研究者詳細 - 反田　直之

写真a

ソッタ　ナオユキ

反田　直之

SOTTA NAOYUKI

担当

大学院農学研究科応用生物科学専攻助教
農学部応用生物科学科

所属

農学研究院

担当・職階

大学院農学研究科応用生物科学専攻

助教 2024年04月 - 継続中
農学部応用生物科学科

助教 2024年04月 - 継続中

取得学位

博士（農学）（東京大学）

研究分野

ライフサイエンス / 植物栄養学、土壌学

所属学協会

日本植物生理学会
日本数理生物学会
日本土壌肥料学会

受賞歴

第42回日本土壌肥料学会奨励賞

2024 日本土壌肥料学会栄養輸送や応答の数理モデル研究
第２回植物の栄養研究会ポスター賞

反田直之, 藤原徹

2016 植物の栄養研究会不利な栄養環境がゲノムの安定性と子孫のストレス耐性に与える影響の評価

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受賞国：日本国
2015 Joint Meeting of The 5th China-Japan-Korea Colloquium on Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology Poster Award

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Athanasius F.M, Mar?e, Ver?nica A. Grieneisen

2015 CJK-JSMB Rapid regulation of nutrient transporters is crucial for preventing oscillations in the root system

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受賞国：日本国
2014年度東京大会ポスター賞

反田直之, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田昌史, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司, 藤原徹

2014 日本土壌肥料学会転写因子NAC103の変異がホウ素過剰障害におけるDNA損傷を軽減する

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受賞国：日本国

職務経歴（学外）

大阪公立大学農学研究科応用生物科学専攻

2024年04月 - 継続中
Cardiff University 日本学術振興会海外特別研究員

2019年02月 - 2020年10月
東京大学大学院農学生命科学研究科植物栄養・肥料学研究室

2018年05月 - 2024年03月
東京大学大学院農学生命科学研究科植物栄養・肥料学研究室特任助教

2017年04月 - 2018年04月

論文

Ribosome stalling-induced NIP5;1 mRNA decay triggers ARGONAUTE1-dependent transcription downregulation 査読

Mayuki Tanaka, Naoyuki Sotta, Susan Duncan, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Athanasius F M Marée, Satoshi Naito, Verônica A Grieneisen, Toru Fujiwara

Nucleic Acids Research 53 ( 5 ) 2025年02月（ ISSN:03051048 ）

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担当区分：責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/nar/gkaf159

PubMed
Efficient production system for hydrogel-based transparent soil for plant root observation 査読

Naoyuki Sotta, Wenhao Li, Toru Fujiwara

BioTechniques 77 ( 1 ) 35 - 39 2025年01月（ ISSN:07366205 ）

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担当区分：筆頭著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1080/07366205.2025.2457892

PubMed
Time-course analysis system for leaf feeding marks reveals effects of Arabidopsis trichomes on insect herbivore feeding behavior 査読

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

Journal of Experimental Botany 75 ( 17 ) 5428 - 5437 2024年04月（ ISSN:0022-0957 ）（ eISSN:1460-2431 ）

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/erae184

PubMed
Impact of translational regulation on diel expression revealed by time‐series ribosome profiling in Arabidopsis 査読

Haruka Aoyama, Toshihiro Arae, Yui Yamashita, Atsushi Toyoda, Satoshi Naito, Naoyuki Sotta, Yukako Chiba

The Plant Journal 2024年03月

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担当区分：責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/tpj.16716
IMA peptides regulate root nodulation and nitrogen homeostasis by providing iron according to internal nitrogen status 査読

Momoyo Ito, Yuri Tajima, Mari Ogawa-Ohnishi, Hanna Nishida, Shohei Nosaki, Momona Noda, Naoyuki Sotta, Kensuke Kawade, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara, Yoshikatsu Matsubayashi, Takuya Suzaki

Nature Communications 2024年01月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1038/s41467-024-44865-4
Boric acid intercepts 80S ribosome migration from AUG-stop by stabilizing eRF1 査読

Mayuki Tanaka, Takeshi Yokoyama, Hironori Saito, Madoka Nishimoto, Kengo Tsuda, Naoyuki Sotta, Hideki Shigematsu, Mikako Shirouzu, Shintaro Iwasaki, Takuhiro Ito, Toru Fujiwara

Nature Chemical Biology 2024年01月（ ISSN:1552-4450 ）（ eISSN:1552-4469 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1038/s41589-023-01513-0

その他URL： https://www.nature.com/articles/s41589-023-01513-0
A Multi-Target Regression Method to Predict Element Concentrations in Tomato Leaves Using Hyperspectral Imaging 査読

Andrés Aguilar Ariza, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Wei Guo, Takehiro Kamiya

Plant Phenomics 2024年01月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.34133/plantphenomics.0146
Arabidopsis thaliana RPL13aC affects root system architecture through shoot potassium accumulation 査読

Dichao Ma, Hirofumi Fukuda, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

The Plant Journal 116 ( 2 ) 497 - 509 2023年08月（ ISSN:0960-7412 ）（ eISSN:1365-313X ）

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担当区分：責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

SUMMARY

Plant root system architecture shows complex patterns adapting to different nutritional conditions. In Arabidopsis thaliana, root slanting is a behaviour that is observed when plants are grown on a solid agar plate vertically. However, the regulatory mechanisms of root slanting in response to nutrient conditions are not fully understood. In this study, we found that mutants of A. thaliana ribosome protein RPL13aC, which is expressed in root tips and leaves, exhibit a decreased root‐slanting phenotype. Ionomic analysis revealed that rpl13ac mutants have a reduced K content in shoots but not in roots. Because K+ availability has been suggested to affect root coiling, we hypothesized that the decreased root slanting of rpl13ac mutants is caused by the decrease in K content in their shoots. Decapitating shoots or limiting K supply dramatically decreased root slanting in wild‐type (WT) plants. We found that the expression of HIGH‐AFFINITY K+TRANSPORTER 5 (HAK5) significantly decreased in the roots of rpl13ac mutants. Mutants of hak5 showed decreased shoot K contents and decreased root slanting, supporting that the decreased shoot K+ accumulation results in less root slanting. K+ replenishment to the shoots of rpl13ac, hak5 mutants and K‐starved WT plants recovered their root slanting significantly. These results indicate that plants adjust root slanting in response to K+ accumulation in shoots. Further analysis showed that rpl13ac mutants have abnormal thigmotropic responses, which may be responsible for their defects in root slanting. Altogether, these results revealed K+‐dependent mechanisms that affect root system architecture.

DOI： 10.1111/tpj.16386
M2 plants derived from different tillers of a chemically mutagenized rice M1 plant carry independent sets of mutations 査読

Kiyoshi Yamazaki, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

The Plant Journal 116 ( 2 ) 597 - 603 2023年07月（ ISSN:0960-7412 ）（ eISSN:1365-313X ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

SUMMARY

Generation of mutant populations with high genetic diversity is key for mutant screening and crop breeding. For this purpose, the single‐seed descent method, in which one mutant line is established from a single mutagenized seed, is commonly used. This method ensures the independence of the mutant lines, but the size of the mutant population is limited because it is no greater than the number of fertile M1 plants. The rice mutant population size can be increased if a single mutagenized plant produces genetically independent siblings. Here, we used whole‐genome resequencing to examine the inheritance of mutations from a single ethyl methanesulfonate (EMS)‐mutagenized seed (M1) of Oryza sativa in its progeny (M2). We selected five tillers from each of three M1 plants. A single M2 seed was selected from each tiller, and the distributions of mutations induced by EMS were compared. Surprisingly, in most pairwise combinations of M2 siblings from the same parent, ≥85.2–97.9% of all mutations detected were not shared between the siblings. This high percentage suggests that the M2 siblings were derived from different cells of the M1 embryo and indicates that several genetically independent lines can be obtained from a single M1 plant. This approach should allow a large reduction in the number of M0 seeds needed to obtain a mutant population of a certain size in rice. Our study also suggests that multiple tillers of a rice plant originate from different cells of the embryo.

DOI： 10.1111/tpj.16390
NAC103 mutation alleviates DNA damage in an Arabidopsis thaliana mutant sensitive to excess boron. 査読

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Takehiro Kamiya, Ryo Tabata, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masashi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shinichiro Sawa, Toru Fujiwara

Frontiers in plant science 14 1099816 - 1099816 2023年03月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）国際・国内誌：国際誌

Excess boron (B) is toxic to plants and thereby causes DNA damage and cell death in root meristems. However, the underlying mechanisms which link boron and DNA damage remain unclear. It has been reported that the rpt5a-6 mutant of the 26S proteasome is sensitive to excess boron, resulting in more frequent cell death in root meristem and reduced root elongation. In this study, we showed that a reduction in root growth in the rpt5a mutant in the presence of high boron levels is repressed by a mutation in NAC domain containing transcription factor NAC103, a substrate of the proteasome, which functions in the unfolded protein response pathway. The mutation in NAC103 alleviated excess-B-induced DNA damage and cell death in root meristems of the rpt5a mutant. Superoxide ( O 2 - ) staining with nitroblue tetrazolium revealed that boron stress causes O 2 - accumulation in root tips, which was higher in the rpt5a-6 mutant, whereas the accumulation was lower in the rpt5a-6 nac103-3 double mutant. Our work demonstrates the overall involvement of NAC103 in maintaining healthy root meristem under excess boron conditions in the absence of RPT5A proteasome subunit.

DOI： 10.3389/fpls.2023.1099816

PubMed
A low boron condition without high temperature stress induces internal browning in Raphanus sativus L. (Japanese radish) 査読

Naoyuki Sotta, Satoshi Niikura, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara

Soil Science and Plant Nutrition 69 ( 1 ) 19 - 23 2023年01月（ ISSN:0038-0768 ）（ eISSN:1747-0765 ）

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1080/00380768.2022.2153346
Translational Landscape of a C4 Plant, Sorghum bicolor, Under Normal and Sulfur-Deficient Conditions 査読

Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Haruka Aoyama, Seidai Takamatsu, Takamasa Suzuki, Kyoko Miwa, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

Plant and Cell Physiology 63 ( 5 ) 592 - 604 2022年02月（ ISSN:0032-0781 ）（ eISSN:1471-9053 ）

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Abstract

Recent accumulation of genomic and transcriptomic information has facilitated genetic studies. Increasing evidence has demonstrated that translation is an important regulatory step, and the transcriptome does not necessarily reflect the profile of functional protein production. Deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments (ribosome profiling or Ribo-seq) has enabled genome-wide analysis of translation. Sorghum is a C4 cereal important not only as food but also as forage and a bioenergy resource. Its resistance to harsh environments has made it an agriculturally important research subject. Yet genome-wide translational profiles in sorghum are still missing. In this study, we took advantage of Ribo-seq and identified actively translated reading frames throughout the genome. We detected translation of 4,843 main open reading frames (ORFs) annotated in the sorghum reference genome version 3.1 and revealed a number of unannotated translational events. A comparison of the transcriptome and translatome between sorghums grown under normal and sulfur-deficient conditions revealed that gene expression is modulated independently at transcript and translation levels. Our study revealed the translational landscape of sorghum’s response to sulfur and provides datasets that could serve as a fundamental resource to extend genetic research on sorghum, including studies on translational regulation.

DOI： 10.1093/pcp/pcac023

PubMed

その他URL： https://academic.oup.com/pcp/article-pdf/63/5/592/43754653/pcac023.pdf
Retrograde sulfur flow from glucosinolates to cysteine in Arabidopsis thaliana 査読

Ryosuke Sugiyama, Rui Li, Ayuko Kuwahara, Ryo Nakabayashi, Naoyuki Sotta, Tetsuya Mori, Takehiro Ito, Naoko Ohkama-Ohtsu, Toru Fujiwara, Kazuki Saito, Ryohei Thomas Nakano, Paweł Bednarek, Masami Yokota Hirai

Proceedings of the National Academy of Sciences 118 ( 22 ) 2021年06月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）国際・国内誌：国際誌

Specialized (secondary) metabolic pathways in plants have long been considered one-way routes of leading primary metabolite precursors to bioactive end products. Conversely, endogenous degradation of such "end" products in plant tissues has been observed following environmental stimuli, including nutrition stress. Therefore, it is of general interest whether specialized metabolites can be reintegrated into primary metabolism to recover the invested resources, especially in the case of nitrogen- or sulfur-rich compounds. Here, we demonstrate that endogenous glucosinolates (GLs), a class of sulfur-rich plant metabolites, are exploited as a sulfur source by the reallocation of sulfur atoms to primary metabolites such as cysteine in Arabidopsis thaliana Tracer experiments using 34S- or deuterium-labeled GLs depicted the catabolic processing of GL breakdown products in which sulfur is mobilized from the thioglucoside group in GL molecules, potentially accompanied by the release of the sulfate group. Moreover, we reveal that beta-glucosidases BGLU28 and BGLU30 are the major myrosinases that initiate sulfur reallocation by hydrolyzing particular GL species, conferring sulfur deficiency tolerance in A. thaliana, especially during early development. The results delineate the physiological function of GL as a sulfur reservoir, in addition to their well-known functions as defense chemicals. Overall, our findings demonstrate the bidirectional interaction between primary and specialized metabolism, which enhances our understanding of the underlying metabolic mechanisms via which plants adapt to their environments.

DOI： 10.1073/pnas.2017890118

PubMed
Global analysis of boron‐induced ribosome stalling reveals its effects on translation termination and unique regulation by AUG‐stops in Arabidopsis shoots 査読

Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Kyoko Miwa, Seidai Takamatsu, Mayuki Tanaka, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

The Plant Journal 106 ( 5 ) 1455 - 1467 2021年04月（ ISSN:0960-7412 ）（ eISSN:1365-313X ）

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

SUMMARY

We previously reported that ribosome stalling at AUG‐stop sequences in the 5′‐untranslated region plays a critical role in regulating the expression of Arabidopsis thaliana NIP5;1, which encodes a boron uptake transporter, in response to boron conditions in media. This ribosome stalling is triggered specifically by boric acid, but the mechanisms are unknown. Although upstream open reading frames (uORFs) are known in many cases to regulate translation through peptides encoded by the uORF, AUG‐stop stalling does not involve any peptide synthesis. The unique feature of AUG‐stops – that termination follows immediately after initiation – suggests a possible effect of boron on the translational process itself. However, the generality of AUG‐stop‐mediated translational regulation and the effect of boron on translation at the genome scale are not clear. Here, we conducted a ribosome profiling analysis to reveal the genome‐wide regulation of translation in response to boron conditions in A. thaliana shoots. We identified hundreds of translationally regulated genes that function in various biological processes. Under high‐boron conditions, transcripts with reduced translation efficiency were rich in uORFs, highlighting the importance of uORF‐mediated translational regulation. We found 673 uORFs that had more frequent ribosome association. Moreover, transcripts that were translationally downregulated under high‐boron conditions were rich in minimum uORFs (AUG‐stops), suggesting that AUG‐stops play a global role in the boron response. Metagene analysis revealed that boron increased the ribosome occupancy of stop codons, indicating that this element is involved in global translational termination processes.

DOI： 10.1111/tpj.15248

PubMed

その他URL： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/tpj.15248
Targeted permeabilization of the cell wall and extraction of charged molecules from single cells in intact plant clusters using a focused electric field 査読

Sangamithirai Subramanian Parimalam, Mahmoud Nady Abdelmoez, Arata Tsuchida, Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka, Takashi Kuromori, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Ryuji Yokokawa, Yusuke Oguchi, Hirofumi Shintaku

The Analyst 146 ( 5 ) 1604 - 1611 2021年02月（ ISSN:0003-2654 ）（ eISSN:1364-5528 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Selective and direct extraction of charged molecules from single cells of intact plant clusters using a focused electric field.

DOI： 10.1039/d0an02163f
Involvement of boron transporter BOR1 in growth under low‐boron and high‐nitrate conditions in Arabidopsis thaliana 査読

Qing Wang, Wenna Zhang, Hua Xiao, Naoyuki Sotta, Marcel Pascal Beier, Junpei Takano, Kyoko Miwa, Lihong Gao, Toru Fujiwara

Physiologia Plantarum 171 ( 4 ) 703 - 713 2020年10月（ ISSN:1399-3054 ）（ eISSN:1399-3054 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/ppl.13249

その他URL： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/ppl.13249
An SMU Splicing Factor Complex Within Nuclear Speckles Contributes to Magnesium Homeostasis in Arabidopsis thaliana 査読

Zhihang Feng, Hiroshi Nagao, Baohai Li, Naoyuki Sotta, Yusuke Shikanai, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara

Plant Physiology 184 ( 1 ) 2020年06月（ ISSN:0032-0889 ）（ eISSN:1532-2548 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1104/pp.20.00109
Extraction of RNA from an intact single plant cell with cell wall using focused electric field

Sangamithirai Subramanian Parimalam, Naoyuki Sotta, Takashi Kuromori, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Hirofumi Shintaku

MHS 2019 - 30th 2019 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science 2019年12月

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掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）

DOI： 10.1109/MHS48134.2019.9249352
Abnormal leaf development of rpt5a mutant under zinc deficiency reveals important role of DNA damage alleviation for normal leaf development 査読

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Sachihiro Matsunaga, Toru Fujiwara

Scientific Reports 9 ( 1 ) 2019年06月（ ISSN:2045-2322 ）（ eISSN:2045-2322 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Abstract

Leaf development in plants, including dorsoventral (adaxial–abaxial) patterning, is tightly regulated. The involvement of several subunits of the 26S proteasome in adaxial–abaxial polarity establishment has been reported. In the present study, we revealed that in Arabidopsis thaliana, a mutation in RPT5A, a subunit of 26S proteasome, causes abnormally narrow true leaves under zinc deficiency. mRNA accumulations of DNA damage marker genes in leaves were elevated by zinc deficiency. PARP2, a single-strand break (SSB) inducible gene, was more strongly induced by zinc deficiency in rpt5a mutants compared with the wild type. A comet assay indicated that SSB is enhanced in mutants grown under the zinc deficiency condition. These results suggest that SSB accumulation is accompanied by abnormal leaf development. To test if DNA damage is a sole cause of abnormal leaf development, we treated the wild type grown under normal zinc conditions with zeocin, a DNA damage-inducing reagent, and found that narrow leaves developed, suggesting that DNA damage is sufficient to induce the development of abnormally narrow leaves. Taken together with the observation of the abnormal leaf morphology of our mutant plant under zinc deficiency, we demonstrated that the alleviation of DNA damage is important for normal leaf development.

DOI： 10.1038/s41598-019-44789-w

その他URL： https://www.nature.com/articles/s41598-019-44789-w
The 26S Proteasome Is Required for the Maintenance of Root Apical Meristem by Modulating Auxin and Cytokinin Responses Under High-Boron Stress 査読

Takuya Sakamoto, Naoyuki Sotta, Takamasa Suzuki, Toru Fujiwara, Sachihiro Matsunaga

Frontiers in Plant Science 10 2019年05月（ ISSN:1664-462X ）（ eISSN:1664-462X ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2019.00590

PubMed
Local boron concentrations in tuberous roots of Japanese radish (Raphanus sativus L.) negatively correlate with distribution of brown heart

Naoyuki Sotta, Bian Bian, Danhan Peng, Phattharawan Hongkham, Takehiro Kamiya, Satoshi Niikura, Toru Fujiwara

Plant Physiology and Biochemistry 136 58 - 66 2019年03月（ ISSN:0981-9428 ）

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担当区分：筆頭著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.plaphy.2018.12.027
Proteasomal degradation of BRAHMA promotes Boron tolerance in Arabidopsis 査読

Takuya Sakamoto, Yayoi Tsujimoto-Inui, Naoyuki Sotta, Takeshi Hirakawa, Tomoko M. Matsunaga, Yoichiro Fukao, Sachihiro Matsunaga, Toru Fujiwara

Nature Communications 9 ( 1 ) 2018年12月（ eISSN:2041-1723 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Abstract

High levels of boron (B) induce DNA double-strand breaks (DSBs) in eukaryotes, including plants. Here we show a molecular pathway of high B-induced DSBs by characterizing Arabidopsis thaliana hypersensitive to excess boron mutants. Molecular analysis of the mutants revealed that degradation of a SWItch/Sucrose Non-Fermentable subunit, BRAHMA (BRM), by a 26S proteasome (26SP) with specific subunits is a key process for ameliorating high-B-induced DSBs. We also found that high-B treatment induces histone hyperacetylation, which increases susceptibility to DSBs. BRM binds to acetylated histone residues and opens chromatin. Accordingly, we propose that the 26SP limits chromatin opening by BRM in conjunction with histone hyperacetylation to maintain chromatin stability and avoid DSB formation under high-B conditions. Interestingly, a positive correlation between the extent of histone acetylation and DSB formation is evident in human cultured cells, suggesting that the mechanism of DSB induction is also valid in animals.

DOI： 10.1038/s41467-018-07393-6

その他URL： https://www.nature.com/articles/s41467-018-07393-6
Preparing thin cross sections of Arabidopsis roots without embedding 査読

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

BIOTECHNIQUES 63 ( 6 ) 281 - 283 2017年12月（ ISSN:0736-6205 ）（ eISSN:1940-9818 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2144/000114621
Rapid transporter regulation prevents substrate flow traffic jams in boron transport 査読

Naoyuki Sotta, Susan Duncan, Mayuki Tanaka, Takafumi Sato, Athanasius F. M. Maree, Toru Fujiwara, Veronica A. Grieneisen

ELIFE 6 2017年09月（ ISSN:2050-084X ）

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担当区分：筆頭著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.7554/eLife.27038.001

PubMed
The Minimum Open Reading Frame, AUG-Stop, Induces Boron-Dependent Ribosome Stalling and mRNA Degradation. 査読

Mayuki Tanaka, Naoyuki Sotta, Yusuke Yamazumi, Yui Yamashita, Kyoko Miwa, Katsunori Murota, Yukako Chiba, Masami Yokota Hirai, Tetsu Akiyama, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

The Plant cell 28 ( 11 ) 2830 - 2849 2016年11月（ eISSN:1532-298X ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）国際・国内誌：国際誌

Upstream open reading frames (uORFs) are often translated ahead of the main ORF of a gene and regulate gene expression, sometimes in a condition-dependent manner, but such a role for the minimum uORF (hereafter referred to as AUG-stop) in living organisms is currently unclear. Here, we show that AUG-stop plays an important role in the boron (B)-dependent regulation of NIP5;1, encoding a boric acid channel required for normal growth under low B conditions in Arabidopsis thaliana High B enhanced ribosome stalling at AUG-stop, which was accompanied by the suppression of translation and mRNA degradation. This mRNA degradation was promoted by an upstream conserved sequence present near the 5'-edge of the stalled ribosome. Once ribosomes translate a uORF, reinitiation of translation must take place in order for the downstream ORF to be translated. Our results suggest that reinitiation of translation at the downstream NIP5;1 ORF is enhanced under low B conditions. A genome-wide analysis identified two additional B-responsive genes, SKU5 and the transcription factor gene ABS/NGAL1, which were regulated by B-dependent ribosome stalling through AUG-stop. This regulation was reproduced in both plant and animal transient expression and cell-free translation systems. These findings suggest that B-dependent AUG-stop-mediated regulation is common in eukaryotes.

DOI： 10.1105/tpc.16.00481

PubMed
Identification of introgression lines of Oryza glaberrima Steud. with high mineral content in grains 査読

Yoshihiro Ohmori, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION 62 ( 5-6 ) 456 - 464 2016年10月（ ISSN:0038-0768 ）（ eISSN:1747-0765 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1080/00380768.2016.1204896
TPR5 is involved in directional cell division and is essential for the maintenance of meristem cell organization in Arabidopsis thaliana 査読

Naoyuki Sotta, Lukram Shantikumar, Takuya Sakamoto, Sachihiro Matsunaga, Toru Fujiwara

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 67 ( 8 ) 2401 - 2411 2016年04月（ ISSN:0022-0957 ）（ eISSN:1460-2431 ）

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担当区分：筆頭著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/erw043
An Arabidopsis thaliana copper-sensitive mutant suggests a role of phytosulfokine in ethylene production 査読

Tao Wu, Takehiro Kamiya, Hiroko Yumoto, Naoyuki Sotta, Yamaguchi Katsushi, Shuji Shigenobu, Yoshikatsu Matsubayashi, Toru Fujiwara

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 66 ( 13 ) 3657 - 3667 2015年07月（ ISSN:0022-0957 ）（ eISSN:1460-2431 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/erv105
Mathematical Modeling and Experimental Validation of the Spatial Distribution of Boron in the Root of Arabidopsis thaliana Identify High Boron Accumulation in the Tip and Predict a Distinct Root Tip Uptake Function 査読

Akie Shimotohno, Naoyuki Sotta, Takafumi Sato, Micol De Ruvo, Athanasius F. M. Maree, Veronica A. Grieneisen, Toru Fujiwara

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 56 ( 4 ) 620 - 630 2015年04月（ ISSN:0032-0781 ）（ eISSN:1471-9053 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/pcp/pcv016
Ribosomes in a Stacked Array 査読

Yui Yamashita, Yoshitomo Kadokura, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Ichigaku Takigawa, Akiko Satake, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 289 ( 18 ) 12693 - 12704 2014年05月（ ISSN:0021-9258 ）（ eISSN:1083-351X ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1074/jbc.M113.526616
Difference in cesium accumulation among rice cultivars grown in the paddy field in Fukushima Prefecture in 2011 and 2012 査読

Yoshihiro Ohmori, Yayoi Inui, Masataka Kajikawa, Atsumi Nakata, Naoyuki Sotta, Koji Kasai, Shimpei Uraguchi, Nobuhiro Tanaka, Sho Nishida, Takahiro Hasegawa, Takuya Sakamoto, Yuko Kawara, Kayoko Aizawa, Haruka Fujita, Ke Li, Naoya Sawaki, Koshiro Oda, Ryuichiro Futagoishi, Takahiro Tsusaka, Satomi Takahashi, Junpei Takano, Shinji Wakuta, Akira Yoshinari, Masataka Uehara, Shigeki Takada, Hayato Nagano, Kyoko Miwa, Izumi Aibara, Takuya Ojima, Kaoru Ebana, Satoru Ishikawa, Kuni Sueyoshi, Hiroshi Hasegawa, Tetsuro Mimura, Mari Mimura, Natsuko I. Kobayashi, Jun Furukawa, Daisuke Kobayashi, Toshiyasu Okouchi, Keitaro Tanoi, Toru Fujiwara

JOURNAL OF PLANT RESEARCH 127 ( 1 ) 57 - 66 2014年01月（ ISSN:0918-9440 ）（ eISSN:1618-0860 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10265-013-0616-9
Differential Expression of Three BOR1 Genes Corresponding to Different Genomes in Response to Boron Conditions in Hexaploid Wheat (Triticum aestivum L.) 査読

Sumana Leaungthitikanchana, Takahiro Fujibe, Mayuki Tanaka, Sheliang Wang, Naoyuki Sotta, Junpei Takano, Toru Fujiwara

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 54 ( 7 ) 1056 - 1063 2013年07月（ ISSN:0032-0781 ）（ eISSN:1471-9053 ）

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/pcp/pct059

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MISC（その他記事）

オミックス技術が切り開く土壌肥料学 8. Translatome: ribosome profilingによる遺伝子翻訳の網羅解析招待査読

反田直之

日本土壌肥料学雑誌 95 ( 2 ) 96 - 101 2024年04月

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担当区分：筆頭著者,　最終著者,　責任著者掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

DOI： 10.20710/dojo.95.2_96
苔類ゼニゴケの細胞膜H+-ATPaseによる形態形成制御の分子機構解析

水谷未耶, 水谷未耶, 中根功太郎, 奥村将樹, 楊為雄, 田中周, 井上普一郎, 藤原徹, 神谷岳洋, 反田直之, 西浜竜一, 石崎公庸, 木下俊則, 木下俊則

日本植物生理学会年会(Web) 65th 2024年

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J-GLOBAL
条件的寄生植物コシオガマの寄生時および非寄生時における無機養分獲得経路

徳本勇闘, 稲葉尚子, 反田直之, 神谷岳洋, 矢内純太, 藤原徹, 吉田聡子

日本植物生理学会年会(Web) 65th 2024年

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J-GLOBAL
植物の微量元素ホウ素必須性の発見から100年，広がるホウ素の理解招待査読

反田直之, 田中真幸

化学と生物 61 ( 7 ) 345 - 351 2023年07月

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担当区分：筆頭著者掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.61.345
2022年度日本土壌肥料学会若手の会in東京開催報告招待

反田直之, 増田曜子

日本土壌肥料学雑誌 94 ( 1 ) 80 - 80 2023年02月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：会議報告等

DOI： 10.20710/dojo.94.1_80
最小のオープンリーディングフレームである「AUG-stop」を介した新規な遺伝子発現制御機構の発見細胞質ホウ素による輸送体mRNAの分解制御査読

田中真幸, 反田直之, 内藤哲, 藤原徹

化学と生物 56 ( 2 ) 64 - 66 2018年01月（ ISSN:0453-073X ）（ eISSN:1883-6852 ）

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DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.56.64

CiNii Research
P4-1-12 ハイパースペクトルカメラを用いた植物の栄養診断（ポスター，4-1 植物の多量栄養素，2018年度神奈川大会）

神谷岳洋, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 64 ( 0 ) 56 - 56 2018年（ ISSN:0288-5840 ）

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DOI： 10.20710/dohikouen.64.0_56_3

CiNii Research
シロイヌナズナのホウ素輸送体NIP5;1におけるAUGUAA配列を介したホウ素依存的なmRNA分解に伴った転写制御機構の可能性

田中真幸, DUNCAN Susan, 反田直之, 千葉由佳子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 内藤哲, MAREE Stan, GRIENEISEN Veronica, 藤原徹

日本植物生理学会年会(Web) 59th 2018年

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J-GLOBAL
シロイヌナズナのリボソームタンパク質遺伝子の特定パラログの破壊が栄養条件に対する応答を変化させる

福田寛史, 反田直之, 田中真幸, 千葉由佳子, 三輪京子, 内藤哲, 藤原徹

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年

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J-GLOBAL
植物の栄養条件に応じた翻訳調節の網羅解析

反田直之, 千葉由佳子, 高松世大, 三輪京子, 山下由衣, 内藤哲, 藤原徹

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年

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J-GLOBAL
4-1-7 ハイパースペクトルカメラを用いた元素動態の可視化技術の確立（4-1 植物の多量栄養素，2017年度仙台大会）

神谷岳洋, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 63 ( 0 ) 48 - 48 2017年（ ISSN:0288-5840 ）

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DOI： 10.20710/dohikouen.63.0_48_1

CiNii Research
Boron-dependent degradation of NIP5;1 mRNA through AUGUAA sequences, in the 5 ' UTR in Arabidopsis thaliana

Mayuki Tanaka, Naoyuki Sotta, Kyoko Miwa, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

GENES & GENETIC SYSTEMS 91 ( 6 ) 329 - 329 2016年12月（ ISSN:1341-7568 ）（ eISSN:1880-5779 ）

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掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
シロイヌナズナのホウ素輸送体NIP5;1mRNAの5’UTRに存在するAUGUAA配列を介したホウ素依存的mRNA分解

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 88th 2016年

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J-GLOBAL
P4-2-5 シロイヌナズナTPR5は根の正常な細胞分裂に必須である(ポスター,4-2 植物の微量栄養素,2015年度京都大会)

反田直之, Shantikumar Lukram, 坂本卓也, 松永幸大, 藤原徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 ( 61 ) 71 - 71 2015年09月（ ISSN:0288-5840 ）

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CiNii Research
P4-2-3 シロイヌナズナのホウ素輸送体、NIP5;1のホウ素に応答したmRNA蓄積の制御機構の解析(ポスター,4-2 植物の微量栄養素,2015年度京都大会)

田中真幸, 反田直之, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 ( 61 ) 70 - 70 2015年09月（ ISSN:0288-5840 ）

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CiNii Research
シロイヌナズナにおける最小uORFを介したホウ素依存的なリボソーム停滞によるmRNA分解・翻訳効率の制御機構

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 山下由衣, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本植物生理学会年会要旨集 56th 2015年

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J-GLOBAL
シロイヌナズナホウ素輸送体,NIP5;1のホウ素に応答したmRNA分解と転写速度の協調的な制御機構の解析

田中真幸, 反田直之, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本RNA学会年会要旨集 17th 2015年

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J-GLOBAL
最小uORFを介したホウ素依存的なリボソーム停滞と共役したmRNA分解の解析

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本RNA学会年会要旨集 17th 2015年

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J-GLOBAL
節に発現するOsLCT1がイネ玄米へのカドミウム輸送を多段階的に制御する

浦口晋平, 浦口晋平, 鈴井伸郎, 反田直之, 尹永根, 石井里美, 河地有木, 藤巻秀, 藤原徹

トランスポーター研究会年会抄録集 10th 2015年

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J-GLOBAL
4-2-5 野生イネイントログレッション系統を用いた玄米中元素濃度に関する遺伝資源の探索(4-2 植物の微量栄養素,2014年度東京大会)

大森良弘, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 ( 60 ) 62 - 62 2014年09月（ ISSN:0288-5840 ）

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CiNii Research
最小uORF上でのホウ素依存的なリボソーム停滞を介した遺伝子発現制御

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本RNA学会年会要旨集 16th 2014年

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J-GLOBAL
P4-2-3 転写因子NAC103の変異がホウ素過剰障害におけるDNA損傷を軽減する(ポスター,4-2 植物の微量栄養素,2014年度東京大会)

反田直之, 藤原徹, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田建志, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司

日本土壌肥料学会講演要旨集 60 ( 0 ) 65 - 65 2014年（ ISSN:0288-5840 ）

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DOI： 10.20710/dohikouen.60.0_65_2

CiNii Research
P10-16 19SプロテアソームサブユニットRPT5a欠損によるシロイヌナズナのホウ素感受性の遺伝学的解析(10.植物の微量栄養素,2012年度鳥取大会)

反田直之, 藤原徹, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田昌史, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司

日本土壌肥料学会講演要旨集 58 ( 0 ) 72 - 72 2012年（ ISSN:0288-5840 ）

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DOI： 10.20710/dohikouen.58.0_72_1

CiNii Research

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講演・口頭発表等

根毛の表現型の定量評価法の簡便化

反田直之

日本土壌肥料学会 2025年度新潟大会 2025年09月

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会議種別：ポスター発表
GENOME-WIDE ANALYSIS OF TRANSLATIONAL RESPONSE OF ARABIDOPSIS THALIANA TO SULFUR DEFICIENCY

Naoyuki Sotta, Hirofumi Fukuda, Haruka Aoyama, Yukako Chiba, Toru Fujiwara

XX International Plant Nutrition Colloquium (IPNC) 2025 2025年07月

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会議種別：ポスター発表
COMPREHENSIVE UNDERSTANDING OF THE MECHANISMS OF NUTRIENT UPTAKE REGULATION: STARTING FROM RIBOSOMAL SENSING OF CYTOSOLIC NUTRIENTS LEADING TO TRANSLATIONAL AND TRANSCRIPTIONAL REGULATION

Toru Fujiwara, Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka

XX International Plant Nutrition Colloquium (IPNC) 2025 2025年07月

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会議種別：口頭発表（一般）
植物の毛状突起へのホウ素蓄積とその意義

反田直之

第4回生命金属科学シンポジウム 2025年05月

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
ホウ素が植物の食害応答に与える影響と仕組み

岩倉日那多, 反田直之

第4回生命金属科学シンポジウム 2025年05月

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会議種別：ポスター発表
ホウ酸バイオセンサーの確立とシロイヌナズナ根におけるホウ酸分布の推定

村上晴紀, Muthuvel Jothi, 室啓太, 反田直之, 高野順平

第4回生命金属科学シンポジウム 2025年05月

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会議種別：ポスター発表
プロモーター交換によるホウ酸トランスポーターBOR1とBOR2の生理機能の解明

鈴木星, 反田直之

第4回生命金属科学シンポジウム 2025年05月

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会議種別：ポスター発表
Analysis of root system architecture under heterogeneous nutrient conditions using hydrogel-based transparent soil system

第66回日本植物生理学会年会 2025年03月

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会議種別：口頭発表（一般）
硫黄欠乏におけるシロイヌナズナの翻訳応答の網羅解析

反田直之, 福田寛史, 青山悠, 千葉由佳子, 藤原徹

第12回植物RNA研究者ネットワークシンポジウム 2024年12月

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会議種別：口頭発表（一般）
Boron treatment increases plant defense against insect herbivores

Naoyuki Sotta

植物の栄養研究会第 9 回研究交流会 2024年09月

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会議種別：ポスター発表
Boron treatment increases plant defense against insect herbivores

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

Plant Biology 2024 2024年06月

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会議種別：ポスター発表
Non-destructive observation of root system architecture under heterogeneous nutrient conditions

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

Taiwan-Japan Plant Biology 2023 2023年10月

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会議種別：ポスター発表
The effect of boron on plant defense against insect herbivores

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

International Conference on 100 Years of Results on Boron Research in Plants 2023年09月

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会議種別：口頭発表（一般）
植物の食害防御におけるホウ素の役割

反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会2022年度東京大会 2023年09月

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会議種別：ポスター発表
シロイヌナズナにおけるホウ素輸送体 NIP5:1のホウ素に応答した mRNA 分解に関与する遺伝子の同定

田中真幸, Saul Sotomayor, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会 2023年09月

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会議種別：ポスター発表
ホウ素施用による作物の食害抵抗性向上の検証

反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会 2023年09月

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会議種別：ポスター発表
数理モデルによる細胞レベルでの代謝ロジスティクスの推定 -ホウ素- 招待

反田直之

日本植物学会第87回大会 2023年09月

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
不均一な栄養条件下で根系を観察するための植物栽培装置の開発

第64回日本植物生理学会年会 2023年03月

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会議種別：ポスター発表
Identification of genes involved in boron-dependent mRNA degradation of the boron transporter NIP5:1 in Arabidosis thaliana

Mayuki Tanaka, Sotomayor Leyton Saul, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

第64回日本植物生理学会年会 2023年03月

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会議種別：ポスター発表
Arabidopsis thaliana RPL13aC regulates root system architecture through shoot potassium accumulation

Dichao Ma, Hirofumi Fukuda, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

第64回日本植物生理学会年会 2023年03月

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会議種別：口頭発表（一般）
リボソームタンパクuL13はシロイヌナズナの地上部でみられるホウ素栄養に応じた翻訳制御に関与する

福田寛史, 反田直之, 田中真幸, 千葉由佳子, 三輪京子, 山下由衣, 山悠, 内藤哲, 藤原徹

第64回日本植物生理学会年会 2023年03月

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会議種別：ポスター発表
Quantitative analysis of the feeding behavior of herbivorous insects on Arabidopsis leaves reveals detailed mechanisms of trichomes contribution to plant defense.

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

The 33rd International Conference on Arabidopsis Research 2023年

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会議種別：ポスター発表
ホウ素とその輸送体の組織特異的蓄積の意義

反田直之

植物の栄養研究会・AgTechセミナー合同meeting 2022年12月

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会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
ホウ素輸送体 NIP5:1のホウ素濃度依存的な翻訳制御に関与する遺伝子の同定

田中真幸, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会2022年度東京大会 2022年09月

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会議種別：ポスター発表
不均一なホウ素供給に対する根系の応答

反田直之, 藤原徹

第63回日本植物生理学会年会 2022年03月

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会議種別：ポスター発表
トライコームと非根毛細胞に特異的に発現するホウ素輸送体の役割

反田直之, 三輪京子, 高野順平, 藤原徹

日本土壌肥料学会2021年度北海道大会 2021年09月

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会議種別：ポスター発表
Involvement of boron transporter BOR1 in growth under low boron and high nitrate condition in Arabidopsis thaliana

Qing Wang, Wenna Zhang, Hua Xiao, Naoyuki Sotta, Marcel Pascal Beier, Junpei Takano, Kyoko Miwa, Lihong Gao, Toru Fujiwara

第61回日本植物生理学会年会 2020年03月

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会議種別：ポスター発表
Global analysis of nutrient-dependent translational regulation

Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Hirofumi Fukuda, Kyoko Miwa, Seidai Takamatsu, Mayuki Tanaka, Yui Yamashita, Hirai Y Masami, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

第61回日本植物生理学会年会 2020年03月

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会議種別：口頭発表（一般）
Translatome profiling of methionine biosynthesis regulation in plants 国際会議

Naoyuki Sotta, Miku Fujita, Seidai Takamatsu, Hitoshi Onouchi, Yukako Chiba, Toru Fujiwara, Satoshi Naito, Yui Yamashita

TRANSLATIONAL CONTROL 2020年 Cold Spring Harbor Laboratory

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会議種別：ポスター発表

開催地：New York(virtual)
Function of non-root hair cells in boron transport system in plants 国内会議

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Veronica A. Grieneisen, Athanasius F. M. Maree

日本土壌肥料学会 2020年度岡山大会 2020年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：岡山(virtual)
AUGUAA配列を介したNIP5;1 mRNAのホウ素依存的翻訳制御に関与するシロイヌナズナ遺伝子の同定国内会議

田中真幸, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2020年度岡山大会 2020年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：岡山(virtual)
Mutation of uL13 paralogs of ribosomal protein alters adaptation to low boron stress in Arabidopsis thaliana 国際会議

Hirofumi Fukuda, Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka, Kyoko Miwa, Toru Fujiwara

TRANSLATIONAL CONTROL 2020年 Cold Spring Harbor Laboratory

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会議種別：ポスター発表

開催地：New York(virtual)
リボソームタンパクuL13パラログの変異がシロイヌナズナの低ホウ素環境に対する応答を変化させる国内会議

福田寛史, 反田直之, 田中真幸, 三輪京子, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2019年度静岡大会 2019年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：静岡
Genome-wide analysis of nitrogen-dependent translational regulation in sorghum 国際会議

Hirofumi Fukuda, Yukako Chiba, Naoyuki Sotta, Kyoko Miwa, Seidai Takamatsu, Mayuki Tanaka, Yui Yamashita, Hirai Masami, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

EMBO Workshop: Protein Synthesis and Translational Control 2019年 EMBO

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会議種別：ポスター発表

開催地：Germany
Genome-wide analysis of boron-dependent translational regulation in plants 国際会議

Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Kyoko Miwa, Seidai Takamatsu, Mayuki Tanaka, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

EMBO Workshop: Protein Synthesis and Translational Control 2019年 EMBO

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会議種別：ポスター発表

開催地：Germany
Mineral nutrient-dependent translational regulation in Arabidopsis thaliana 国際会議

Toru Fujiwara, Mayuki Tanaka, Izumi Aibara, Naoyuki Sotta, Yui Yamashita, Seidai Takamatsu, Yukako Chiba, Kyoko Miwa, Satoshi Naito

Ribosome 2019 2019年 The RNA Society

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会議種別：ポスター発表

開催地：Mexico
The possibility of coordinated regulation of transcriptional regulation and mRNA degradation of?NIP5;1 in response to boron conditions in Arabidopsis thaliana 国内会議

Mayuki Tanaka, Susan Duncan, Naoyuki Sotta, Satoshi Naito, Stan Maree, Veronica A. Grieneisen, Toru Fujiwara

日本土壌肥料学会 2019年度静岡大会 2019年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：静岡
シロイヌナズナにおけるホウ酸トランスポーターBOR5の機能解析（２）国内会議

川田ゆかり, 反田直之, 三輪京子, サキブムハンマド, 高田茂樹, 高野順平, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2019年度静岡大会 2019年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：静岡
シロイヌナズナのホウ素輸送体NIP5; 1 における転写調節は，mRNA分解と協調した制御である国内会議

田中真幸, 反田直之, 内藤哲, 藤原徹

第60回日本植物生理学会年会 2019年日本植物生理学会

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会議種別：口頭発表（一般）

開催地：名古屋
シロイヌナズナのリボソームタンパク質の変異が栄養ストレスに対する応答を変化させる国内会議

福田寛史, 反田直之, 田中真幸, 高松世大, 千葉由佳子, 三輪京子, 内藤哲, 藤原徹

第60回日本植物生理学会年会 2019年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：名古屋
リボソームタンパクパラログによる植物のホウ素栄養応答の可能性国内会議

福田寛史, 反田直之, 田中真幸, 千葉由佳子, 三輪京子, 内藤哲, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2018年度神奈川大会 2018年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：神奈川
Analysis of ribosome mediated regulation of gene expression under excess boron conditions in yeast 国内会議

Munkhtsetseg Tsednee, Mayuki Tanaka, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara

第59 回日本植物生理学会年会 2018年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：札幌
A 26S proteasome subunit RPT5A is essential for normal leaf development under zinc deficiency 国内会議

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Sachihiro Matsunaga, Toru Fujiwara

第59 回日本植物生理学会年会 2018年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：札幌
The role of translational regulation in gene expression in response to nitrogen nutrition in Sorghum bicholor. 国内会議

福田寛史, 田中真幸, 反田直之, 山下由依, 三輪京子, 千葉由佳子, 内藤哲, 藤原徹

第59 回日本植物生理学会年会 2018年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：札幌
シロイヌナズナにおけるホウ酸トランスポーターBOR5の機能の研究国内会議

川田ゆかり, 反田直之, 三輪京子, サキブムハンマド, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2018年度神奈川大会 2018年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：神奈川
シロイヌナズナホウ酸輸送体BOR3の機能解析と、非極性局在トランスポーターによる極性輸送の可能性の検証国内会議

反田直之, 高田茂樹, 川田ゆかり, 三輪京子, 高野順平, Veronica A. Grieneisen、Athanasius, F.M. Maree, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2018年度神奈川大会 2018年日本土壌肥料学会

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会議種別：口頭発表（一般）

開催地：神奈川
ハイパースペクトルカメラを用いた植物の栄養診断国内会議

神谷岳洋, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2018年度神奈川大会 2018年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：神奈川
ハイパースペクトルカメラを用いた元素動態の可視化技術の確立国内会議

神谷岳洋, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2017年度仙台大会 2017年日本土壌肥料学会

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会議種別：口頭発表（一般）

開催地：仙台
Cell layer specific expression of boron transporter in Arabidopsis roots 国内会議

Makiha Fukuda, Akie Shimotono, Naoyuki Sotta, Junpei Takano, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara

第58 回日本植物生理学会年会 2017年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：鹿児島
A possible involvement of AUGUAA in the 5’-UTR of NIP5;1 in transcriptional regulation 国内会議

Mayuki Tanaka, Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

第58 回日本植物生理学会年会 2017年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：鹿児島
NADPH oxidase RBOHC is responsible for root growth inhibition caused by excess B stress in Arabidopsis thaliana 国内会議

Naoyuki Sotta, Masami Y. Hirai, Toru Fujiwara

第58 回日本植物生理学会年会 2017年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：鹿児島
ダイコン赤芯症の画像解析による定量的評価国内会議

反田直之, 新倉聡, 藤原徹

定量生物学の会第8回年会 2017年定量生物学の会

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会議種別：ポスター発表

開催地：岡崎
根における安定したホウ素吸収には輸送体の素早い環境応答が重要である国内会議

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Athanasius F.M. Maree, Veronica A. Grieneisen

第57回日本植物生理学会年会 2016年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：盛岡
Exploring cell-layer specific roles of boron transporters in Arabidopsis roots 国内会議

福田牧葉, 下遠野明恵, 反田直之, 笠井光治, 神谷岳洋, 藤原徹

第57回日本植物生理学会年会 2016年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：盛岡
Mechanisms of excess boron toxicity on root growth 国際会議

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Takehiro Kamiya, Shinichiro Sawa, Ryo Tabata, Masashi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Masami Yokota Hirai, Toru Fujiwara

The 27th International Conference on Arabidopsis Research 2016年 ICAR

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会議種別：ポスター発表

開催地：Korea
ホウ素輸送体NIP5;1における最小uORFを介したホウ素依存的なリボソーム停滞と共役したmRNA分解機構に必須な配列の解析国内会議

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

第57回日本植物生理学会年会 2016年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：盛岡
土壌栄養環境は植物の進化を加速するか国内会議

反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2016年度京都大会 2016年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：佐賀
植物における栄養輸送体の栄養環境応答のモデルと顕微鏡画像定量によるパラメータ推定国内会議

反田直之, 和久田真司, 高野順平, Athanasius F.M. Maree, Veronica A. Grieneisen, 藤原徹

定量生物学の会第７回年会 2015年定量生物学の会

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会議種別：ポスター発表

開催地：福岡
Analysis of low magnesium sensitive mutants of Arabidopsis thaliana 国内会議

Hiroshi Nagao, Zhihang Feng, Naoyuki Sotta, Sho Nishida, Takehiro Kamiya, Toru Fujwiara

第56回日本植物生理学会年会 2015年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：東京
A mutation in NAC103 suppresses ROS accumulation in root tips caused by excess boron stress 国際会議

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Takehiro Kamiya, Shinichiro Sawa, Ryo Tabata, Masashi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Toru Fujiwara

The 26th International Conference on Arabidopsis Research 2015年 ICAR

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会議種別：口頭発表（一般）

開催地：France
A mutation in NAC103 alleviates DNA damage and ROS accumulation in root meristem of excess boron sensitive Arabidopsis mutant. 国内会議

Naoyuki Sotta, Takuya Sakamoto, Takehiro Kamiya, Shinichiro Sawa, Ryo Tabata, Masashi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Toru Fujiwara

第56回日本植物生理学会年会 2015年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：東京
Rapid regulation of nutrient transporters is crucial for preventing oscillations in the root system 国際会議

Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Athanasius F.M. Maree, Veronica A. Grieneisen

2015 Joint Meeting of The 5th China-Japan-Korea Colloquium on Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology 2015年 JSMB-CJK

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会議種別：ポスター発表

開催地：Kyoto
シロイヌナズナTPR5は根の正常な細胞分裂に必須である国内会議

反田直之, Lukram Shantikumar, 坂本卓也, 松永幸大, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2015年度京都大会 2015年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：京都
シロイヌナズナにおける最少uORFを介したホウ素依存的なリボソーム停滞によるmRNA分解・翻訳効率の制御機構国内会議

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 山下由衣, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

第56回日本植物生理学会年会 2015年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：東京
シロイヌナズナのホウ素輸送体、NIP5;1のホウ素に応答したmRNA蓄積の制御機構の解析国内会議

田中真幸, 反田直之, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2015年度京都大会 2015年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：京都
野生イネイントログレッション系統を用いた玄米中元素濃度に関する遺伝資源の探索国内会議

大森良弘, 反田直之, 藤原徹

日本土壌肥料学会2014年度東京大会 2014年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：東京
Function of NAC103 in boron toxicity in roots of Arabidopsis thaliana 国内会議

Sotta N, Sakamoto T, Kamiya T, Sawa S, Tabata R, Yamada M, Hasebe M, Shigenobu S, Yamaguchi K, Fujiwara T

第55回日本植物生理学会年会 2014年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：富山
Temporal regulation of a boric acid channel NIP5;1 mRNA accumulation in response to changes in boron conditions: mathematical consideration on the coordinated regulation through mRNA degradation and transcription 国際会議

Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka, Akiko Satake, Satoshi Naito, Yukako Chiba, Toru Fujiwara

Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology 2014年 JSMB-SMB

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会議種別：ポスター発表

開催地：Osaka
最小uORFでのホウ素遺伝的なリボソーム停滞を介した遺伝的発現制御国内会議

田中真幸, 反田直之, 三輪京子, 千葉由佳子, 尾之内均, 内藤哲, 藤原徹

第16回日本ＲＮＡ学会年会 2014年日本ＲＮＡ学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：名古屋
転写因子NAC103の変異がホウ素過剰障害におけるDNA損傷を軽減する国内会議

反田直之, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田昌史, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2014年度東京大会 2014年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：東京
シロイヌナズナのホウ酸チャネルのホウ酸環境に応答した転写・分解制御国内会議

反田直之, 田中真幸, 佐竹暁子, 藤原徹

定量生物学の会第6回年会 2013年定量生物学の会

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会議種別：ポスター発表

開催地：大阪
Arabidopsis thaliana revertants of excess boron sensitive mutant 国際会議

Sotta N, Sakamoto T, Kamiya T, Sawa S, Tabata R, Yamada M, Hasebe M, Shigenobu S, Yamaguchi K, Fujiwara T

Boron 2013 2013年 IPNC

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会議種別：ポスター発表

開催地：Turkey
Analysis of a root growth defective Arabidopsis mutant obtained from screen for boron deficiency sensitive mutants 国際会議

Sotta N, Sakamoto T, Fujiwara T

XVII INTERNATIONAL PLANT NUTRITION COLLOQUIUM 2013年 IPNC

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会議種別：ポスター発表

開催地：Turkey
Isolation and characterization of novel Arabidopsis mutants hypersensitive to excess boron 国際会議

Sakamoto T, Sotta N, Matsunaga S, Fujiwara T

Boron 2013 2013年 IPNC

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会議種別：ポスター発表

開催地：Turkey
シロイヌナズナのTPR5の根の伸長における役割国内会議

反田直之, 坂本卓也, 藤原徹

第54回日本植物生理学会年会 2013年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：岡山
ホウ素過剰超感受性シロイヌナズナ変異株の復帰変異体の解析によるホウ素耐性機構の研究国内会議

反田直之, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田昌史, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司, 藤原徹

第53回日本植物生理学会年会 2012年日本植物生理学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：京都
19S プロテアソームサブユニットRPT5a欠損によるシロイヌナズナのホウ素感受性の遺伝学的解析国内会議

反田直之, 坂本卓也, 神谷岳洋, 澤進一郎, 田畑亮, 山田昌史, 長谷部光泰, 重信秀治, 山口勝司, 藤原徹

日本土壌肥料学会 2012年鳥取大会 2012年日本土壌肥料学会

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会議種別：ポスター発表

開催地：鳥取
Translational responses to sulfur deficiency in sorghum

Naoyuki Sotta, Yukako Chiba, Haruka Aoyama, Seidai Takamatsu, Takamasa Suzuki, Kyoko Miwa, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Toru Fujiwara

EMBL Conference: Protein Synthesis and Translational Control

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会議種別：ポスター発表
Nutrient specific growth and translational regulation of ribosomal protein mutants of Arabidopsis thaliana illustrate diverse roles of heterogeneous ribosomes

Hirofumi Fukuda, Naoyuki Sotta, Dachao Ma, Li Shuying, Arpna Kumari, Mayuki, Tanaka, Yukako Chiba, Kyoko Miwa, Yui Yamashita, Satoshi Naito

EMBL Conference: Protein synthesis and translational control

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会議種別：ポスター発表

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科研費獲得実績

植物のホウ素過剰ストレス経験が子孫のホウ素過剰耐性を向上させる仕組みの解明

基盤研究(C) 2027年
植物のホウ素過剰ストレス経験が子孫のホウ素過剰耐性を向上させる仕組みの解明

基盤研究(C) 2026年
植物のホウ素過剰ストレス経験が子孫のホウ素過剰耐性を向上させる仕組みの解明

基盤研究(C) 2025年
植物の食害防御におけるホウ素の役割の検証

若手研究 2024年
不均一栄養環境における植物の根系構造・栄養状態変化の定量的・網羅的解析

学術変革領域研究(A) 2024年

担当授業科目

応用生物科学英語

2025年度集中講義大学
応用生物科学課題研究

2025年度集中講義大学
応用生物科学卒業研究

2025年度集中講義大学
植物科学英語

2025年度集中講義大学
植物バイオサイエンス演習

2025年度集中講義大学
植物バイオサイエンス卒業研究

2025年度集中講義大学
応用生物科学研究実験1B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験2B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学研究プレゼンテーション

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験1B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール1B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール2B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験2B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験3B

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験1A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験2A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験3A

2025年度集中講義大学院
植物生理生態学基礎実験

2025年度週間授業大学
応用生物科学ゼミナール1A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール2A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験1A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験2A

2025年度集中講義大学院
応用生物科学概論

2025年度週間授業大学
応用生物科学基礎実験A

2025年度週間授業大学
応用生物科学特別研究実験1B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験2B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験3B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール1B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール2B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験1B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験2B

2024年度集中講義大学院
応用生物科学研究プレゼンテーション

2024年度集中講義大学院
応用生物科学英語

2024年度集中講義大学
応用生物科学課題研究

2024年度集中講義大学
応用生物科学特別研究実験1A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験2A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学特別研究実験3A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール1A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学ゼミナール2A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験1A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学研究実験2A

2024年度集中講義大学院
応用生物科学概論

2024年度週間授業大学

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学外での担当授業科目

フィールドインフォマティクス

2021年06月

-

継続中
機関名：東京大学

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国名：日本国

ＦＤ活動

授業デザイン研修I 2025年度

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2024年度新任教員FD研修 2024年度

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