the first report of the direct production of n-butylamine from glucose, and may provide a starting point for the development of microbial methods to produce other bioamines.

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2019.06.015

    PubMed

  • N-linked glycosylation of thermostable lipase from Bacillus thermocatenulatus to improve organic solvent stability. 査読

    Shota Kajiwara, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    Enzyme and microbial technology   132   109416 - 109416   2020年01月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    A thermostable lipase from Bacillus thermocatenulatus was glycosylated by forming the consensus sequence (-NXS/T-) for N-linked glycosylation by site-directed mutagenesis. Among the eight BTL2 mutants including the consensus sequence, six BTL2 mutants, A277 N, A290 N, Y200 N, T236 N, T238 N, and P261 N, were glycosylated. Among the six mutants, glycosylated A277 N and T236 N showed higher stability in the presence of 25% (v/v) DMSO (74.3 and 72.8% of initial activity was remained after incubation at 45 °C for 20 h, respectively) than deglycosylated A277 N and T236 N (57.2 and 45.1% of initial activity was remained, respectively). These glycosylated mutants also showed higher remaining activity than wild-type BTL2 (56.0% of the initial activity were remained). Furthermore, the glycosylated mutant T236 N showed longer half-lives in the presence of 25% (v/v) ethylene glycol, DMSO, and DMF (161, 133, and 56.7 h at 45 °C, respectively) than deglycosylated mutant T236 N (107, 91.9, and 42.8 h, respectively). N-linked glycosylation may be a promising approach for preparing enzymes to retain their activity in the presence of organic solvents.

    DOI： 10.1016/j.enzmictec.2019.109416

    PubMed

  • Chemical treatments for modification and immobilization to improve the solvent-stability of lipase. 査読

    Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    World journal of microbiology & biotechnology   35 ( 12 )   193 - 193   2019年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    Lipase is a lipolytic enzyme that catalyzes the hydrolysis of lipids and esterification reactions. Lipase has been utilized in industrial uses, food processing, and therapeutic applications as a biocatalyst. However, substrates of lipase are often insoluble in water, and this problem limits its utility. Lipases are also used in organic solvents where the solvent-stability of lipase is an important factor. There is a huge number of approaches that can be undertaken to improve the organic solvent-stability of lipases. For example, screening of solvent-tolerant lipase in nature and direct evolution of lipase using genetic engineering are some of the employed approaches. Here, we focus on approaches based on the chemical treatment of lipases for modification and immobilization. The solvent-stability of lipase was improved by the attachment of other molecules, such as surfactants, polymers, and carbohydrates. The immobilization of the enzyme is been known to be an effective approach for not only recycling the enzyme but also its stabilization. Several reports have demonstrated that the solvent-stability of lipase is also improved by immobilization. In this review, we provide an overview of the approaches used to improve the solvent-stability of lipase.

    DOI： 10.1007/s11274-019-2777-8

    PubMed

  • n-Butylamine production from glucose using a transaminase-mediated synthetic pathway in Escherichia coli. 査読

    T. Matsumoto, Y. Mori, T. Tanaka*, A. Kondo

    Journal of Bioscience and Bioengineering 雑誌   2019年06月

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    共著区分：共著  

  • Modification of lipase from Candida cylindracea with dextran using the borane-pyridine complex to improve organic solvent stability. 査読

    Shota Kajiwara, Kyohei Komatsu, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Masahiro Yasuda, Hiroyasu Ogino

    Journal of biotechnology   296   1 - 6   2019年04月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   国際・国内誌：国際誌  

    In this study, a commercial lipase derived from Candida cylindracea was chemically modified with dextran by conjugating ε-amine in the lysine residue with the carbonyl residue in oxidized dextran using the borane-pyridine complex as a reducing agent to increase the hydrophilicity of the microenvironment around the lipase in the presence of organic solvents. The degree of modification (53.2%), amount of dextran (0.66 g/g-lipase), specific activity (similar to that of the unmodified lipase), and stability in the presence of ethanol and 2-propanol (the half-lives were 2.24 and 1.86 times longer than those of the unmodified lipase) were higher for the lipase modified at pH 8.0 than for the lipases modified at other pH levels. Following modification with dextran at pH 8.0, the stability of the modified lipase was higher than that of the unmodified lipase in the presence of 25% (v/v) DMSO, ethanol, 2-propanol, toluene, n-hexane, and isooctane (the half-lives were 1.45, 2.24, 1.86, 1.76, 2.67 and 2.95 times longer than those of the unmodified lipase). Therefore, chemical modification with polysaccharides such as dextran using the borane-pyridine complex as a reducing agent could be a promising approach for improving the organic solvent stability of enzymes.

    DOI： 10.1016/j.jbiotec.2019.02.009

    PubMed

  • Modification of lipase from Candida cylindracea with dextran using the borane-pyridine complex to improve organic solvent stability 査読

    Shota Kajiwara, Kyohei Komatsu, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Masahiro Yasuda, Hiroyasu Ogino

    Journal of biotechnology 雑誌   2019年04月

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    共著区分：共著  

  • Improvement of the organic solvent stability of a commercial lipase by chemical modification with dextran 査読

    Shota Kajiwara, Kyohei Komatsu, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Masahiro Yasuda, Hiroyasu Ogino

    Biochemical engineering journal 雑誌   2019年02月

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    共著区分：共著  

  • Improvement of the organic solvent stability of a commercial lipase by chemical modification with dextran

    Kajiwara, S., Komatsu, K., Yamada, R., Matsumoto, T., Yasuda, M., Ogino, H.

    Biochemical Engineering Journal   142   2019年

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bej.2018.11.003

  • Enhancing 3-hydroxypropionic acid production in combination with sugar supply engineering by cell surface-display and metabolic engineering of Schizosaccharomyces pombe 査読

    Seiya Takayama, Aiko Ozaki, Rie Konishi, Chisako Otomo, Mayumi Kishida, Yuuki Hirata, Takuya Matsumoto, Tsutomu Tanaka, Akihiko Kondo

    Microbial cell factories 雑誌   2018年12月

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    共著区分：共著  

  • Streptavidin-hydrogel prepared by sortase A-assisted click chemistry for enzyme immobilization on an electrode 査読

    T Matsumoto, Y Isogawa, T Tanaka, A Kondo

    Biosensors and Bioelectronics 雑誌   99   56 - 61   2018年01月

  • 1, 5-Diaminopentane production from xylooligosaccharides using metabolically engineered Corynebacterium glutamicum displaying beta-xylosidase on the cell surface 査読

    K Imao, R Konishi, M Kishida, Y Hirata, S Segawa, N Adachi, R Matsuura, Y Tsuge, T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Bioresource technology 雑誌   245   1684 - 1691   2017年12月

  • Metabolic engineering of Schizosaccharomyces pombe via CRISPR-Cas9 genome editing for lactic acid production from glucose and cellobiose 査読

    A Ozaki, R Konishi, C Otomo, M Kishida, S Takayama, T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Metabolic engineering communications 雑誌   5   60 - 67   2017年12月

  • Sortase A-Mediated Metabolic Enzyme Ligation in Escherichia coli 査読

    T Matsumoto, K Furuta, T Tanaka, A Kondo

    ACS synthetic biology 雑誌   5 ( 11 )   1284 - 1289   2016年10月

  • Improvement of ectoine productivity by using sugar transporter-overexpressing Halomonas elongata 査読

    K Tanimura, T Matsumoto, H Nakayama, T Tanaka, A Kondo

    Enzyme and microbial technology 雑誌   89   63 - 68   2016年07月

  • 2, 3-Butanediol production from cellobiose using exogenous beta-glucosidase-expressing Bacillus subtilis 査読

    K Tanimura, S Takashima, T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Applied microbiology and biotechnology 雑誌   100 ( 13 )   5781 - 5789   2016年07月

  • Twigged streptavidin polymer as a scaffold for protein assembly 査読

    T Matsumoto, Y Isogawa, K Minamihata, T Tanaka, A Kondo

    Journal of biotechnology 雑誌   225   61 - 66   2016年05月

  • Secretory production of tetrameric native full-length streptavidin with thermostability using Streptomyces lividans as a host 査読

    S Noda, T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Microbial cell factories 雑誌   14 ( 1 )   2015年12月

  • C‐Terminal‐oriented Immobilization of Enzymes Using Sortase A‐mediated Technique 査読

    Y Hata, T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Macromolecular bioscience 雑誌   15 ( 10 )   1375 - 1380   2015年10月

  • Multi-functional glycoside hydrolase: Blon_0625 from Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 査読

    T Matsumoto, S Shimada, Y Hata, T Tanaka, A Kondo

    Enzyme and microbial technology 雑誌   68   10 - 14   2015年01月

  • Two‐Stage Oxidation of Glucose by an Enzymatic Bioanode 査読

    T Matsumoto, S Shimada, K Yamamoto, T Tanaka, A Kondo

    Fuel Cells 雑誌   13 ( 6 )   960 - 964   2013年12月

  • Starchy biomass-powered enzymatic biofuel cell based on amylases and glucose oxidase multi-immobilized bioanode 査読

    K Yamamoto, T Matsumoto, S Shimada, T Tanaka, A Kondo

    New biotechnology 雑誌   30 ( 5 )   531 - 535   2013年06月

  • Site‐specific protein labeling with amine‐containing molecules using Lactobacillus plantarum sortase 査読

    T Matsumoto, R Takase, T Tanaka, H Fukuda, A Kondo

    Biotechnology journal 雑誌   7 ( 5 )   642 - 648   2012年05月

  • Sortase A-catalyzed site-specific coimmobilization on microparticles via streptavidin 査読

    T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Langmuir 雑誌   28 ( 7 )   3553 - 3557   2012年02月

  • Site-specific tetrameric streptavidin-protein conjugation using sortase A 査読

    T Matsumoto, S Sawamoto, T Sakamoto, T Tanaka, H Fukuda, A Kondo

    Journal of biotechnology 雑誌   152 ( 1-2 )   37 - 42   2011年03月

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書籍等出版物

  • 大腸菌によるレアメタルイオンの還元および吸着に関する遺伝子の探索

    松本拓也, 荻野博康（ 担当： 共著）

    シーエムシー･リサーチ 2024年3月 (ISBN: 9784910581507)  2024年03月  （ ISBN:9784910581507 ）

  • 微生物機能を活用したレアメタル・貴金属リサイクル

    松本拓也, 荻野博康（ 担当： 共著 ,  範囲: 大腸菌によるレアメタルイオンの還元および吸着に関する遺伝子の探索）

    シーエムシー･リサーチ  2024年03月  （ ISBN:9784910581507 ）

  • Sortase A-Assisted Metabolic Enzyme Ligation in Escherichia coli for Enhancing Metabolic Flux.

    Takuya MATSUMOTO, Tsutomu TANAKA, Akihiko KONDO（ 担当： 共著）

    Synthetic Biology, Methods in Molecular Biology, Humana Press, New York  2018年05月 

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    担当ページ：1772. 125-136  

  • Sortase Aを用いたタンパク質配向固定化技術の開発

    松本　拓也、田中　勉（ 担当： 共著）

    シーエムシー出版   2018年04月  （ ISBN:9784781313269 ）

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    担当ページ：第３章  

MISC（その他記事）

  • ポリエチレンテレフタレート（PET）は生分解性？

    松本拓也

    日本生物工学会 バイオミディア   98 ( 2 )   2020年02月

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  • Chemical treatments for modification and immobilization to improve the solvent-stability of lipase 査読

    T Matsumoto, R Yamada, H Ogino

    World Journal of Microbiology and Biotechnology   2019年12月

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  • Engineering metabolic pathways in Escherichia coli for constructing a “microbial chassis” for biochemical production 査読

    T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Bioresource technology   245   1362 - 1368   2017年12月

  • Enzyme‐mediated methodologies for protein modification and bioconjugate synthesis 査読

    T Matsumoto, T Tanaka, A Kondo

    Biotechnology journal   7 ( 9 )   1137 - 1146   2012年09月

講演・口頭発表等

  • 点変異と構造変異の導入による酵母のタンパク質生産性向上とカロテノイド生産への応用

    山田亮祐, 井上義文, 仮谷柚希乃, 坂口瑠美, 松本拓也, 荻野博康

    日本農芸化学会2025年度大会  2025年03月 

  • 固定化微細藻類共培養系による排水処理

    高橋美郁, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    日本農芸化学会2025年度大会  2025年03月 

  • カロテノイド生産酵母への変異導入における集積培養条件の検討

    室井誠, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第90年会  2025年03月 

  • PET分解酵素を表層提示した大腸菌触媒の開発

    藏内佑斗, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第90年会  2025年03月 

  • Komagataella phaffii代謝改変株へのUV変異導入によるD-乳酸生産性の向上

    井上義文, 中村海斗, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第90年会  2025年03月 

  • Komagataella phaffiiにおけるD-LDH遺伝子の発現最適化によるメタノールからのD-乳酸生産性向上

    井上義文, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    日本農芸化学会2025年度大会  2025年03月 

  • Engineering acyl-ACP reductase to enhance the alka(e)ne production in Escherichia coli

    韓佳虎, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第90年会  2025年03月 

  • PET分解酵素を表層提示した大腸菌触媒の開発

    藏内佑斗, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    酵素工学研究会第92回講演会  2024年11月 

  • 酵母ミトコンドリアを利用した3-ヒドロキシプロピオン酸生産

    中村あさ陽, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    超越分子システム第3回若手会  2024年10月 

  • アシル-ACP還元酵素の基質結合ポケットの再構築による大腸菌での持続可能な航空燃料生産の強化

    韓佳虎, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    超越分子システム第3回若手会  2024年10月 

  • The surface design of Escherichia coli for efficient PET degradation

    Takuya Matsumoto, Yuto Kurauchi, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    2024年10月 

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    会議種別：口頭発表（一般）  

  • Reshaping the substrate-binding pocket of acyl-ACP reductase to enhance the production of sustainable aviation fuel in Escherichia col

    Jiahu Han, Takuya Matsumoto, Ryosuke Yamada, Hiroyasu Ogino

    2024年10月 

  • PET分解酵素を表層提示した大腸菌触媒の開発

    藏内佑斗, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    超越分子システム第3回若手会  2024年10月 

  • Optimization of D-LDH gene expression for D-lactic acid production from methanol by engineered Komagataella phaffii

    Yoshifumi Inoue, Ryosuke Yamada, Takuya Matsumoto, Hiroyasu Ogino

    2024年10月 

  • 細胞外電子伝達系をリポソーム上で再現した新規反応キャリアーの構築

    松本拓也

    学術変革領域研究(A)「生物を凌駕する無細胞分子システムのボトムアップ構築学」第4回領域会議  2024年09月 

  • 点変異と構造変異の導入による酵母の2,3-ブタンジオール耐性向上

    中村海斗, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第55回秋季大会  2024年09月 

  • Reshaping the substrate-binding pocket of acyl-ACP reductase to enhance the production of sustainable aviation fuel in Escherichia coli

    韓佳虎, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第55回秋季大会  2024年09月 

  • Komagataella phaffiiへのD-LDH遺伝子多コピー組込みによるメタノールからのD-乳酸生産性向上

    井上義文, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第55回秋季大会  2024年09月 

  • 酵母における複数遺伝子同時発現抑制技術の開発とβ-カロテン生産への応用

    山田亮祐, 山本千尋, 松本拓也, 荻野博康

    生物工学若手研究者の集い夏のセミナー  2024年07月 

  • 微細藻類と従属栄養微生物との共培養による排水処理効率の向上

    高橋美郁, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    生物工学若手研究者の集い夏のセミナー  2024年07月 

  • メタノール資化性酵母によるD-乳酸生産を目指したD-LDH発現の検討

    井上義文, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    生物工学若手研究者の集い夏のセミナー  2024年07月 

  • UV変異導入による油脂酵母Lipomyces starkeyiの油脂生産向上 国内会議

    神場創太, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • 分子動力学計算と比較生物学的手法を利用したクチナーゼへのメタノール耐性付与 国内会議

    岡村大毅, 松本拓也, 山田 亮祐, 荻野博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • 細胞内小器官内での酵素局在化を介した出芽酵母における3-ヒドロキシプロピオン酸生産の改善 国内会議

    齋藤明, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • PETaseによるPET前駆体合成および親水性物質との複合化による合成活性の向上 国内会議

    蔭山諄, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • Enhancement of bio-alka(e)nes production by Escherichia coli expressing engineered acyl-ACP reductases with N-terminal tags 国内会議

    韓佳虎, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • Komagataella phaffiiによるメタノールからのD-乳酸生産を目指したD-LDH発現の検討 国内会議

    井上義文, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野 博康

    化学工学会第89年会  2024年03月 

  • D-乳酸生産メチロトローフ酵母と緑藻との共培養によるD-乳酸生産性向上 国内会議

    井上義文, 仮谷柚希乃, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    日本微生物生態学会第36回浜松大会  2023年11月 

  • 酵母を用いた酵素の細胞内小器官局在化による3-ヒドロキシプロピオン酸生産性の改善 国内会議

    齋藤明, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    酵素工学研究会第90回講演会  2023年11月 

  • 変異導入による緑藻・酵母共培養系における緑藻増殖能の向上 国内会議

    仮谷柚希乃, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    日本微生物生態学会第36回浜松大会  2023年11月 

  • PETaseを細胞表層に提示した大腸菌の開発 国内会議

    山下拓真, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    酵素工学研究会第90回講演会  2023年11月 

  • 酵母との共培養による緑藻の増殖能向上 国内会議

    仮谷柚希乃, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第54回秋季大会  2023年09月 

  • 分子動力学計算を利用したクチナーゼへの有機溶媒耐性付与 国内会議

    岡村大毅, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第54回秋季大会  2023年09月 

  • カロテノイド高生産酵母の作製を目指した機械学習モデルの構築 国内会議

    島崎舜, 山田亮祐, 山本祥輝, 松本拓也, 荻野博康

    化学工学会第54回秋季大会  2023年09月 

  • Engineering acyl-ACP reductase with fusion tags enhances alka(e)ne synthesis in Escherichia coli 国内会議

    韓佳虎, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第54回秋季大会  2023年09月 

  • Electro-fermentation in Escherichia coli via Mtr-based electron transfer system 国際会議

    The 28th Symposium of Young Asian Biological Engineers’ Community  2023年07月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • Improvement of methanol stability of cutinase from Saccharomonospora viridis 国際会議

    2023年07月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • アシルキャリヤータンパク質の高発現によるアルカンの生成に優れた大腸菌の開発 国内会議

    松原 武輝, 韓 佳虎, 浅野 紘輝, 松本 拓也, 山田 亮祐, 荻野 博康

    第25回化学工学会学生発表会  2023年03月 

  • 複数遺伝子の同時発現抑制による酵母のβ-カロテン生産性向上 国内会議

    山本 千尋, 三ツ井 良輔, 山田 亮祐, 坂口 瑠美, 松本 拓也, 荻野 博康

    化学工学会第88年会  2023年03月 

  • 基質特異性の異なるThermomyces lanuginosus lipaseライブラリの作製 国内会議

    森岡 りな, 野上 洋平, 松本 拓也, 山田 亮祐, 荻野 博康

    化学工学会第88年会  2023年03月 

  • PETaseを細胞表層に提示した大腸菌の開発 国内会議

    山下 拓真, 松本 拓也, 山田 亮祐, 荻野 博康

    化学工学会第88年会  2023年03月 

  • 酵母による高効率D-乳酸生産を目指した機械学習モデルの構築 国内会議

    山本 祥輝, 山田 亮祐, 松本 拓也, 荻野 博康

    第74回日本生物工学会大会  2022年10月 

  • Thermomyces lanuginosus由来のリパーゼへのメタノール耐性付与 国内会議

    岡村 大毅, 野上 洋平, 松本 拓也, 山田 亮祐, 荻野 博康

    第24回化学工学会学生発表会  2022年03月 

  • 有機溶媒耐性PST-01プロテアーゼを用いたアラニルアラニンの合成 国内会議

    水野ひなた，松本拓也，山田亮祐，冨田健一，星野美奈子，荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 白金イオンの還元および吸着に関する大腸菌の遺伝子の探索 国内会議

    鬼頭和也，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 酵母を用いた酵素のミトコンドリア局在化による3-ヒドロキシプロピオン酸の生産 国内会議

    大谷孝，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 大腸菌の代謝改変によるバイオアルカンの生産性向上 国内会議

    浅野紘輝，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 点変異・構造変異同時導入によるカロテノイド高生産酵母の創製 国内会議

    安藤和哉，山田亮祐，松本拓也，荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 枯草菌との共培養による緑藻の増殖能の向上 国内会議

    大山遥行，山田亮祐，松本拓也，荻野 博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 大腸菌の代謝改変によるバイオアルカンの生産性向上

    浅野紘輝, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 酵母を用いた酵素のミトコンドリア局在化による3-ヒドロキシプロピオン酸の生産

    大谷孝, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会関西大会2021  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • Transcriptome analysis of thermotolerant yeast mutant 国際会議

    R. Mitsui, R. Yamada*, T. Matsumoto, S. Yoshihara, H. Tokumoto, H. Ogino

    The 26th Symposium of Young Asian Biological Engineers’ Community  2021年11月 

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    会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • 点変異・構造変異同時導入による酵母の過酸化水素耐性およびカロテノイド生産性向上 国内会議

    安藤和哉，山田亮祐，松本拓也，荻野博康

    極限環境生物学会2021年度（第22回）年会  2021年11月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • Transcriptome analysis of thermotolerant yeast mutant

    R. Mitsui, R. Yamada, T. Matsumoto, S. Yoshihara, H. Tokumoto, H. Ogino

    2021年11月 

  • 緑藻と枯草菌との共培養による増殖特性の変化 国内会議

    大山遥行，山田亮祐，松本拓也，荻野博康

    第73回日本生物工学会大会  2021年10月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • バイオアルカンの生産性改善を指向した大腸菌の代謝改変 国内会議

    浅野紘輝，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会第52回秋季大会  2021年09月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • バイオアルカンの生産性改善を指向した大腸菌の代謝改変

    浅野紘輝, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第52回秋季大会  2021年09月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 大腸菌によるレアメタルイオンの還元および吸着に関する遺伝子の探索 国内会議

    鬼頭和也，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会第86年会  2021年03月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 酵母を用いた酵素のミトコンドリア局在化による有用物質生産 国内会議

    大谷孝，松本拓也，山田亮祐，荻野博康

    化学工学会第86年会  2021年03月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 大腸菌によるレアメタルイオンの還元および吸着に関する遺伝子の探索

    鬼頭和也, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第86年会  2021年03月 

  • 酵母を用いた酵素のミトコンドリア局在化による有用物質生産

    大谷孝, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第86年会  2021年03月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • ゲノム進化法によって創製した熱耐性酵母の遺伝子発現量解析

    三ツ井良輔, 山田亮祐, 松本拓也, 吉原静恵, 徳本勇人, 荻野博康

    極限環境生物学会2020年度 (第21回)年会  2020年10月 

  • 酵母を用いた酵素のミトコンドリア局在化によるβ-カロテン高効率生産

    大澤知己, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第85年会  2020年03月 

  • セルロース系バイオマスからのメバロン酸の生産を指向した大腸菌の創生

    濱田直樹, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第85年会  2020年03月 

  • Thermomyces lanuginosus由来リパーゼへの有機溶媒耐性付与

    松本拓也, 野上洋平, 山田亮祐, 荻野博康

    極限環境生物学会 第20回年会  2019年11月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • Thermomyces lanuginosus由来リパーゼへの有機溶媒耐性付与

    松本拓也, 野上洋平, 山田亮祐, 荻野博康

    酵素工学研究会第82回講演会  2019年11月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 微生物を触媒とした酸化還元反応の利用

    松本拓也

    第7回TT-netワークショップ 研究発表(大阪府立大学)  2019年10月 

  • Construction and analysis of engineered D-lactic acid tolerant Saccharomyces cerevisiae

    三ツ井良輔, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

  • Production of bioalkanes using engineered Escherichia coli

    濱志緒里, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

  • Modulation of the mevalonate pathway in yeast for efficient patchoulol production by global metabolic engineering

    山田亮祐, 西川利留, 三ツ井良輔, 松本拓也, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

  • Improvement of 2,3-butandiol tolerance in yeast by a novel mutagenesis strategy

    溝端明日香, 三ツ井良輔, 山田亮祐, 松本拓也, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

  • The effect of single gene knockout on mevalonate production by Escherichia coli

    松本拓也, 濱田直樹, 田中勉, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • The improvement of organic solvent-tolerant lipase from Thermomyces lanuginosus

    松本拓也, 野上洋平, 山田亮祐, 荻野博康

    18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress  2019年09月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • The effect of gene knockout on mevalonate production or electricity generation by Escherichia coli

    松本拓也, 濱田直樹, 松井琢人, 田中勉, 荻野博康

    Biotrans2019  2019年07月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • Sortase Aの新規利用法の開発 招待

    松本拓也

    第19回日本蛋白質科学会年会  2019年06月 

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    会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • Thermomyces lanuginosus由来リパーゼへの有機溶媒耐性付与

    松本拓也, 野上洋平, 山田亮祐, 荻野博康

    化学工学会第84年会  2019年03月 

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    会議種別：ポスター発表  

  • 酵母細胞内におけるタンパク質の部位特異的連結技術

    谷口輝, 松本拓也, 山田亮祐, 荻野博康

    酵素工学研究会第90回講演会 

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産学官連携可能研究（シーズ）キーワード

  • 酵素を用いた物質変換技術に関する研究

  • 遺伝子組換え微生物を用いた有用物質生産に関する研究

  • 微生物を用いたPETリサイクル

  • ペプチド転移酵素を使ったタンパク質修飾技術

  • 微生物を用いた電気培養システム

産学官連携可能研究（シーズ）概要

  • 酵素を用いた物質変換技術に関する研究

  • 遺伝子組換え微生物を用いた有用物質生産に関する研究

  • 微生物を用いたPETリサイクル

  • ペプチド転移酵素を使ったタンパク質修飾技術

  • 微生物を用いた電気培養システム

科研費獲得実績

  • 代謝工学を用いた電気発酵の方向づけ

    基盤研究(C)  2026年

  • 細胞外電子伝達系をリポソーム上で再現した新規反応キャリアーの構築

    学術変革領域研究(A)  2025年

  • 代謝工学を用いた電気発酵の方向づけ

    基盤研究(C)  2025年

  • 細胞外電子伝達系をリポソーム上で再現した新規反応キャリアーの構築

    学術変革領域研究(A)  2024年

  • 代謝工学を用いた電気発酵の方向づけ

    基盤研究(C)  2024年

  • 酵素ステープラーを用いた代謝チャネリング技術

    若手研究(B)  2015年04月

  • 生体分子セルフアセンブリを利用した新規タンパク質複合ナノデバイスの構築

    特別研究員奨励費  2012年04月

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奨励寄附金・助成金

  • 微生物触媒を用いたPET含有プラスチックのカーボンリサイクル

    公益財団法人フジシール財団  2024年

  • PET分解酵素を表層提示した大腸菌による廃PETのアップサイクル

    公益財団法人藤森科学技術振興財団  2023年

  • PET分解酵素を表層提示した菌体触媒

    公益財団法人フジシール財団  2023年

  • 微生物-貴金属ハイブリッド触媒を用いた有用物質の一貫生産

    一般財団法人田中貴金属記念財団  2023年

  • 海洋プラスチックを高効率で分解可能な耐塩性酵素の開発

    公益財団法人増屋記念基礎研究振興財団  2021年

  • 有機溶媒に耐性を有するPET分解酵素の開発

    公益財団法人稲盛財団  2020年

  • 高効率物質生産酵母株の構築に向けた代謝酵素複合体のオルガネラ局在化技術の開発

    公益社団法人新化学技術推進協会  2018年

  • 表層提示技術を用いた大腸菌における細胞外電子伝達の構築

    公益財団法人住友財団  2018年

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担当授業科目

  • プログラミング入門A

    2024年度   週間授業   大学

  • 反応工学特論

    2024年度   週間授業   大学院

  • 化工物理化学

    2024年度   週間授業   大学

  • 物質化学生命系特別研究第2

    2024年度   集中講義   大学院

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2024年度   週間授業   大学

  • 物質化学生命系特別演習第2

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究第1

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第1

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習

    2024年度   集中講義   大学院

  • 化学工学実験I

    2024年度   週間授業   大学

  • 化工物理化学

    2024年度   週間授業   大学

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2024年度   週間授業   大学

  • 化学工学実験1

    2024年度   週間授業   大学

  • 反応工学特論

    2024年度   週間授業   大学院

  • 物質化学生命系特別研究第1

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第1

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究第2

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第2

    2024年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究

    2024年度   集中講義   大学院

  • プログラミング入門A

    2024年度   週間授業   大学院

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2023年度   週間授業   大学

  • 物質化学生命系特別演習

    2023年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究第1

    2023年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第1

    2023年度   集中講義   大学院

  • 化学工学実験I

    2023年度   週間授業   大学

  • 物質化学生命系特別研究

    2023年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究第2

    2023年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第2

    2023年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第1

    2022年度   集中講義   大学院

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2022年度   週間授業   大学

  • 化学工学実験I

    2022年度   週間授業   大学

  • 物質化学生命系特別演習

    2022年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別演習第2 （化学工学分野）

    2022年度   集中講義   大学院

  • 物質化学生命系特別研究 （化学工学分野）

    2022年度   集中講義   大学院

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2020年度   実習  

  • 化学工学実験I

    2020年度   実習  

  • 化学工学実験I

    2019年度   実習  

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス

    2019年度   実習  

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ＦＤ活動

  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書  2024年度

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    ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書作成

  • 化学工学実験I指針書  2024年度

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    化学工学実験I指針書作成

  • 化学工学実験I指針書  2023年度

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  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書  2023年度

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  • 化学工学実験I指針書  2022年度

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  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書  2022年度

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  • 化学工学実験I指針書  2021年度

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  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書  2021年度

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  • 化学工学実験I指針書  2020年度

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  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書  2020年度

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    ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書 作成

  • 化学工学実験I指針書  2019年度

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  • ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書作成  2019年度

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    ケミカルエンジニアリングプラクティス指針書

  • 化学工学実験II指針書  2018年度

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    化学工学実験II指針書作成

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